RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444523.1

CCDC117-204, Transcript of coiled-coil domain containing 117, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC117, Length 463 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117-204ENST00000444523 KIF27Q86VH2 1401 aa42.51■■■■■ 4.4
CCDC117-204ENST00000444523 CUL7Q14999 1698 aa42.42■■■■■ 4.38
CCDC117-204ENST00000444523 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.34■■■■■ 4.37
CCDC117-204ENST00000444523 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.25■■■■■ 4.35
CCDC117-204ENST00000444523 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.21■■■■■ 4.35
CCDC117-204ENST00000444523 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.13■■■■■ 4.34
CCDC117-204ENST00000444523 MAPKBP1O60336 1514 aa42■■■■■ 4.31
CCDC117-204ENST00000444523 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.95■■■■■ 4.31
CCDC117-204ENST00000444523 IQGAP2Q13576 1575 aa41.95■■■■■ 4.31
CCDC117-204ENST00000444523 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
CCDC117-204ENST00000444523 PTPRGP23470 1445 aa41.89■■■■■ 4.3
CCDC117-204ENST00000444523 DIP2BQ9P265 1576 aa41.88■■■■■ 4.3
CCDC117-204ENST00000444523 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.87■■■■■ 4.29
CCDC117-204ENST00000444523 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.86■■■■■ 4.29
CCDC117-204ENST00000444523 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.84■■■■■ 4.29
CCDC117-204ENST00000444523 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.82■■■■■ 4.29
CCDC117-204ENST00000444523 DISP1Q96F81 1524 aa41.82■■■■■ 4.29
CCDC117-204ENST00000444523 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
CCDC117-204ENST00000444523 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.72■■■■■ 4.27
CCDC117-204ENST00000444523 ABCC2Q92887 1545 aa41.69■■■■■ 4.26
CCDC117-204ENST00000444523 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.64■■■■■ 4.26
CCDC117-204ENST00000444523 TSPOAP1O95153 1857 aa41.61■■■■■ 4.25
CCDC117-204ENST00000444523 KIAA0556O60303 1618 aa41.6■■■■■ 4.25
CCDC117-204ENST00000444523 UACAQ9BZF9 1416 aa41.6■■■■■ 4.25
CCDC117-204ENST00000444523 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.56■■■■■ 4.24
CCDC117-204ENST00000444523 ASXL2Q76L83 1435 aa41.53■■■■■ 4.24
CCDC117-204ENST00000444523 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
CCDC117-204ENST00000444523 PRXQ9BXM0 1461 aa41.53■■■■■ 4.24
CCDC117-204ENST00000444523 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.47■■■■■ 4.23
CCDC117-204ENST00000444523 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.47■■■■■ 4.23
CCDC117-204ENST00000444523 GLI2P10070 1586 aa41.43■■■■■ 4.22
CCDC117-204ENST00000444523 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
CCDC117-204ENST00000444523 KDM6BO15054 1643 aa41.41■■■■■ 4.22
CCDC117-204ENST00000444523 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
CCDC117-204ENST00000444523 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
CCDC117-204ENST00000444523 GOLGA3Q08378 1498 aa41.28■■■■■ 4.2
CCDC117-204ENST00000444523 ABCA8O94911 1581 aa41.25■■■■■ 4.19
CCDC117-204ENST00000444523 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.22■■■■■ 4.19
CCDC117-204ENST00000444523 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.17■■■■■ 4.18
CCDC117-204ENST00000444523 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.13■■■■■ 4.17
CCDC117-204ENST00000444523 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
CCDC117-204ENST00000444523 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.05■■■■■ 4.16
CCDC117-204ENST00000444523 P3H3Q8IVL6 736 aa41.03■■■■■ 4.16
CCDC117-204ENST00000444523 SAMD9Q5K651 1589 aa41■■■■■ 4.15
CCDC117-204ENST00000444523 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.96■■■■■ 4.15
CCDC117-204ENST00000444523 EEA1Q15075 1411 aa40.96■■■■■ 4.15
CCDC117-204ENST00000444523 KCNH8Q96L42 1107 aa40.9■■■■■ 4.14
CCDC117-204ENST00000444523 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.9■■■■■ 4.14
CCDC117-204ENST00000444523 ATP10BO94823 1461 aa40.89■■■■■ 4.14
CCDC117-204ENST00000444523 CD109Q6YHK3 1445 aa40.85■■■■■ 4.13
CCDC117-204ENST00000444523 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.85■■■■■ 4.13
CCDC117-204ENST00000444523 ARID3CA6NKF2 412 aa40.85■■■■■ 4.13
CCDC117-204ENST00000444523 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
CCDC117-204ENST00000444523 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.78■■■■■ 4.12
CCDC117-204ENST00000444523 KIF21BO75037 1637 aa40.72■■■■■ 4.11
CCDC117-204ENST00000444523 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
CCDC117-204ENST00000444523 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.7■■■■■ 4.11
CCDC117-204ENST00000444523 ADGRL1O94910 1474 aa40.69■■■■■ 4.1
CCDC117-204ENST00000444523 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
CCDC117-204ENST00000444523 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.64■■■■■ 4.1
CCDC117-204ENST00000444523 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.59■■■■■ 4.09
CCDC117-204ENST00000444523 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.53■■■■■ 4.08
CCDC117-204ENST00000444523 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.52■■■■■ 4.08
CCDC117-204ENST00000444523 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
CCDC117-204ENST00000444523 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
CCDC117-204ENST00000444523 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.41■■■■■ 4.06
CCDC117-204ENST00000444523 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.36■■■■■ 4.05
CCDC117-204ENST00000444523 NEO1Q92859 1461 aa40.36■■■■■ 4.05
CCDC117-204ENST00000444523 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.31■■■■■ 4.04
CCDC117-204ENST00000444523 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
CCDC117-204ENST00000444523 RAPGEF3O95398 923 aa40.3■■■■■ 4.04
CCDC117-204ENST00000444523 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.3■■■■■ 4.04
CCDC117-204ENST00000444523 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
CCDC117-204ENST00000444523 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.28■■■■■ 4.04
CCDC117-204ENST00000444523 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
CCDC117-204ENST00000444523 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.23■■■■■ 4.03
CCDC117-204ENST00000444523 AKNAQ7Z591 1439 aa40.13■■■■■ 4.01
CCDC117-204ENST00000444523 RICTORQ6R327 1708 aa40.13■■■■■ 4.01
CCDC117-204ENST00000444523 FMN1Q68DA7 1419 aa40.12■■■■■ 4.01
CCDC117-204ENST00000444523 FANCAO15360 1455 aa40.11■■■■■ 4.01
CCDC117-204ENST00000444523 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.1■■■■■ 4.01
CCDC117-204ENST00000444523 HECW1Q76N89 1606 aa40.09■■■■■ 4.01
CCDC117-204ENST00000444523 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.08■■■■■ 4.01
CCDC117-204ENST00000444523 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
CCDC117-204ENST00000444523 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.06■■■■■ 4
CCDC117-204ENST00000444523 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.05■■■■■ 4
CCDC117-204ENST00000444523 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
CCDC117-204ENST00000444523 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.99■■■■□ 3.99
CCDC117-204ENST00000444523 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.98■■■■□ 3.99
CCDC117-204ENST00000444523 PLCH2O75038 1416 aa39.98■■■■□ 3.99
CCDC117-204ENST00000444523 KIF14Q15058 1648 aa39.95■■■■□ 3.99
CCDC117-204ENST00000444523 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.94■■■■□ 3.98
CCDC117-204ENST00000444523 PTPRMP28827 1452 aa39.91■■■■□ 3.98
CCDC117-204ENST00000444523 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.89■■■■□ 3.98
CCDC117-204ENST00000444523 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.88■■■■□ 3.98
CCDC117-204ENST00000444523 MADDQ8WXG6 1647 aa39.87■■■■□ 3.97
CCDC117-204ENST00000444523 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
CCDC117-204ENST00000444523 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.87■■■■□ 3.97
CCDC117-204ENST00000444523 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.85■■■■□ 3.97
CCDC117-204ENST00000444523 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms