RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448332.1

CXorf40A-210, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXorf40A, Length 364 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-210ENST00000448332 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CXorf40A-210ENST00000448332 JPH4Q96JJ6 628 aa31.24■■■□□ 2.59
CXorf40A-210ENST00000448332 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.23■■■□□ 2.59
CXorf40A-210ENST00000448332 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
CXorf40A-210ENST00000448332 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.11■■■□□ 2.57
CXorf40A-210ENST00000448332 IQGAP2Q13576 1575 aa31.08■■■□□ 2.57
CXorf40A-210ENST00000448332 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.98■■■□□ 2.55
CXorf40A-210ENST00000448332 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.91■■■□□ 2.54
CXorf40A-210ENST00000448332 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
CXorf40A-210ENST00000448332 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.85■■■□□ 2.53
CXorf40A-210ENST00000448332 PRXQ9BXM0 1461 aa30.85■■■□□ 2.53
CXorf40A-210ENST00000448332 PTPRGP23470 1445 aa30.85■■■□□ 2.53
CXorf40A-210ENST00000448332 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CXorf40A-210ENST00000448332 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.84■■■□□ 2.53
CXorf40A-210ENST00000448332 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.83■■■□□ 2.53
CXorf40A-210ENST00000448332 EEA1Q15075 1411 aa30.81■■■□□ 2.52
CXorf40A-210ENST00000448332 DISP1Q96F81 1524 aa30.78■■■□□ 2.52
CXorf40A-210ENST00000448332 KIAA0556O60303 1618 aa30.77■■■□□ 2.52
CXorf40A-210ENST00000448332 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.74■■■□□ 2.51
CXorf40A-210ENST00000448332 MAPKBP1O60336 1514 aa30.73■■■□□ 2.51
CXorf40A-210ENST00000448332 GOLGA3Q08378 1498 aa30.7■■■□□ 2.51
CXorf40A-210ENST00000448332 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.67■■■□□ 2.5
CXorf40A-210ENST00000448332 UACAQ9BZF9 1416 aa30.64■■■□□ 2.49
CXorf40A-210ENST00000448332 ABCC2Q92887 1545 aa30.63■■■□□ 2.49
CXorf40A-210ENST00000448332 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
CXorf40A-210ENST00000448332 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.61■■■□□ 2.49
CXorf40A-210ENST00000448332 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.6■■■□□ 2.49
CXorf40A-210ENST00000448332 DIP2BQ9P265 1576 aa30.59■■■□□ 2.49
CXorf40A-210ENST00000448332 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.57■■■□□ 2.48
CXorf40A-210ENST00000448332 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.56■■■□□ 2.48
CXorf40A-210ENST00000448332 KIF21BO75037 1637 aa30.51■■■□□ 2.48
CXorf40A-210ENST00000448332 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.47■■■□□ 2.47
CXorf40A-210ENST00000448332 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CXorf40A-210ENST00000448332 ASXL2Q76L83 1435 aa30.47■■■□□ 2.47
CXorf40A-210ENST00000448332 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.46■■■□□ 2.47
CXorf40A-210ENST00000448332 SAMD9Q5K651 1589 aa30.42■■■□□ 2.46
CXorf40A-210ENST00000448332 ABCA8O94911 1581 aa30.4■■■□□ 2.46
CXorf40A-210ENST00000448332 P3H3Q8IVL6 736 aa30.39■■■□□ 2.46
CXorf40A-210ENST00000448332 TSPOAP1O95153 1857 aa30.38■■■□□ 2.45
CXorf40A-210ENST00000448332 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CXorf40A-210ENST00000448332 GLI2P10070 1586 aa30.32■■■□□ 2.44
CXorf40A-210ENST00000448332 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.29■■■□□ 2.44
CXorf40A-210ENST00000448332 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.29■■■□□ 2.44
CXorf40A-210ENST00000448332 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.28■■■□□ 2.44
CXorf40A-210ENST00000448332 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
CXorf40A-210ENST00000448332 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
CXorf40A-210ENST00000448332 KDM6BO15054 1643 aa30.25■■■□□ 2.43
CXorf40A-210ENST00000448332 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.25■■■□□ 2.43
CXorf40A-210ENST00000448332 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.23■■■□□ 2.43
CXorf40A-210ENST00000448332 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.19■■■□□ 2.42
CXorf40A-210ENST00000448332 ARID3CA6NKF2 412 aa30.18■■■□□ 2.42
CXorf40A-210ENST00000448332 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CXorf40A-210ENST00000448332 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.15■■■□□ 2.42
CXorf40A-210ENST00000448332 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
CXorf40A-210ENST00000448332 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CXorf40A-210ENST00000448332 ATP10BO94823 1461 aa30.11■■■□□ 2.41
CXorf40A-210ENST00000448332 KCNH8Q96L42 1107 aa30.1■■■□□ 2.41
CXorf40A-210ENST00000448332 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.1■■■□□ 2.41
CXorf40A-210ENST00000448332 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CXorf40A-210ENST00000448332 CD109Q6YHK3 1445 aa30.03■■■□□ 2.4
CXorf40A-210ENST00000448332 FMN1Q68DA7 1419 aa29.99■■■□□ 2.39
CXorf40A-210ENST00000448332 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.98■■■□□ 2.39
CXorf40A-210ENST00000448332 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.96■■■□□ 2.39
CXorf40A-210ENST00000448332 HECW1Q76N89 1606 aa29.94■■■□□ 2.38
CXorf40A-210ENST00000448332 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CXorf40A-210ENST00000448332 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.93■■■□□ 2.38
CXorf40A-210ENST00000448332 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CXorf40A-210ENST00000448332 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.88■■■□□ 2.37
CXorf40A-210ENST00000448332 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CXorf40A-210ENST00000448332 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CXorf40A-210ENST00000448332 CLIP1P30622 1438 aa29.75■■■□□ 2.35
CXorf40A-210ENST00000448332 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CXorf40A-210ENST00000448332 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.73■■■□□ 2.35
CXorf40A-210ENST00000448332 NEO1Q92859 1461 aa29.73■■■□□ 2.35
CXorf40A-210ENST00000448332 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CXorf40A-210ENST00000448332 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.71■■■□□ 2.35
CXorf40A-210ENST00000448332 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
CXorf40A-210ENST00000448332 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.71■■■□□ 2.35
CXorf40A-210ENST00000448332 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.7■■■□□ 2.35
CXorf40A-210ENST00000448332 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.67■■■□□ 2.34
CXorf40A-210ENST00000448332 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.66■■■□□ 2.34
CXorf40A-210ENST00000448332 KIF14Q15058 1648 aa29.65■■■□□ 2.34
CXorf40A-210ENST00000448332 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.64■■■□□ 2.34
CXorf40A-210ENST00000448332 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.63■■■□□ 2.33
CXorf40A-210ENST00000448332 FANCAO15360 1455 aa29.62■■■□□ 2.33
CXorf40A-210ENST00000448332 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
CXorf40A-210ENST00000448332 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.58■■■□□ 2.33
CXorf40A-210ENST00000448332 ADGRL1O94910 1474 aa29.56■■■□□ 2.32
CXorf40A-210ENST00000448332 AKNAQ7Z591 1439 aa29.54■■■□□ 2.32
CXorf40A-210ENST00000448332 CEP162Q5TB80 1403 aa29.53■■■□□ 2.32
CXorf40A-210ENST00000448332 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.52■■■□□ 2.32
CXorf40A-210ENST00000448332 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CXorf40A-210ENST00000448332 RAPGEF3O95398 923 aa29.51■■■□□ 2.31
CXorf40A-210ENST00000448332 PLCH2O75038 1416 aa29.5■■■□□ 2.31
CXorf40A-210ENST00000448332 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.5■■■□□ 2.31
CXorf40A-210ENST00000448332 RICTORQ6R327 1708 aa29.46■■■□□ 2.31
CXorf40A-210ENST00000448332 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.45■■■□□ 2.31
CXorf40A-210ENST00000448332 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.42■■■□□ 2.3
CXorf40A-210ENST00000448332 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.4■■■□□ 2.3
CXorf40A-210ENST00000448332 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms