RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452236.2

ZBED9-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED9, Length 4,877 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9-201ENST00000452236 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.43■□□□□ 0.38
ZBED9-201ENST00000452236 GOLGA3Q08378 1498 aa17.41■□□□□ 0.38
ZBED9-201ENST00000452236 SLC24A1O60721 1099 aa17.41■□□□□ 0.38
ZBED9-201ENST00000452236 WIZO95785 1651 aa17.39■□□□□ 0.37
ZBED9-201ENST00000452236 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBED9-201ENST00000452236 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.34■□□□□ 0.37
ZBED9-201ENST00000452236 NEFMP07197 916 aa17.33■□□□□ 0.37
ZBED9-201ENST00000452236 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED9-201ENST00000452236 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
ZBED9-201ENST00000452236 GGT6Q6P531 493 aa17.31■□□□□ 0.36
ZBED9-201ENST00000452236 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.3■□□□□ 0.36
ZBED9-201ENST00000452236 PLEKHG5O94827 1062 aa17.29■□□□□ 0.36
ZBED9-201ENST00000452236 PTPRGP23470 1445 aa17.27■□□□□ 0.36
ZBED9-201ENST00000452236 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED9-201ENST00000452236 NESP48681 1621 aa17.26■□□□□ 0.35
ZBED9-201ENST00000452236 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.25■□□□□ 0.35
ZBED9-201ENST00000452236 HDGFP51858 240 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
ZBED9-201ENST00000452236 A0A0G2JS52 829 aa17.22■□□□□ 0.35
ZBED9-201ENST00000452236 NEFLP07196 543 aa17.21■□□□□ 0.35
ZBED9-201ENST00000452236 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.21■□□□□ 0.35
ZBED9-201ENST00000452236 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.2■□□□□ 0.34
ZBED9-201ENST00000452236 RGL3Q3MIN7 710 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED9-201ENST00000452236 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.19■□□□□ 0.34
ZBED9-201ENST00000452236 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
ZBED9-201ENST00000452236 TONSLQ96HA7 1378 aa17.17■□□□□ 0.34
ZBED9-201ENST00000452236 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
ZBED9-201ENST00000452236 CEP162Q5TB80 1403 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED9-201ENST00000452236 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED9-201ENST00000452236 KANK1Q14678 1352 aa17.16■□□□□ 0.34
ZBED9-201ENST00000452236 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ZBTB7CA1YPR0 619 aa17.14■□□□□ 0.33
ZBED9-201ENST00000452236 LMOD2Q6P5Q4 547 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED9-201ENST00000452236 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.13■□□□□ 0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
ZBED9-201ENST00000452236 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.12■□□□□ 0.33
ZBED9-201ENST00000452236 FMN1Q68DA7 1419 aa17.09■□□□□ 0.33
ZBED9-201ENST00000452236 IFT140Q96RY7 1462 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED9-201ENST00000452236 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
ZBED9-201ENST00000452236 CFTRP13569 1480 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED9-201ENST00000452236 KIF3BO15066 747 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED9-201ENST00000452236 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED9-201ENST00000452236 HMGXB3Q12766 1538 aa17.06■□□□□ 0.32
ZBED9-201ENST00000452236 GRIN2BQ13224 1484 aa17.05■□□□□ 0.32
ZBED9-201ENST00000452236 POGKQ9P215 609 aa17.05■□□□□ 0.32
ZBED9-201ENST00000452236 MYT1Q01538 1121 aa17.04■□□□□ 0.32
ZBED9-201ENST00000452236 EID1Q9Y6B2 187 aa17.01■□□□□ 0.31
ZBED9-201ENST00000452236 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ZBED9-201ENST00000452236 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa17■□□□□ 0.31
ZBED9-201ENST00000452236 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
ZBED9-201ENST00000452236 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.98■□□□□ 0.31
ZBED9-201ENST00000452236 TMC1Q8TDI8 760 aa16.98■□□□□ 0.31
ZBED9-201ENST00000452236 HRCP23327 699 aa16.97■□□□□ 0.31
ZBED9-201ENST00000452236 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.96■□□□□ 0.31
ZBED9-201ENST00000452236 ANP32CO43423 234 aa16.96■□□□□ 0.31
ZBED9-201ENST00000452236 IGF1RP08069 1367 aa16.95■□□□□ 0.3
ZBED9-201ENST00000452236 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
ZBED9-201ENST00000452236 TOPBP1Q92547 1522 aa16.89■□□□□ 0.29
ZBED9-201ENST00000452236 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.89■□□□□ 0.29
ZBED9-201ENST00000452236 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
ZBED9-201ENST00000452236 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.85■□□□□ 0.29
ZBED9-201ENST00000452236 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.83■□□□□ 0.29
ZBED9-201ENST00000452236 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.83■□□□□ 0.28
ZBED9-201ENST00000452236 CDCA8Q53HL2 280 aa16.82■□□□□ 0.28
ZBED9-201ENST00000452236 STK26Q9P289 416 aa16.82■□□□□ 0.28
ZBED9-201ENST00000452236 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
ZBED9-201ENST00000452236 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.8■□□□□ 0.28
ZBED9-201ENST00000452236 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
ZBED9-201ENST00000452236 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
ZBED9-201ENST00000452236 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
ZBED9-201ENST00000452236 NUP155O75694 1391 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED9-201ENST00000452236 PKD2Q13563 968 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 BCL11AQ9H165 835 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
ZBED9-201ENST00000452236 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED9-201ENST00000452236 ARXQ96QS3 562 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED9-201ENST00000452236 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED9-201ENST00000452236 SOX12O15370 315 aa16.7■□□□□ 0.26
ZBED9-201ENST00000452236 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
ZBED9-201ENST00000452236 SYNJ2O15056 1496 aa16.68■□□□□ 0.26
ZBED9-201ENST00000452236 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
ZBED9-201ENST00000452236 AFAP1Q8N556 730 aa16.66■□□□□ 0.26
ZBED9-201ENST00000452236 KNSTRNQ9Y448 316 aa16.64■□□□□ 0.25
ZBED9-201ENST00000452236 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
ZBED9-201ENST00000452236 CFAP53Q96M91 514 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED9-201ENST00000452236 RAPGEF3O95398 923 aa16.63■□□□□ 0.25
ZBED9-201ENST00000452236 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.62■□□□□ 0.25
ZBED9-201ENST00000452236 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.62■□□□□ 0.25
ZBED9-201ENST00000452236 NPHP1O15259 732 aa16.6■□□□□ 0.25
ZBED9-201ENST00000452236 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ZBED9-201ENST00000452236 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ZBED9-201ENST00000452236 POGZQ7Z3K3 1410 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.9 ms