RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442029.5

PTPRN-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 541 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-206ENST00000442029 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRN-206ENST00000442029 JPH4Q96JJ6 628 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRN-206ENST00000442029 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRN-206ENST00000442029 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRN-206ENST00000442029 IQGAP2Q13576 1575 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRN-206ENST00000442029 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRN-206ENST00000442029 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRN-206ENST00000442029 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
PTPRN-206ENST00000442029 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRN-206ENST00000442029 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRN-206ENST00000442029 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRN-206ENST00000442029 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRN-206ENST00000442029 PTPRGP23470 1445 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRN-206ENST00000442029 MAPKBP1O60336 1514 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRN-206ENST00000442029 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRN-206ENST00000442029 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRN-206ENST00000442029 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRN-206ENST00000442029 DIP2BQ9P265 1576 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRN-206ENST00000442029 DISP1Q96F81 1524 aa24.45■■□□□ 1.51
PTPRN-206ENST00000442029 KIAA0556O60303 1618 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRN-206ENST00000442029 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRN-206ENST00000442029 TSPOAP1O95153 1857 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRN-206ENST00000442029 ABCC2Q92887 1545 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRN-206ENST00000442029 PRXQ9BXM0 1461 aa24.39■■□□□ 1.5
PTPRN-206ENST00000442029 UACAQ9BZF9 1416 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRN-206ENST00000442029 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRN-206ENST00000442029 GOLGA3Q08378 1498 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRN-206ENST00000442029 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRN-206ENST00000442029 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRN-206ENST00000442029 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRN-206ENST00000442029 ASXL2Q76L83 1435 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRN-206ENST00000442029 EEA1Q15075 1411 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRN-206ENST00000442029 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRN-206ENST00000442029 KDM6BO15054 1643 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRN-206ENST00000442029 GLI2P10070 1586 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRN-206ENST00000442029 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRN-206ENST00000442029 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRN-206ENST00000442029 ABCA8O94911 1581 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRN-206ENST00000442029 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRN-206ENST00000442029 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRN-206ENST00000442029 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRN-206ENST00000442029 SAMD9Q5K651 1589 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRN-206ENST00000442029 P3H3Q8IVL6 736 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRN-206ENST00000442029 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRN-206ENST00000442029 KIF21BO75037 1637 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRN-206ENST00000442029 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRN-206ENST00000442029 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRN-206ENST00000442029 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRN-206ENST00000442029 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRN-206ENST00000442029 CHIC1Q5VXU3 224 aa24■■□□□ 1.43
PTPRN-206ENST00000442029 KCNH8Q96L42 1107 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRN-206ENST00000442029 ARID3CA6NKF2 412 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRN-206ENST00000442029 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRN-206ENST00000442029 ATP10BO94823 1461 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-206ENST00000442029 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-206ENST00000442029 CD109Q6YHK3 1445 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-206ENST00000442029 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRN-206ENST00000442029 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRN-206ENST00000442029 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN-206ENST00000442029 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN-206ENST00000442029 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-206ENST00000442029 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRN-206ENST00000442029 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRN-206ENST00000442029 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRN-206ENST00000442029 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRN-206ENST00000442029 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-206ENST00000442029 HECW1Q76N89 1606 aa23.7■■□□□ 1.39
PTPRN-206ENST00000442029 FMN1Q68DA7 1419 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-206ENST00000442029 ADGRL1O94910 1474 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-206ENST00000442029 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-206ENST00000442029 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-206ENST00000442029 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRN-206ENST00000442029 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRN-206ENST00000442029 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRN-206ENST00000442029 NEO1Q92859 1461 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRN-206ENST00000442029 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-206ENST00000442029 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-206ENST00000442029 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-206ENST00000442029 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRN-206ENST00000442029 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-206ENST00000442029 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-206ENST00000442029 RAPGEF3O95398 923 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-206ENST00000442029 FANCAO15360 1455 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-206ENST00000442029 RICTORQ6R327 1708 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-206ENST00000442029 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-206ENST00000442029 AKNAQ7Z591 1439 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-206ENST00000442029 KIF14Q15058 1648 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRN-206ENST00000442029 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-206ENST00000442029 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRN-206ENST00000442029 CLIP1P30622 1438 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRN-206ENST00000442029 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRN-206ENST00000442029 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-206ENST00000442029 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRN-206ENST00000442029 PLCH2O75038 1416 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-206ENST00000442029 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRN-206ENST00000442029 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PTPRN-206ENST00000442029 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.39■■□□□ 1.34
PTPRN-206ENST00000442029 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRN-206ENST00000442029 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRN-206ENST00000442029 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.38■■□□□ 1.33
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