RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441400.5

AFF3-212, Transcript of AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene AFF3, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3-212ENST00000441400 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
AFF3-212ENST00000441400 JPH4Q96JJ6 628 aa46.15■■■■■ 4.98
AFF3-212ENST00000441400 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.08■■■■■ 4.97
AFF3-212ENST00000441400 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.06■■■■■ 4.96
AFF3-212ENST00000441400 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.73■■■■■ 4.91
AFF3-212ENST00000441400 IQGAP2Q13576 1575 aa45.71■■■■■ 4.91
AFF3-212ENST00000441400 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.59■■■■■ 4.89
AFF3-212ENST00000441400 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.58■■■■■ 4.89
AFF3-212ENST00000441400 PTPRGP23470 1445 aa45.5■■■■■ 4.87
AFF3-212ENST00000441400 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.48■■■■■ 4.87
AFF3-212ENST00000441400 MAPKBP1O60336 1514 aa45.48■■■■■ 4.87
AFF3-212ENST00000441400 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.47■■■■■ 4.87
AFF3-212ENST00000441400 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.47■■■■■ 4.87
AFF3-212ENST00000441400 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.45■■■■■ 4.87
AFF3-212ENST00000441400 DISP1Q96F81 1524 aa45.42■■■■■ 4.86
AFF3-212ENST00000441400 PRXQ9BXM0 1461 aa45.4■■■■■ 4.86
AFF3-212ENST00000441400 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.38■■■■■ 4.86
AFF3-212ENST00000441400 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.34■■■■■ 4.85
AFF3-212ENST00000441400 KIAA0556O60303 1618 aa45.29■■■■■ 4.84
AFF3-212ENST00000441400 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.25■■■■■ 4.83
AFF3-212ENST00000441400 DIP2BQ9P265 1576 aa45.24■■■■■ 4.83
AFF3-212ENST00000441400 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.24■■■■■ 4.83
AFF3-212ENST00000441400 ABCC2Q92887 1545 aa45.24■■■■■ 4.83
AFF3-212ENST00000441400 UACAQ9BZF9 1416 aa45.19■■■■■ 4.83
AFF3-212ENST00000441400 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.18■■■■■ 4.82
AFF3-212ENST00000441400 GOLGA3Q08378 1498 aa45.12■■■■■ 4.81
AFF3-212ENST00000441400 EEA1Q15075 1411 aa45.11■■■■■ 4.81
AFF3-212ENST00000441400 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.1■■■■■ 4.81
AFF3-212ENST00000441400 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.02■■■■■ 4.8
AFF3-212ENST00000441400 PLB1Q6P1J6 1458 aa45■■■■■ 4.79
AFF3-212ENST00000441400 ASXL2Q76L83 1435 aa44.99■■■■■ 4.79
AFF3-212ENST00000441400 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
AFF3-212ENST00000441400 GLI2P10070 1586 aa44.88■■■■■ 4.78
AFF3-212ENST00000441400 TSPOAP1O95153 1857 aa44.86■■■■■ 4.77
AFF3-212ENST00000441400 ABCA8O94911 1581 aa44.85■■■■■ 4.77
AFF3-212ENST00000441400 SAMD9Q5K651 1589 aa44.75■■■■■ 4.75
AFF3-212ENST00000441400 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
AFF3-212ENST00000441400 KIF21BO75037 1637 aa44.72■■■■■ 4.75
AFF3-212ENST00000441400 KDM6BO15054 1643 aa44.71■■■■■ 4.75
AFF3-212ENST00000441400 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.69■■■■■ 4.74
AFF3-212ENST00000441400 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.69■■■■■ 4.74
AFF3-212ENST00000441400 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
AFF3-212ENST00000441400 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.66■■■■■ 4.74
AFF3-212ENST00000441400 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.64■■■■■ 4.74
AFF3-212ENST00000441400 P3H3Q8IVL6 736 aa44.6■■■■■ 4.73
AFF3-212ENST00000441400 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.47■■■■■ 4.71
AFF3-212ENST00000441400 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.46■■■■■ 4.71
AFF3-212ENST00000441400 ATP10BO94823 1461 aa44.43■■■■■ 4.7
AFF3-212ENST00000441400 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.42■■■■■ 4.7
AFF3-212ENST00000441400 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
AFF3-212ENST00000441400 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.41■■■■■ 4.7
AFF3-212ENST00000441400 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.37■■■■■ 4.69
AFF3-212ENST00000441400 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
AFF3-212ENST00000441400 KCNH8Q96L42 1107 aa44.32■■■■■ 4.69
AFF3-212ENST00000441400 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.31■■■■■ 4.68
AFF3-212ENST00000441400 CD109Q6YHK3 1445 aa44.31■■■■■ 4.68
AFF3-212ENST00000441400 ARID3CA6NKF2 412 aa44.29■■■■■ 4.68
AFF3-212ENST00000441400 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
AFF3-212ENST00000441400 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.27■■■■■ 4.68
AFF3-212ENST00000441400 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
AFF3-212ENST00000441400 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.16■■■■■ 4.66
AFF3-212ENST00000441400 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.11■■■■■ 4.65
AFF3-212ENST00000441400 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
AFF3-212ENST00000441400 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
AFF3-212ENST00000441400 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.03■■■■■ 4.64
AFF3-212ENST00000441400 FMN1Q68DA7 1419 aa43.99■■■■■ 4.63
AFF3-212ENST00000441400 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.96■■■■■ 4.63
AFF3-212ENST00000441400 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.95■■■■■ 4.63
AFF3-212ENST00000441400 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.94■■■■■ 4.62
AFF3-212ENST00000441400 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.93■■■■■ 4.62
AFF3-212ENST00000441400 HECW1Q76N89 1606 aa43.88■■■■■ 4.61
AFF3-212ENST00000441400 NEO1Q92859 1461 aa43.87■■■■■ 4.61
AFF3-212ENST00000441400 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
AFF3-212ENST00000441400 ADGRL1O94910 1474 aa43.79■■■■■ 4.6
AFF3-212ENST00000441400 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.78■■■■■ 4.6
AFF3-212ENST00000441400 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.71■■■■■ 4.59
AFF3-212ENST00000441400 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.67■■■■■ 4.58
AFF3-212ENST00000441400 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
AFF3-212ENST00000441400 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.62■■■■■ 4.57
AFF3-212ENST00000441400 FANCAO15360 1455 aa43.62■■■■■ 4.57
AFF3-212ENST00000441400 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.61■■■■■ 4.57
AFF3-212ENST00000441400 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.61■■■■■ 4.57
AFF3-212ENST00000441400 RAPGEF3O95398 923 aa43.59■■■■■ 4.57
AFF3-212ENST00000441400 AKNAQ7Z591 1439 aa43.57■■■■■ 4.57
AFF3-212ENST00000441400 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.56■■■■■ 4.56
AFF3-212ENST00000441400 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
AFF3-212ENST00000441400 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
AFF3-212ENST00000441400 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
AFF3-212ENST00000441400 RICTORQ6R327 1708 aa43.51■■■■■ 4.56
AFF3-212ENST00000441400 PLCH2O75038 1416 aa43.51■■■■■ 4.56
AFF3-212ENST00000441400 CLIP1P30622 1438 aa43.51■■■■■ 4.56
AFF3-212ENST00000441400 KIF14Q15058 1648 aa43.5■■■■■ 4.55
AFF3-212ENST00000441400 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.49■■■■■ 4.55
AFF3-212ENST00000441400 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.48■■■■■ 4.55
AFF3-212ENST00000441400 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.43■■■■■ 4.54
AFF3-212ENST00000441400 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.38■■■■■ 4.54
AFF3-212ENST00000441400 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.38■■■■■ 4.53
AFF3-212ENST00000441400 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.31■■■■■ 4.52
AFF3-212ENST00000441400 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.29■■■■■ 4.52
AFF3-212ENST00000441400 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.28■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms