RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.24■■■■■ 5.15
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LMO1-202ENST00000428101 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.66■■■■■ 5.06
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LMO1-202ENST00000428101 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.55■■■■■ 5.04
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LMO1-202ENST00000428101 KCNH8Q96L42 1107 aa45.45■■■■■ 4.87
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LMO1-202ENST00000428101 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.44■■■■■ 4.87
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LMO1-202ENST00000428101 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.3■■■■■ 4.68
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LMO1-202ENST00000428101 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.27■■■■■ 4.68
LMO1-202ENST00000428101 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa44.27■■■■■ 4.68
LMO1-202ENST00000428101 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.24■■■■■ 4.67
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