RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 CUL7Q14999 1698 aa26.16■■□□□ 1.78
HERC3-206ENST00000431413 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.14■■□□□ 1.78
HERC3-206ENST00000431413 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.11■■□□□ 1.77
HERC3-206ENST00000431413 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.09■■□□□ 1.77
HERC3-206ENST00000431413 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
HERC3-206ENST00000431413 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.9■■□□□ 1.74
HERC3-206ENST00000431413 PTPRGP23470 1445 aa25.87■■□□□ 1.73
HERC3-206ENST00000431413 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.86■■□□□ 1.73
HERC3-206ENST00000431413 IQGAP2Q13576 1575 aa25.85■■□□□ 1.73
HERC3-206ENST00000431413 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.82■■□□□ 1.72
HERC3-206ENST00000431413 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.81■■□□□ 1.72
HERC3-206ENST00000431413 MAPKBP1O60336 1514 aa25.81■■□□□ 1.72
HERC3-206ENST00000431413 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
HERC3-206ENST00000431413 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.8■■□□□ 1.72
HERC3-206ENST00000431413 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.79■■□□□ 1.72
HERC3-206ENST00000431413 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.76■■□□□ 1.71
HERC3-206ENST00000431413 DISP1Q96F81 1524 aa25.69■■□□□ 1.7
HERC3-206ENST00000431413 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.68■■□□□ 1.7
HERC3-206ENST00000431413 DIP2BQ9P265 1576 aa25.67■■□□□ 1.7
HERC3-206ENST00000431413 ABCC2Q92887 1545 aa25.67■■□□□ 1.7
HERC3-206ENST00000431413 UACAQ9BZF9 1416 aa25.65■■□□□ 1.7
HERC3-206ENST00000431413 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.64■■□□□ 1.69
HERC3-206ENST00000431413 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
HERC3-206ENST00000431413 PRXQ9BXM0 1461 aa25.6■■□□□ 1.69
HERC3-206ENST00000431413 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.59■■□□□ 1.69
HERC3-206ENST00000431413 KIAA0556O60303 1618 aa25.59■■□□□ 1.69
HERC3-206ENST00000431413 GOLGA3Q08378 1498 aa25.57■■□□□ 1.68
HERC3-206ENST00000431413 ASXL2Q76L83 1435 aa25.56■■□□□ 1.68
HERC3-206ENST00000431413 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.56■■□□□ 1.68
HERC3-206ENST00000431413 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.52■■□□□ 1.68
HERC3-206ENST00000431413 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.52■■□□□ 1.68
HERC3-206ENST00000431413 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
HERC3-206ENST00000431413 GLI2P10070 1586 aa25.45■■□□□ 1.66
HERC3-206ENST00000431413 EEA1Q15075 1411 aa25.45■■□□□ 1.66
HERC3-206ENST00000431413 TSPOAP1O95153 1857 aa25.45■■□□□ 1.66
HERC3-206ENST00000431413 KDM6BO15054 1643 aa25.44■■□□□ 1.66
HERC3-206ENST00000431413 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
HERC3-206ENST00000431413 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HERC3-206ENST00000431413 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.34■■□□□ 1.65
HERC3-206ENST00000431413 ABCA8O94911 1581 aa25.34■■□□□ 1.65
HERC3-206ENST00000431413 P3H3Q8IVL6 736 aa25.33■■□□□ 1.65
HERC3-206ENST00000431413 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.31■■□□□ 1.64
HERC3-206ENST00000431413 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.28■■□□□ 1.64
HERC3-206ENST00000431413 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HERC3-206ENST00000431413 KCNH8Q96L42 1107 aa25.26■■□□□ 1.63
HERC3-206ENST00000431413 SAMD9Q5K651 1589 aa25.22■■□□□ 1.63
HERC3-206ENST00000431413 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
HERC3-206ENST00000431413 CD109Q6YHK3 1445 aa25.2■■□□□ 1.62
HERC3-206ENST00000431413 ARID3CA6NKF2 412 aa25.19■■□□□ 1.62
HERC3-206ENST00000431413 ATP10BO94823 1461 aa25.16■■□□□ 1.62
HERC3-206ENST00000431413 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.15■■□□□ 1.62
HERC3-206ENST00000431413 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HERC3-206ENST00000431413 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.14■■□□□ 1.62
HERC3-206ENST00000431413 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HERC3-206ENST00000431413 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HERC3-206ENST00000431413 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.14■■□□□ 1.62
HERC3-206ENST00000431413 KIF21BO75037 1637 aa25.14■■□□□ 1.61
HERC3-206ENST00000431413 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.12■■□□□ 1.61
HERC3-206ENST00000431413 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.11■■□□□ 1.61
HERC3-206ENST00000431413 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.09■■□□□ 1.61
HERC3-206ENST00000431413 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HERC3-206ENST00000431413 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.06■■□□□ 1.6
HERC3-206ENST00000431413 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HERC3-206ENST00000431413 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25■■□□□ 1.59
HERC3-206ENST00000431413 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25■■□□□ 1.59
HERC3-206ENST00000431413 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25■■□□□ 1.59
HERC3-206ENST00000431413 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.97■■□□□ 1.59
HERC3-206ENST00000431413 ADGRL1O94910 1474 aa24.96■■□□□ 1.59
HERC3-206ENST00000431413 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.95■■□□□ 1.58
HERC3-206ENST00000431413 NEO1Q92859 1461 aa24.89■■□□□ 1.58
HERC3-206ENST00000431413 FMN1Q68DA7 1419 aa24.89■■□□□ 1.58
HERC3-206ENST00000431413 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HERC3-206ENST00000431413 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.83■■□□□ 1.56
HERC3-206ENST00000431413 RAPGEF3O95398 923 aa24.81■■□□□ 1.56
HERC3-206ENST00000431413 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HERC3-206ENST00000431413 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
HERC3-206ENST00000431413 HECW1Q76N89 1606 aa24.77■■□□□ 1.56
HERC3-206ENST00000431413 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
HERC3-206ENST00000431413 FANCAO15360 1455 aa24.75■■□□□ 1.55
HERC3-206ENST00000431413 AKNAQ7Z591 1439 aa24.74■■□□□ 1.55
HERC3-206ENST00000431413 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
HERC3-206ENST00000431413 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.72■■□□□ 1.55
HERC3-206ENST00000431413 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.7■■□□□ 1.54
HERC3-206ENST00000431413 PLCH2O75038 1416 aa24.67■■□□□ 1.54
HERC3-206ENST00000431413 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
HERC3-206ENST00000431413 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.66■■□□□ 1.54
HERC3-206ENST00000431413 CLIP1P30622 1438 aa24.64■■□□□ 1.54
HERC3-206ENST00000431413 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.63■■□□□ 1.53
HERC3-206ENST00000431413 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HERC3-206ENST00000431413 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.6■■□□□ 1.53
HERC3-206ENST00000431413 KIF14Q15058 1648 aa24.59■■□□□ 1.53
HERC3-206ENST00000431413 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.59■■□□□ 1.53
HERC3-206ENST00000431413 RICTORQ6R327 1708 aa24.58■■□□□ 1.53
HERC3-206ENST00000431413 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.58■■□□□ 1.52
HERC3-206ENST00000431413 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.57■■□□□ 1.52
HERC3-206ENST00000431413 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.57■■□□□ 1.52
HERC3-206ENST00000431413 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.56■■□□□ 1.52
HERC3-206ENST00000431413 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.54■■□□□ 1.52
HERC3-206ENST00000431413 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.53■■□□□ 1.52
HERC3-206ENST00000431413 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.53■■□□□ 1.52
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