RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444523.1

CCDC117-204, Transcript of coiled-coil domain containing 117, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC117, Length 463 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117-204ENST00000444523 KIF27Q86VH2 1401 aa42.51■■■■■ 4.4
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CCDC117-204ENST00000444523 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.21■■■■■ 4.35
CCDC117-204ENST00000444523 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.13■■■■■ 4.34
CCDC117-204ENST00000444523 MAPKBP1O60336 1514 aa42■■■■■ 4.31
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CCDC117-204ENST00000444523 DIP2BQ9P265 1576 aa41.88■■■■■ 4.3
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CCDC117-204ENST00000444523 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.82■■■■■ 4.29
CCDC117-204ENST00000444523 DISP1Q96F81 1524 aa41.82■■■■■ 4.29
CCDC117-204ENST00000444523 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
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CCDC117-204ENST00000444523 ABCC2Q92887 1545 aa41.69■■■■■ 4.26
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CCDC117-204ENST00000444523 UACAQ9BZF9 1416 aa41.6■■■■■ 4.25
CCDC117-204ENST00000444523 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.56■■■■■ 4.24
CCDC117-204ENST00000444523 ASXL2Q76L83 1435 aa41.53■■■■■ 4.24
CCDC117-204ENST00000444523 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
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CCDC117-204ENST00000444523 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.47■■■■■ 4.23
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CCDC117-204ENST00000444523 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.13■■■■■ 4.17
CCDC117-204ENST00000444523 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
CCDC117-204ENST00000444523 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.05■■■■■ 4.16
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CCDC117-204ENST00000444523 SAMD9Q5K651 1589 aa41■■■■■ 4.15
CCDC117-204ENST00000444523 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.96■■■■■ 4.15
CCDC117-204ENST00000444523 EEA1Q15075 1411 aa40.96■■■■■ 4.15
CCDC117-204ENST00000444523 KCNH8Q96L42 1107 aa40.9■■■■■ 4.14
CCDC117-204ENST00000444523 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.9■■■■■ 4.14
CCDC117-204ENST00000444523 ATP10BO94823 1461 aa40.89■■■■■ 4.14
CCDC117-204ENST00000444523 CD109Q6YHK3 1445 aa40.85■■■■■ 4.13
CCDC117-204ENST00000444523 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.85■■■■■ 4.13
CCDC117-204ENST00000444523 ARID3CA6NKF2 412 aa40.85■■■■■ 4.13
CCDC117-204ENST00000444523 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
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CCDC117-204ENST00000444523 KIF21BO75037 1637 aa40.72■■■■■ 4.11
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CCDC117-204ENST00000444523 ADGRL1O94910 1474 aa40.69■■■■■ 4.1
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CCDC117-204ENST00000444523 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.53■■■■■ 4.08
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CCDC117-204ENST00000444523 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.3■■■■■ 4.04
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CCDC117-204ENST00000444523 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.1■■■■■ 4.01
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CCDC117-204ENST00000444523 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.08■■■■■ 4.01
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CCDC117-204ENST00000444523 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.06■■■■■ 4
CCDC117-204ENST00000444523 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.05■■■■■ 4
CCDC117-204ENST00000444523 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
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CCDC117-204ENST00000444523 PLCH2O75038 1416 aa39.98■■■■□ 3.99
CCDC117-204ENST00000444523 KIF14Q15058 1648 aa39.95■■■■□ 3.99
CCDC117-204ENST00000444523 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.94■■■■□ 3.98
CCDC117-204ENST00000444523 PTPRMP28827 1452 aa39.91■■■■□ 3.98
CCDC117-204ENST00000444523 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.89■■■■□ 3.98
CCDC117-204ENST00000444523 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.88■■■■□ 3.98
CCDC117-204ENST00000444523 MADDQ8WXG6 1647 aa39.87■■■■□ 3.97
CCDC117-204ENST00000444523 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
CCDC117-204ENST00000444523 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.87■■■■□ 3.97
CCDC117-204ENST00000444523 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.85■■■■□ 3.97
CCDC117-204ENST00000444523 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
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