RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 SYNJ2O15056 1496 aa33.13■■■□□ 2.89
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SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.08■■■□□ 2.89
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SH3BP2-204ENST00000452765 MAP3K1Q13233 1512 aa32.23■■■□□ 2.75
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SH3BP2-204ENST00000452765 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.82■■■□□ 2.68
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SH3BP2-204ENST00000452765 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.59■■■□□ 2.65
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SH3BP2-204ENST00000452765 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.5■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 ASXL2Q76L83 1435 aa31.49■■■□□ 2.63
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SH3BP2-204ENST00000452765 MIA2Q96PC5 1412 aa31.49■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.46■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.45■■■□□ 2.632e-6■□□□□ 10.9
SH3BP2-204ENST00000452765 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
SH3BP2-204ENST00000452765 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.43■■■□□ 2.62
SH3BP2-204ENST00000452765 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.43■■■□□ 2.62
SH3BP2-204ENST00000452765 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.41■■■□□ 2.62
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