RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428610.5

PHYHD1-210, Transcript of phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PHYHD1, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1-210ENST00000428610 IGF1RP08069 1367 aa22.86■■□□□ 1.25
PHYHD1-210ENST00000428610 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.77■■□□□ 1.24
PHYHD1-210ENST00000428610 JPH4Q96JJ6 628 aa22.76■■□□□ 1.23
PHYHD1-210ENST00000428610 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.75■■□□□ 1.23
PHYHD1-210ENST00000428610 IQGAP2Q13576 1575 aa22.69■■□□□ 1.22
PHYHD1-210ENST00000428610 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.68■■□□□ 1.22
PHYHD1-210ENST00000428610 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.64■■□□□ 1.21
PHYHD1-210ENST00000428610 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.61■■□□□ 1.21
PHYHD1-210ENST00000428610 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.58■■□□□ 1.2
PHYHD1-210ENST00000428610 MAPKBP1O60336 1514 aa22.56■■□□□ 1.2
PHYHD1-210ENST00000428610 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.53■■□□□ 1.2
PHYHD1-210ENST00000428610 DISP1Q96F81 1524 aa22.52■■□□□ 1.2
PHYHD1-210ENST00000428610 DIP2BQ9P265 1576 aa22.52■■□□□ 1.2
PHYHD1-210ENST00000428610 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PHYHD1-210ENST00000428610 KIAA0556O60303 1618 aa22.51■■□□□ 1.19
PHYHD1-210ENST00000428610 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.5■■□□□ 1.19
PHYHD1-210ENST00000428610 PTPRGP23470 1445 aa22.49■■□□□ 1.19
PHYHD1-210ENST00000428610 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.49■■□□□ 1.19
PHYHD1-210ENST00000428610 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.47■■□□□ 1.19
PHYHD1-210ENST00000428610 PRXQ9BXM0 1461 aa22.43■■□□□ 1.18
PHYHD1-210ENST00000428610 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
PHYHD1-210ENST00000428610 ABCC2Q92887 1545 aa22.41■■□□□ 1.18
PHYHD1-210ENST00000428610 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.36■■□□□ 1.17
PHYHD1-210ENST00000428610 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.36■■□□□ 1.17
PHYHD1-210ENST00000428610 UACAQ9BZF9 1416 aa22.36■■□□□ 1.17
PHYHD1-210ENST00000428610 TSPOAP1O95153 1857 aa22.36■■□□□ 1.17
PHYHD1-210ENST00000428610 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PHYHD1-210ENST00000428610 ASXL2Q76L83 1435 aa22.31■■□□□ 1.16
PHYHD1-210ENST00000428610 GOLGA3Q08378 1498 aa22.3■■□□□ 1.16
PHYHD1-210ENST00000428610 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.28■■□□□ 1.16
PHYHD1-210ENST00000428610 KDM6BO15054 1643 aa22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1-210ENST00000428610 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.27■■□□□ 1.16
PHYHD1-210ENST00000428610 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1-210ENST00000428610 ABCA8O94911 1581 aa22.25■■□□□ 1.15
PHYHD1-210ENST00000428610 EEA1Q15075 1411 aa22.23■■□□□ 1.15
PHYHD1-210ENST00000428610 GLI2P10070 1586 aa22.23■■□□□ 1.15
PHYHD1-210ENST00000428610 SAMD9Q5K651 1589 aa22.21■■□□□ 1.15
PHYHD1-210ENST00000428610 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.2■■□□□ 1.14
PHYHD1-210ENST00000428610 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PHYHD1-210ENST00000428610 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.18■■□□□ 1.14
PHYHD1-210ENST00000428610 KIF21BO75037 1637 aa22.16■■□□□ 1.14
PHYHD1-210ENST00000428610 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.15■■□□□ 1.14
PHYHD1-210ENST00000428610 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PHYHD1-210ENST00000428610 P3H3Q8IVL6 736 aa22.1■■□□□ 1.13
PHYHD1-210ENST00000428610 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.08■■□□□ 1.13
PHYHD1-210ENST00000428610 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.04■■□□□ 1.12
PHYHD1-210ENST00000428610 ARID3CA6NKF2 412 aa22.04■■□□□ 1.12
PHYHD1-210ENST00000428610 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PHYHD1-210ENST00000428610 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PHYHD1-210ENST00000428610 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.04■■□□□ 1.12
PHYHD1-210ENST00000428610 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.03■■□□□ 1.12
PHYHD1-210ENST00000428610 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.01■■□□□ 1.11
PHYHD1-210ENST00000428610 EFCAB5A4FU69 1503 aa22■■□□□ 1.11
PHYHD1-210ENST00000428610 ATP10BO94823 1461 aa21.98■■□□□ 1.11
PHYHD1-210ENST00000428610 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PHYHD1-210ENST00000428610 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.96■■□□□ 1.11
PHYHD1-210ENST00000428610 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PHYHD1-210ENST00000428610 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1-210ENST00000428610 CD109Q6YHK3 1445 aa21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1-210ENST00000428610 KCNH8Q96L42 1107 aa21.93■■□□□ 1.1
PHYHD1-210ENST00000428610 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.91■■□□□ 1.1
PHYHD1-210ENST00000428610 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PHYHD1-210ENST00000428610 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PHYHD1-210ENST00000428610 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PHYHD1-210ENST00000428610 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PHYHD1-210ENST00000428610 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.81■■□□□ 1.08
PHYHD1-210ENST00000428610 ADGRL1O94910 1474 aa21.8■■□□□ 1.08
PHYHD1-210ENST00000428610 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.79■■□□□ 1.08
PHYHD1-210ENST00000428610 HECW1Q76N89 1606 aa21.79■■□□□ 1.08
PHYHD1-210ENST00000428610 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.77■■□□□ 1.08
PHYHD1-210ENST00000428610 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.73■■□□□ 1.07
PHYHD1-210ENST00000428610 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.73■■□□□ 1.07
PHYHD1-210ENST00000428610 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1-210ENST00000428610 FMN1Q68DA7 1419 aa21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1-210ENST00000428610 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.71■■□□□ 1.07
PHYHD1-210ENST00000428610 NEO1Q92859 1461 aa21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1-210ENST00000428610 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PHYHD1-210ENST00000428610 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.69■■□□□ 1.06
PHYHD1-210ENST00000428610 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.65■■□□□ 1.06
PHYHD1-210ENST00000428610 KIF14Q15058 1648 aa21.64■■□□□ 1.05
PHYHD1-210ENST00000428610 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PHYHD1-210ENST00000428610 RICTORQ6R327 1708 aa21.63■■□□□ 1.05
PHYHD1-210ENST00000428610 FANCAO15360 1455 aa21.62■■□□□ 1.05
PHYHD1-210ENST00000428610 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.61■■□□□ 1.05
PHYHD1-210ENST00000428610 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.6■■□□□ 1.05
PHYHD1-210ENST00000428610 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.6■■□□□ 1.05
PHYHD1-210ENST00000428610 RAPGEF3O95398 923 aa21.58■■□□□ 1.05
PHYHD1-210ENST00000428610 AKNAQ7Z591 1439 aa21.55■■□□□ 1.04
PHYHD1-210ENST00000428610 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PHYHD1-210ENST00000428610 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PHYHD1-210ENST00000428610 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.52■■□□□ 1.04
PHYHD1-210ENST00000428610 CLIP1P30622 1438 aa21.52■■□□□ 1.04
PHYHD1-210ENST00000428610 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.52■■□□□ 1.04
PHYHD1-210ENST00000428610 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.52■■□□□ 1.03
PHYHD1-210ENST00000428610 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.51■■□□□ 1.03
PHYHD1-210ENST00000428610 PLCH2O75038 1416 aa21.49■■□□□ 1.03
PHYHD1-210ENST00000428610 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.49■■□□□ 1.03
PHYHD1-210ENST00000428610 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1-210ENST00000428610 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1-210ENST00000428610 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms