RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.98■■■■□ 3.35
LTB-211ENST00000446745 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
LTB-211ENST00000446745 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
LTB-211ENST00000446745 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.93■■■■□ 3.34
LTB-211ENST00000446745 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.73■■■■□ 3.31
LTB-211ENST00000446745 IQGAP2Q13576 1575 aa35.68■■■■□ 3.3
LTB-211ENST00000446745 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.63■■■■□ 3.29
LTB-211ENST00000446745 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.56■■■■□ 3.28
LTB-211ENST00000446745 PTPRGP23470 1445 aa35.5■■■■□ 3.27
LTB-211ENST00000446745 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.49■■■■□ 3.27
LTB-211ENST00000446745 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.46■■■■□ 3.27
LTB-211ENST00000446745 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.44■■■■□ 3.26
LTB-211ENST00000446745 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.44■■■■□ 3.26
LTB-211ENST00000446745 PRXQ9BXM0 1461 aa35.44■■■■□ 3.26
LTB-211ENST00000446745 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
LTB-211ENST00000446745 DISP1Q96F81 1524 aa35.39■■■■□ 3.26
LTB-211ENST00000446745 MAPKBP1O60336 1514 aa35.37■■■■□ 3.25
LTB-211ENST00000446745 EEA1Q15075 1411 aa35.36■■■■□ 3.25
LTB-211ENST00000446745 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.33■■■■□ 3.25
LTB-211ENST00000446745 KIAA0556O60303 1618 aa35.32■■■■□ 3.24
LTB-211ENST00000446745 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.3■■■■□ 3.24
LTB-211ENST00000446745 GOLGA3Q08378 1498 aa35.29■■■■□ 3.24
LTB-211ENST00000446745 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.26■■■■□ 3.23
LTB-211ENST00000446745 UACAQ9BZF9 1416 aa35.24■■■■□ 3.23
LTB-211ENST00000446745 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.24■■■■□ 3.23
LTB-211ENST00000446745 ABCC2Q92887 1545 aa35.24■■■■□ 3.23
LTB-211ENST00000446745 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.21■■■■□ 3.23
LTB-211ENST00000446745 DIP2BQ9P265 1576 aa35.17■■■■□ 3.22
LTB-211ENST00000446745 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
LTB-211ENST00000446745 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.09■■■■□ 3.21
LTB-211ENST00000446745 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.06■■■■□ 3.2
LTB-211ENST00000446745 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.06■■■■□ 3.2
LTB-211ENST00000446745 ASXL2Q76L83 1435 aa35.05■■■■□ 3.2
LTB-211ENST00000446745 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
LTB-211ENST00000446745 KIF21BO75037 1637 aa34.99■■■■□ 3.19
LTB-211ENST00000446745 ABCA8O94911 1581 aa34.94■■■■□ 3.18
LTB-211ENST00000446745 TSPOAP1O95153 1857 aa34.92■■■■□ 3.18
LTB-211ENST00000446745 GLI2P10070 1586 aa34.91■■■■□ 3.18
LTB-211ENST00000446745 SAMD9Q5K651 1589 aa34.91■■■■□ 3.18
LTB-211ENST00000446745 P3H3Q8IVL6 736 aa34.88■■■■□ 3.17
LTB-211ENST00000446745 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
LTB-211ENST00000446745 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.82■■■■□ 3.16
LTB-211ENST00000446745 KDM6BO15054 1643 aa34.78■■■■□ 3.16
LTB-211ENST00000446745 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
LTB-211ENST00000446745 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.75■■■■□ 3.15
LTB-211ENST00000446745 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.73■■■■□ 3.15
LTB-211ENST00000446745 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
LTB-211ENST00000446745 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.7■■■■□ 3.15
LTB-211ENST00000446745 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.69■■■■□ 3.14
LTB-211ENST00000446745 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
LTB-211ENST00000446745 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.67■■■■□ 3.14
LTB-211ENST00000446745 ATP10BO94823 1461 aa34.64■■■■□ 3.14
LTB-211ENST00000446745 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.63■■■■□ 3.13
LTB-211ENST00000446745 KCNH8Q96L42 1107 aa34.63■■■■□ 3.13
LTB-211ENST00000446745 ARID3CA6NKF2 412 aa34.61■■■■□ 3.13
LTB-211ENST00000446745 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.6■■■■□ 3.13
LTB-211ENST00000446745 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
LTB-211ENST00000446745 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
LTB-211ENST00000446745 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
LTB-211ENST00000446745 CD109Q6YHK3 1445 aa34.55■■■■□ 3.12
LTB-211ENST00000446745 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
LTB-211ENST00000446745 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.5■■■■□ 3.11
LTB-211ENST00000446745 FMN1Q68DA7 1419 aa34.43■■■■□ 3.1
LTB-211ENST00000446745 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.4■■■■□ 3.1
LTB-211ENST00000446745 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.39■■■■□ 3.1
LTB-211ENST00000446745 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.38■■■■□ 3.09
LTB-211ENST00000446745 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
LTB-211ENST00000446745 HECW1Q76N89 1606 aa34.31■■■■□ 3.08
LTB-211ENST00000446745 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.28■■■■□ 3.08
LTB-211ENST00000446745 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
LTB-211ENST00000446745 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
LTB-211ENST00000446745 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.22■■■■□ 3.07
LTB-211ENST00000446745 NEO1Q92859 1461 aa34.2■■■■□ 3.07
LTB-211ENST00000446745 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
LTB-211ENST00000446745 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.13■■■■□ 3.05
LTB-211ENST00000446745 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.11■■■■□ 3.05
LTB-211ENST00000446745 CLIP1P30622 1438 aa34.09■■■■□ 3.05
LTB-211ENST00000446745 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.08■■■■□ 3.05
LTB-211ENST00000446745 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.07■■■■□ 3.05
LTB-211ENST00000446745 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.06■■■■□ 3.04
LTB-211ENST00000446745 FANCAO15360 1455 aa34.04■■■■□ 3.04
LTB-211ENST00000446745 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.04■■■■□ 3.04
LTB-211ENST00000446745 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
LTB-211ENST00000446745 ADGRL1O94910 1474 aa34.02■■■■□ 3.04
LTB-211ENST00000446745 KIF14Q15058 1648 aa34.01■■■■□ 3.03
LTB-211ENST00000446745 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
LTB-211ENST00000446745 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.99■■■■□ 3.03
LTB-211ENST00000446745 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.99■■■■□ 3.03
LTB-211ENST00000446745 AKNAQ7Z591 1439 aa33.98■■■■□ 3.03
LTB-211ENST00000446745 RAPGEF3O95398 923 aa33.97■■■■□ 3.03
LTB-211ENST00000446745 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.95■■■■□ 3.03
LTB-211ENST00000446745 PLCH2O75038 1416 aa33.95■■■■□ 3.02
LTB-211ENST00000446745 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.02
LTB-211ENST00000446745 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.9■■■■□ 3.02
LTB-211ENST00000446745 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.87■■■■□ 3.01
LTB-211ENST00000446745 RICTORQ6R327 1708 aa33.87■■■■□ 3.01
LTB-211ENST00000446745 CEP162Q5TB80 1403 aa33.82■■■■□ 3
LTB-211ENST00000446745 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.79■■■■□ 3
LTB-211ENST00000446745 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.78■■■■□ 3
LTB-211ENST00000446745 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.78■■■■□ 3
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