RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444999.5

UPP1-209, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 869 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-209ENST00000444999 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.25■■■□□ 2.75
UPP1-209ENST00000444999 CUL7Q14999 1698 aa32.2■■■□□ 2.74
UPP1-209ENST00000444999 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.11■■■□□ 2.73
UPP1-209ENST00000444999 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.11■■■□□ 2.73
UPP1-209ENST00000444999 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.86■■■□□ 2.69
UPP1-209ENST00000444999 IQGAP2Q13576 1575 aa31.83■■■□□ 2.69
UPP1-209ENST00000444999 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.83■■■□□ 2.69
UPP1-209ENST00000444999 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.68
UPP1-209ENST00000444999 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
UPP1-209ENST00000444999 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.78■■■□□ 2.68
UPP1-209ENST00000444999 PTPRGP23470 1445 aa31.77■■■□□ 2.68
UPP1-209ENST00000444999 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.76■■■□□ 2.68
UPP1-209ENST00000444999 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.73■■■□□ 2.67
UPP1-209ENST00000444999 MAPKBP1O60336 1514 aa31.73■■■□□ 2.67
UPP1-209ENST00000444999 DISP1Q96F81 1524 aa31.7■■■□□ 2.67
UPP1-209ENST00000444999 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.7■■■□□ 2.66
UPP1-209ENST00000444999 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.69■■■□□ 2.66
UPP1-209ENST00000444999 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.65■■■□□ 2.66
UPP1-209ENST00000444999 DIP2BQ9P265 1576 aa31.62■■■□□ 2.65
UPP1-209ENST00000444999 PRXQ9BXM0 1461 aa31.59■■■□□ 2.65
UPP1-209ENST00000444999 ABCC2Q92887 1545 aa31.57■■■□□ 2.64
UPP1-209ENST00000444999 KIAA0556O60303 1618 aa31.55■■■□□ 2.64
UPP1-209ENST00000444999 UACAQ9BZF9 1416 aa31.54■■■□□ 2.64
UPP1-209ENST00000444999 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.53■■■□□ 2.64
UPP1-209ENST00000444999 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.52■■■□□ 2.64
UPP1-209ENST00000444999 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
UPP1-209ENST00000444999 ASXL2Q76L83 1435 aa31.45■■■□□ 2.63
UPP1-209ENST00000444999 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.41■■■□□ 2.62
UPP1-209ENST00000444999 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.4■■■□□ 2.62
UPP1-209ENST00000444999 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.39■■■□□ 2.62
UPP1-209ENST00000444999 TSPOAP1O95153 1857 aa31.38■■■□□ 2.61
UPP1-209ENST00000444999 GOLGA3Q08378 1498 aa31.38■■■□□ 2.61
UPP1-209ENST00000444999 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
UPP1-209ENST00000444999 GLI2P10070 1586 aa31.3■■■□□ 2.6
UPP1-209ENST00000444999 KDM6BO15054 1643 aa31.27■■■□□ 2.6
UPP1-209ENST00000444999 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
UPP1-209ENST00000444999 ABCA8O94911 1581 aa31.26■■■□□ 2.59
UPP1-209ENST00000444999 EEA1Q15075 1411 aa31.25■■■□□ 2.59
UPP1-209ENST00000444999 P3H3Q8IVL6 736 aa31.24■■■□□ 2.59
UPP1-209ENST00000444999 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
UPP1-209ENST00000444999 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
UPP1-209ENST00000444999 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.16■■■□□ 2.58
UPP1-209ENST00000444999 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.16■■■□□ 2.58
UPP1-209ENST00000444999 SAMD9Q5K651 1589 aa31.13■■■□□ 2.57
UPP1-209ENST00000444999 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
UPP1-209ENST00000444999 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.08■■■□□ 2.57
UPP1-209ENST00000444999 ARID3CA6NKF2 412 aa31.07■■■□□ 2.56
UPP1-209ENST00000444999 KCNH8Q96L42 1107 aa31.06■■■□□ 2.56
UPP1-209ENST00000444999 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
UPP1-209ENST00000444999 KIF21BO75037 1637 aa31.02■■■□□ 2.56
UPP1-209ENST00000444999 ATP10BO94823 1461 aa31.01■■■□□ 2.56
UPP1-209ENST00000444999 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.01■■■□□ 2.56
UPP1-209ENST00000444999 CD109Q6YHK3 1445 aa30.97■■■□□ 2.55
UPP1-209ENST00000444999 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.96■■■□□ 2.55
UPP1-209ENST00000444999 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.95■■■□□ 2.55
UPP1-209ENST00000444999 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.93■■■□□ 2.54
UPP1-209ENST00000444999 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.93■■■□□ 2.54
UPP1-209ENST00000444999 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.93■■■□□ 2.54
UPP1-209ENST00000444999 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.91■■■□□ 2.54
UPP1-209ENST00000444999 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
UPP1-209ENST00000444999 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
UPP1-209ENST00000444999 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
UPP1-209ENST00000444999 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.83■■■□□ 2.53
UPP1-209ENST00000444999 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
UPP1-209ENST00000444999 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.76■■■□□ 2.52
UPP1-209ENST00000444999 ADGRL1O94910 1474 aa30.7■■■□□ 2.5
UPP1-209ENST00000444999 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.67■■■□□ 2.5
UPP1-209ENST00000444999 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.66■■■□□ 2.5
UPP1-209ENST00000444999 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.66■■■□□ 2.5
UPP1-209ENST00000444999 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
UPP1-209ENST00000444999 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.58■■■□□ 2.49
UPP1-209ENST00000444999 NEO1Q92859 1461 aa30.57■■■□□ 2.48
UPP1-209ENST00000444999 FMN1Q68DA7 1419 aa30.56■■■□□ 2.48
UPP1-209ENST00000444999 RAPGEF3O95398 923 aa30.55■■■□□ 2.48
UPP1-209ENST00000444999 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
UPP1-209ENST00000444999 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.54■■■□□ 2.48
UPP1-209ENST00000444999 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-209ENST00000444999 HECW1Q76N89 1606 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-209ENST00000444999 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.45■■■□□ 2.47
UPP1-209ENST00000444999 FANCAO15360 1455 aa30.44■■■□□ 2.46
UPP1-209ENST00000444999 AKNAQ7Z591 1439 aa30.43■■■□□ 2.46
UPP1-209ENST00000444999 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
UPP1-209ENST00000444999 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.37■■■□□ 2.45
UPP1-209ENST00000444999 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.37■■■□□ 2.45
UPP1-209ENST00000444999 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
UPP1-209ENST00000444999 PLCH2O75038 1416 aa30.34■■■□□ 2.45
UPP1-209ENST00000444999 RICTORQ6R327 1708 aa30.33■■■□□ 2.45
UPP1-209ENST00000444999 KIF14Q15058 1648 aa30.32■■■□□ 2.44
UPP1-209ENST00000444999 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
UPP1-209ENST00000444999 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
UPP1-209ENST00000444999 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.29■■■□□ 2.44
UPP1-209ENST00000444999 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.25■■■□□ 2.43
UPP1-209ENST00000444999 CLIP1P30622 1438 aa30.24■■■□□ 2.43
UPP1-209ENST00000444999 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.24■■■□□ 2.43
UPP1-209ENST00000444999 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.24■■■□□ 2.43
UPP1-209ENST00000444999 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
UPP1-209ENST00000444999 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.22■■■□□ 2.43
UPP1-209ENST00000444999 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.22■■■□□ 2.43
UPP1-209ENST00000444999 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.21■■■□□ 2.43
UPP1-209ENST00000444999 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms