RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHD1O14646 1710 aa24.25■■□□□ 1.47
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FBLN2P98095 1184 aa24.25■■□□□ 1.47
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IQGAP2Q13576 1575 aa24.18■■□□□ 1.46
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CEP170Q5SW79 1584 aa24.18■■□□□ 1.46
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUP160Q12769 1436 aa24.18■■□□□ 1.46
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.17■■□□□ 1.46
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.11■■□□□ 1.45
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.11■■□□□ 1.45
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARAP1Q96P48 1450 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 VPS8Q8N3P4 1428 aa24■■□□□ 1.43
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.94■■□□□ 1.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.94■■□□□ 1.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIAA0556O60303 1618 aa23.93■■□□□ 1.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DISP1Q96F81 1524 aa23.92■■□□□ 1.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SHROOM2Q13796 1616 aa23.92■■□□□ 1.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.9■■□□□ 1.42
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FMN1Q68DA7 1419 aa23.88■■□□□ 1.41
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 OSCARQ8IYS5 282 aa23.86■■□□□ 1.41
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.69■■□□□ 1.38
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAP3K1Q13233 1512 aa23.69■■□□□ 1.38
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HECW1Q76N89 1606 aa23.69■■□□□ 1.38
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.68■■□□□ 1.38
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTPRGP23470 1445 aa23.67■■□□□ 1.38
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.66■■□□□ 1.38
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TIAM1Q13009 1591 aa23.65■■□□□ 1.38
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCA8O94911 1581 aa23.61■■□□□ 1.37
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.6■■□□□ 1.37
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.52■■□□□ 1.36
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATP10BO94823 1461 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.39■■□□□ 1.34
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.39■■□□□ 1.33
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.39■■□□□ 1.33
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.39■■□□□ 1.33
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.37■■□□□ 1.33
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.33■■□□□ 1.33
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.31■■□□□ 1.32
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NCOA2Q15596 1464 aa23.29■■□□□ 1.32
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.27■■□□□ 1.32
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.25■■□□□ 1.31
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF14Q15058 1648 aa23.23■■□□□ 1.31
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.2■■□□□ 1.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.19■■□□□ 1.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.17■■□□□ 1.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.15■■□□□ 1.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.15■■□□□ 1.3
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MIA2Q96PC5 1412 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ASXL2Q76L83 1435 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNH8Q96L42 1107 aa23.07■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAPKBP1O60336 1514 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PREX2Q70Z35 1606 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23■■□□□ 1.27
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