RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437945.5

MEST-211, mesoderm specific transcript, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MEST, Length 1,455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEST-211ENST00000437945 CEP170Q5SW79 1584 aa41.43■■■■■ 4.22
MEST-211ENST00000437945 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.4■■■■■ 4.22
MEST-211ENST00000437945 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.38■■■■■ 4.22
MEST-211ENST00000437945 OSCARQ8IYS5 282 aa41.28■■■■■ 4.2
MEST-211ENST00000437945 IQGAP2Q13576 1575 aa41.28■■■■■ 4.2
MEST-211ENST00000437945 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.19■■■■■ 4.19
MEST-211ENST00000437945 CEP162Q5TB80 1403 aa41.15■■■■■ 4.18
MEST-211ENST00000437945 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.11■■■■■ 4.17
MEST-211ENST00000437945 JPH4Q96JJ6 628 aa41.1■■■■■ 4.17
MEST-211ENST00000437945 CLIP1P30622 1438 aa41.08■■■■■ 4.17
MEST-211ENST00000437945 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
MEST-211ENST00000437945 SHROOM2Q13796 1616 aa41.02■■■■■ 4.16
MEST-211ENST00000437945 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.01■■■■■ 4.16
MEST-211ENST00000437945 SAMD9Q5K651 1589 aa40.96■■■■■ 4.15
MEST-211ENST00000437945 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.95■■■■■ 4.15
MEST-211ENST00000437945 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.92■■■■■ 4.14
MEST-211ENST00000437945 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
MEST-211ENST00000437945 DISP1Q96F81 1524 aa40.9■■■■■ 4.14
MEST-211ENST00000437945 KIAA0556O60303 1618 aa40.86■■■■■ 4.13
MEST-211ENST00000437945 P3H3Q8IVL6 736 aa40.81■■■■■ 4.12
MEST-211ENST00000437945 ARAP1Q96P48 1450 aa40.77■■■■■ 4.12
MEST-211ENST00000437945 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.77■■■■■ 4.12
MEST-211ENST00000437945 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.69■■■■■ 4.1
MEST-211ENST00000437945 FMN1Q68DA7 1419 aa40.64■■■■■ 4.1
MEST-211ENST00000437945 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.6■■■■■ 4.09
MEST-211ENST00000437945 PTPRGP23470 1445 aa40.58■■■■■ 4.09
MEST-211ENST00000437945 ARHGEF11O15085 1522 aa40.56■■■■■ 4.08
MEST-211ENST00000437945 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
MEST-211ENST00000437945 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.43■■■■■ 4.06
MEST-211ENST00000437945 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
MEST-211ENST00000437945 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
MEST-211ENST00000437945 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
MEST-211ENST00000437945 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.38■■■■■ 4.05
MEST-211ENST00000437945 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
MEST-211ENST00000437945 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.36■■■■■ 4.05
MEST-211ENST00000437945 ABCA8O94911 1581 aa40.36■■■■■ 4.05
MEST-211ENST00000437945 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.35■■■■■ 4.05
MEST-211ENST00000437945 UACAQ9BZF9 1416 aa40.34■■■■■ 4.05
MEST-211ENST00000437945 HECW1Q76N89 1606 aa40.29■■■■■ 4.04
MEST-211ENST00000437945 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
MEST-211ENST00000437945 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.25■■■■■ 4.03
MEST-211ENST00000437945 ABCC2Q92887 1545 aa40.23■■■■■ 4.03
MEST-211ENST00000437945 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.23■■■■■ 4.03
MEST-211ENST00000437945 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
MEST-211ENST00000437945 APLP2Q06481 763 aa40.19■■■■■ 4.02
MEST-211ENST00000437945 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.16■■■■■ 4.02
MEST-211ENST00000437945 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.15■■■■■ 4.02
MEST-211ENST00000437945 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
MEST-211ENST00000437945 MAP3K1Q13233 1512 aa40.12■■■■■ 4.01
MEST-211ENST00000437945 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.1■■■■■ 4.01
MEST-211ENST00000437945 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.07■■■■■ 4
MEST-211ENST00000437945 TIAM1Q13009 1591 aa40.05■■■■■ 4
MEST-211ENST00000437945 ATP10BO94823 1461 aa40.04■■■■■ 4
MEST-211ENST00000437945 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.04■■■■■ 4
MEST-211ENST00000437945 ARID3CA6NKF2 412 aa40.02■■■■■ 4
MEST-211ENST00000437945 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.02■■■■■ 4
MEST-211ENST00000437945 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
MEST-211ENST00000437945 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
MEST-211ENST00000437945 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
MEST-211ENST00000437945 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
MEST-211ENST00000437945 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.94■■■■□ 3.98
MEST-211ENST00000437945 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
MEST-211ENST00000437945 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.88■■■■□ 3.97
MEST-211ENST00000437945 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
MEST-211ENST00000437945 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.84■■■■□ 3.97
MEST-211ENST00000437945 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.84■■■■□ 3.97
MEST-211ENST00000437945 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.8■■■■□ 3.96
MEST-211ENST00000437945 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.78■■■■□ 3.96
MEST-211ENST00000437945 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
MEST-211ENST00000437945 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
MEST-211ENST00000437945 ASXL2Q76L83 1435 aa39.7■■■■□ 3.95
MEST-211ENST00000437945 MAPKBP1O60336 1514 aa39.68■■■■□ 3.94
MEST-211ENST00000437945 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.68■■■■□ 3.94
MEST-211ENST00000437945 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.93
MEST-211ENST00000437945 KIF14Q15058 1648 aa39.59■■■■□ 3.93
MEST-211ENST00000437945 NCOA2Q15596 1464 aa39.56■■■■□ 3.92
MEST-211ENST00000437945 KCNH8Q96L42 1107 aa39.54■■■■□ 3.92
MEST-211ENST00000437945 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.45■■■■□ 3.91
MEST-211ENST00000437945 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.42■■■■□ 3.9
MEST-211ENST00000437945 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.42■■■■□ 3.9
MEST-211ENST00000437945 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.42■■■■□ 3.9
MEST-211ENST00000437945 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.37■■■■□ 3.89
MEST-211ENST00000437945 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.36■■■■□ 3.89
MEST-211ENST00000437945 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.35■■■■□ 3.89
MEST-211ENST00000437945 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
MEST-211ENST00000437945 GLI2P10070 1586 aa39.33■■■■□ 3.89
MEST-211ENST00000437945 DIP2BQ9P265 1576 aa39.3■■■■□ 3.88
MEST-211ENST00000437945 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.29■■■■□ 3.88
MEST-211ENST00000437945 MIA2Q96PC5 1412 aa39.27■■■■□ 3.88
MEST-211ENST00000437945 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.25■■■■□ 3.87
MEST-211ENST00000437945 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.25■■■■□ 3.87
MEST-211ENST00000437945 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.24■■■■□ 3.87
MEST-211ENST00000437945 PLCH2O75038 1416 aa39.24■■■■□ 3.87
MEST-211ENST00000437945 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.24■■■■□ 3.87
MEST-211ENST00000437945 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
MEST-211ENST00000437945 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
MEST-211ENST00000437945 PREX2Q70Z35 1606 aa39.22■■■■□ 3.87
MEST-211ENST00000437945 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.21■■■■□ 3.87
MEST-211ENST00000437945 CD109Q6YHK3 1445 aa39.2■■■■□ 3.87
MEST-211ENST00000437945 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.16■■■■□ 3.86
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