RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446332.1

SOX9-AS1-207, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 443 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.15■■□□□ 1.46
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.14■■□□□ 1.45
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.1■■□□□ 1.45
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.92■■□□□ 1.42
SOX9-AS1-207ENST00000446332 IQGAP2Q13576 1575 aa23.9■■□□□ 1.42
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.89■■□□□ 1.41
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.41
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MAPKBP1O60336 1514 aa23.84■■□□□ 1.41
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.84■■□□□ 1.41
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.84■■□□□ 1.41
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PTPRGP23470 1445 aa23.84■■□□□ 1.41
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.82■■□□□ 1.4
SOX9-AS1-207ENST00000446332 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.79■■□□□ 1.4
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.76■■□□□ 1.39
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DISP1Q96F81 1524 aa23.75■■□□□ 1.39
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PRXQ9BXM0 1461 aa23.75■■□□□ 1.39
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.73■■□□□ 1.39
SOX9-AS1-207ENST00000446332 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.72■■□□□ 1.39
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABCC2Q92887 1545 aa23.69■■□□□ 1.38
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.68■■□□□ 1.38
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DIP2BQ9P265 1576 aa23.67■■□□□ 1.38
SOX9-AS1-207ENST00000446332 UACAQ9BZF9 1416 aa23.67■■□□□ 1.38
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KIAA0556O60303 1618 aa23.66■■□□□ 1.38
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GOLGA3Q08378 1498 aa23.64■■□□□ 1.38
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EEA1Q15075 1411 aa23.62■■□□□ 1.37
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.62■■□□□ 1.37
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.6■■□□□ 1.37
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.59■■□□□ 1.37
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GLI2P10070 1586 aa23.54■■□□□ 1.36
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ASXL2Q76L83 1435 aa23.54■■□□□ 1.36
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TSPOAP1O95153 1857 aa23.49■■□□□ 1.35
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABCA8O94911 1581 aa23.45■■□□□ 1.34
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KDM6BO15054 1643 aa23.4■■□□□ 1.34
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SAMD9Q5K651 1589 aa23.39■■□□□ 1.33
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.38■■□□□ 1.33
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SOX9-AS1-207ENST00000446332 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.37■■□□□ 1.33
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KIF21BO75037 1637 aa23.36■■□□□ 1.33
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.33■■□□□ 1.33
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.32■■□□□ 1.32
SOX9-AS1-207ENST00000446332 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.28■■□□□ 1.32
SOX9-AS1-207ENST00000446332 P3H3Q8IVL6 736 aa23.26■■□□□ 1.31
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ATP10BO94823 1461 aa23.25■■□□□ 1.31
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.23■■□□□ 1.31
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.23■■□□□ 1.31
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.23■■□□□ 1.31
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CD109Q6YHK3 1445 aa23.21■■□□□ 1.31
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KCNH8Q96L42 1107 aa23.19■■□□□ 1.3
SOX9-AS1-207ENST00000446332 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.13■■□□□ 1.29
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.12■■□□□ 1.29
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.12■■□□□ 1.29
SOX9-AS1-207ENST00000446332 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.07■■□□□ 1.28
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.06■■□□□ 1.28
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.05■■□□□ 1.28
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ARID3CA6NKF2 412 aa23.05■■□□□ 1.28
SOX9-AS1-207ENST00000446332 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SOX9-AS1-207ENST00000446332 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FMN1Q68DA7 1419 aa23.03■■□□□ 1.28
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NEO1Q92859 1461 aa23■■□□□ 1.27
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX9-AS1-207ENST00000446332 HECW1Q76N89 1606 aa22.92■■□□□ 1.26
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ADGRL1O94910 1474 aa22.91■■□□□ 1.26
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.88■■□□□ 1.25
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.87■■□□□ 1.25
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FANCAO15360 1455 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-207ENST00000446332 AKNAQ7Z591 1439 aa22.82■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RAPGEF3O95398 923 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PLCH2O75038 1416 aa22.8■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RICTORQ6R327 1708 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-207ENST00000446332 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.77■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.76■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.75■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.75■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CLIP1P30622 1438 aa22.74■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KIF14Q15058 1648 aa22.72■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.72■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.71■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.71■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.69■■□□□ 1.22
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.67■■□□□ 1.22
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.67■■□□□ 1.22
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