RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428331.6

ATP2C1-204, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP2C1, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1-204ENST00000428331 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
ATP2C1-204ENST00000428331 P3H3Q8IVL6 736 aa15.01□□□□□ -0.01
ATP2C1-204ENST00000428331 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATP2C1-204ENST00000428331 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.99□□□□□ -0.01
ATP2C1-204ENST00000428331 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
ATP2C1-204ENST00000428331 CUX2O14529 1486 aa14.96□□□□□ -0.02
ATP2C1-204ENST00000428331 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATP2C1-204ENST00000428331 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.95□□□□□ -0.02
ATP2C1-204ENST00000428331 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.94□□□□□ -0.02
ATP2C1-204ENST00000428331 BCL11AQ9H165 835 aa14.94□□□□□ -0.02
ATP2C1-204ENST00000428331 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.93□□□□□ -0.02
ATP2C1-204ENST00000428331 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.92□□□□□ -0.02
ATP2C1-204ENST00000428331 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.86□□□□□ -0.03
ATP2C1-204ENST00000428331 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.84□□□□□ -0.03
ATP2C1-204ENST00000428331 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.84□□□□□ -0.03
ATP2C1-204ENST00000428331 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ATP2C1-204ENST00000428331 IGF1RP08069 1367 aa14.83□□□□□ -0.03
ATP2C1-204ENST00000428331 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.83□□□□□ -0.03
ATP2C1-204ENST00000428331 WDR97A6NE52 1622 aa14.83□□□□□ -0.04
ATP2C1-204ENST00000428331 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.83□□□□□ -0.04
ATP2C1-204ENST00000428331 CUX1P39880 1505 aa14.83□□□□□ -0.04
ATP2C1-204ENST00000428331 MAPKBP1O60336 1514 aa14.81□□□□□ -0.04
ATP2C1-204ENST00000428331 TIAM1Q13009 1591 aa14.81□□□□□ -0.04
ATP2C1-204ENST00000428331 MAP3K1Q13233 1512 aa14.81□□□□□ -0.04
ATP2C1-204ENST00000428331 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.8□□□□□ -0.04
ATP2C1-204ENST00000428331 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
ATP2C1-204ENST00000428331 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.78□□□□□ -0.04
ATP2C1-204ENST00000428331 NCAPD3P42695 1498 aa14.78□□□□□ -0.04
ATP2C1-204ENST00000428331 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.76□□□□□ -0.05
ATP2C1-204ENST00000428331 CFTRP13569 1480 aa14.75□□□□□ -0.05
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ATP2C1-204ENST00000428331 MRS2Q9HD23 443 aa14.73□□□□□ -0.05
ATP2C1-204ENST00000428331 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP2C1-204ENST00000428331 HMGXB3Q12766 1538 aa14.71□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 FMN1Q68DA7 1419 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 UACAQ9BZF9 1416 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP2C1-204ENST00000428331 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP2C1-204ENST00000428331 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP2C1-204ENST00000428331 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP2C1-204ENST00000428331 MSH5O43196 834 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP2C1-204ENST00000428331 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.61□□□□□ -0.07
ATP2C1-204ENST00000428331 HFM1A2PYH4 1435 aa14.6□□□□□ -0.07
ATP2C1-204ENST00000428331 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATP2C1-204ENST00000428331 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.58□□□□□ -0.07
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ATP2C1-204ENST00000428331 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATP2C1-204ENST00000428331 NBR1Q14596 966 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C1-204ENST00000428331 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.57□□□□□ -0.08
ATP2C1-204ENST00000428331 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.56□□□□□ -0.08
ATP2C1-204ENST00000428331 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATP2C1-204ENST00000428331 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C1-204ENST00000428331 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 32.8
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ATP2C1-204ENST00000428331 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.55□□□□□ -0.08
ATP2C1-204ENST00000428331 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.55□□□□□ -0.08
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ATP2C1-204ENST00000428331 NAIPQ13075 1403 aa14.52□□□□□ -0.08
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ATP2C1-204ENST00000428331 TMC1Q8TDI8 760 aa14.51□□□□□ -0.09
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ATP2C1-204ENST00000428331 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
ATP2C1-204ENST00000428331 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.41□□□□□ -0.1
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ATP2C1-204ENST00000428331 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.4□□□□□ -0.1
ATP2C1-204ENST00000428331 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
ATP2C1-204ENST00000428331 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
ATP2C1-204ENST00000428331 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
ATP2C1-204ENST00000428331 NCOA1Q15788 1441 aa14.38□□□□□ -0.11
ATP2C1-204ENST00000428331 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
ATP2C1-204ENST00000428331 CUL7Q14999 1698 aa14.36□□□□□ -0.11
ATP2C1-204ENST00000428331 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.36□□□□□ -0.11
ATP2C1-204ENST00000428331 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.35□□□□□ -0.11
ATP2C1-204ENST00000428331 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.35□□□□□ -0.11
ATP2C1-204ENST00000428331 TOPBP1Q92547 1522 aa14.35□□□□□ -0.11
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