RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439025.1

RPS27L-203, Transcript of ribosomal protein S27 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS27L, Length 970 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27L-203ENST00000439025 CEP170Q5SW79 1584 aa23.11■■□□□ 1.29
RPS27L-203ENST00000439025 NUP160Q12769 1436 aa23.08■■□□□ 1.29
RPS27L-203ENST00000439025 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RPS27L-203ENST00000439025 KIF21BO75037 1637 aa23.04■■□□□ 1.28
RPS27L-203ENST00000439025 GOLGA3Q08378 1498 aa23.04■■□□□ 1.28
RPS27L-203ENST00000439025 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.03■■□□□ 1.28
RPS27L-203ENST00000439025 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.01■■□□□ 1.27
RPS27L-203ENST00000439025 JPH4Q96JJ6 628 aa23■■□□□ 1.27
RPS27L-203ENST00000439025 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RPS27L-203ENST00000439025 IQGAP2Q13576 1575 aa22.97■■□□□ 1.27
RPS27L-203ENST00000439025 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.96■■□□□ 1.27
RPS27L-203ENST00000439025 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RPS27L-203ENST00000439025 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.9■■□□□ 1.26
RPS27L-203ENST00000439025 ARHGEF11O15085 1522 aa22.88■■□□□ 1.25
RPS27L-203ENST00000439025 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.87■■□□□ 1.25
RPS27L-203ENST00000439025 P3H3Q8IVL6 736 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS27L-203ENST00000439025 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS27L-203ENST00000439025 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS27L-203ENST00000439025 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS27L-203ENST00000439025 SHROOM2Q13796 1616 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS27L-203ENST00000439025 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS27L-203ENST00000439025 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS27L-203ENST00000439025 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.77■■□□□ 1.24
RPS27L-203ENST00000439025 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS27L-203ENST00000439025 KIAA0556O60303 1618 aa22.71■■□□□ 1.23
RPS27L-203ENST00000439025 PTPRGP23470 1445 aa22.71■■□□□ 1.23
RPS27L-203ENST00000439025 ARAP1Q96P48 1450 aa22.71■■□□□ 1.23
RPS27L-203ENST00000439025 DISP1Q96F81 1524 aa22.71■■□□□ 1.23
RPS27L-203ENST00000439025 CLIP1P30622 1438 aa22.65■■□□□ 1.22
RPS27L-203ENST00000439025 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.65■■□□□ 1.22
RPS27L-203ENST00000439025 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.65■■□□□ 1.22
RPS27L-203ENST00000439025 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
RPS27L-203ENST00000439025 CEP162Q5TB80 1403 aa22.62■■□□□ 1.21
RPS27L-203ENST00000439025 SAMD9Q5K651 1589 aa22.62■■□□□ 1.21
RPS27L-203ENST00000439025 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
RPS27L-203ENST00000439025 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.58■■□□□ 1.2
RPS27L-203ENST00000439025 ARID3CA6NKF2 412 aa22.56■■□□□ 1.2
RPS27L-203ENST00000439025 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
RPS27L-203ENST00000439025 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
RPS27L-203ENST00000439025 UACAQ9BZF9 1416 aa22.53■■□□□ 1.2
RPS27L-203ENST00000439025 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.5■■□□□ 1.19
RPS27L-203ENST00000439025 FMN1Q68DA7 1419 aa22.49■■□□□ 1.19
RPS27L-203ENST00000439025 ABCC2Q92887 1545 aa22.44■■□□□ 1.18
RPS27L-203ENST00000439025 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.43■■□□□ 1.18
RPS27L-203ENST00000439025 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.42■■□□□ 1.18
RPS27L-203ENST00000439025 ABCA8O94911 1581 aa22.4■■□□□ 1.18
RPS27L-203ENST00000439025 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.39■■□□□ 1.17
RPS27L-203ENST00000439025 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
RPS27L-203ENST00000439025 HECW1Q76N89 1606 aa22.34■■□□□ 1.17
RPS27L-203ENST00000439025 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 APLP2Q06481 763 aa22.32■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.31■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 KCNH8Q96L42 1107 aa22.29■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.29■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.28■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 ATP10BO94823 1461 aa22.28■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.28■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.27■■□□□ 1.16
RPS27L-203ENST00000439025 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RPS27L-203ENST00000439025 ASXL2Q76L83 1435 aa22.25■■□□□ 1.15
RPS27L-203ENST00000439025 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RPS27L-203ENST00000439025 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.22■■□□□ 1.15
RPS27L-203ENST00000439025 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.21■■□□□ 1.15
RPS27L-203ENST00000439025 MAPKBP1O60336 1514 aa22.19■■□□□ 1.14
RPS27L-203ENST00000439025 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.17■■□□□ 1.14
RPS27L-203ENST00000439025 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS27L-203ENST00000439025 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS27L-203ENST00000439025 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS27L-203ENST00000439025 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RPS27L-203ENST00000439025 DIP2BQ9P265 1576 aa22.05■■□□□ 1.12
RPS27L-203ENST00000439025 TIAM1Q13009 1591 aa22.04■■□□□ 1.12
RPS27L-203ENST00000439025 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RPS27L-203ENST00000439025 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.02■■□□□ 1.12
RPS27L-203ENST00000439025 KIF14Q15058 1648 aa22.02■■□□□ 1.11
RPS27L-203ENST00000439025 CD109Q6YHK3 1445 aa21.99■■□□□ 1.11
RPS27L-203ENST00000439025 TSPOAP1O95153 1857 aa21.99■■□□□ 1.11
RPS27L-203ENST00000439025 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RPS27L-203ENST00000439025 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.99■■□□□ 1.11
RPS27L-203ENST00000439025 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.98■■□□□ 1.11
RPS27L-203ENST00000439025 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.98■■□□□ 1.11
RPS27L-203ENST00000439025 FOXD1Q16676 465 aa21.98■■□□□ 1.11
RPS27L-203ENST00000439025 GLI2P10070 1586 aa21.96■■□□□ 1.11
RPS27L-203ENST00000439025 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.96■■□□□ 1.11
RPS27L-203ENST00000439025 MAP3K1Q13233 1512 aa21.95■■□□□ 1.1
RPS27L-203ENST00000439025 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
RPS27L-203ENST00000439025 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.93■■□□□ 1.1
RPS27L-203ENST00000439025 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
RPS27L-203ENST00000439025 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.91■■□□□ 1.1
RPS27L-203ENST00000439025 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.91■■□□□ 1.1
RPS27L-203ENST00000439025 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RPS27L-203ENST00000439025 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.89■■□□□ 1.09
RPS27L-203ENST00000439025 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.89■■□□□ 1.09
RPS27L-203ENST00000439025 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS27L-203ENST00000439025 NCOA2Q15596 1464 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS27L-203ENST00000439025 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS27L-203ENST00000439025 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RPS27L-203ENST00000439025 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms