RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.5■■■■■ 5.36
TRIOBP-209ENST00000428075 CUL7Q14999 1698 aa48.43■■■■■ 5.34
TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.32■■■■■ 5.33
TRIOBP-209ENST00000428075 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa48.3■■■■■ 5.32
TRIOBP-209ENST00000428075 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.91■■■■■ 5.26
TRIOBP-209ENST00000428075 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.89■■■■■ 5.26
TRIOBP-209ENST00000428075 IQGAP2Q13576 1575 aa47.87■■■■■ 5.25
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.8■■■■■ 5.24
TRIOBP-209ENST00000428075 PTPRGP23470 1445 aa47.78■■■■■ 5.24
TRIOBP-209ENST00000428075 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.75■■■■■ 5.23
TRIOBP-209ENST00000428075 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.74■■■■■ 5.23
TRIOBP-209ENST00000428075 MAPKBP1O60336 1514 aa47.74■■■■■ 5.23
TRIOBP-209ENST00000428075 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.73■■■■■ 5.23
TRIOBP-209ENST00000428075 DISP1Q96F81 1524 aa47.7■■■■■ 5.23
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.67■■■■■ 5.22
TRIOBP-209ENST00000428075 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
TRIOBP-209ENST00000428075 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.63■■■■■ 5.22
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.59■■■■■ 5.21
TRIOBP-209ENST00000428075 PRXQ9BXM0 1461 aa47.56■■■■■ 5.2
TRIOBP-209ENST00000428075 DIP2BQ9P265 1576 aa47.55■■■■■ 5.2
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCC2Q92887 1545 aa47.49■■■■■ 5.19
TRIOBP-209ENST00000428075 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.46■■■■■ 5.19
TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA0556O60303 1618 aa47.45■■■■■ 5.19
TRIOBP-209ENST00000428075 UACAQ9BZF9 1416 aa47.43■■■■■ 5.18
TRIOBP-209ENST00000428075 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.42■■■■■ 5.18
TRIOBP-209ENST00000428075 ASXL2Q76L83 1435 aa47.29■■■■■ 5.16
TRIOBP-209ENST00000428075 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.25■■■■■ 5.15
TRIOBP-209ENST00000428075 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.25■■■■■ 5.15
TRIOBP-209ENST00000428075 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.22■■■■■ 5.15
TRIOBP-209ENST00000428075 GOLGA3Q08378 1498 aa47.2■■■■■ 5.15
TRIOBP-209ENST00000428075 TSPOAP1O95153 1857 aa47.15■■■■■ 5.14
TRIOBP-209ENST00000428075 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
TRIOBP-209ENST00000428075 GLI2P10070 1586 aa47.11■■■■■ 5.13
TRIOBP-209ENST00000428075 EEA1Q15075 1411 aa47.05■■■■■ 5.12
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCA8O94911 1581 aa47.04■■■■■ 5.12
TRIOBP-209ENST00000428075 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
TRIOBP-209ENST00000428075 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
TRIOBP-209ENST00000428075 KDM6BO15054 1643 aa46.98■■■■■ 5.11
TRIOBP-209ENST00000428075 P3H3Q8IVL6 736 aa46.91■■■■■ 5.1
TRIOBP-209ENST00000428075 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.9■■■■■ 5.1
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.9■■■■■ 5.1
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.87■■■■■ 5.09
TRIOBP-209ENST00000428075 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.86■■■■■ 5.09
TRIOBP-209ENST00000428075 SAMD9Q5K651 1589 aa46.85■■■■■ 5.09
TRIOBP-209ENST00000428075 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.78■■■■■ 5.08
TRIOBP-209ENST00000428075 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.7■■■■■ 5.07
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF21BO75037 1637 aa46.69■■■■■ 5.07
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP10BO94823 1461 aa46.67■■■■■ 5.06
TRIOBP-209ENST00000428075 ARID3CA6NKF2 412 aa46.65■■■■■ 5.06
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNH8Q96L42 1107 aa46.64■■■■■ 5.06
TRIOBP-209ENST00000428075 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.62■■■■■ 5.05
TRIOBP-209ENST00000428075 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.62■■■■■ 5.05
TRIOBP-209ENST00000428075 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.55■■■■■ 5.04
TRIOBP-209ENST00000428075 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.55■■■■■ 5.04
TRIOBP-209ENST00000428075 CD109Q6YHK3 1445 aa46.54■■■■■ 5.04
TRIOBP-209ENST00000428075 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.52■■■■■ 5.04
TRIOBP-209ENST00000428075 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.51■■■■■ 5.04
TRIOBP-209ENST00000428075 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa46.48■■■■■ 5.03
TRIOBP-209ENST00000428075 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
TRIOBP-209ENST00000428075 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.39■■■■■ 5.02
TRIOBP-209ENST00000428075 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.39■■■■■ 5.02
TRIOBP-209ENST00000428075 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.29■■■■■ 5
TRIOBP-209ENST00000428075 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.27■■■■■ 5
TRIOBP-209ENST00000428075 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
TRIOBP-209ENST00000428075 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.14■■■■■ 4.98
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.13■■■■■ 4.98
TRIOBP-209ENST00000428075 ADGRL1O94910 1474 aa46.12■■■■■ 4.97
TRIOBP-209ENST00000428075 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.08■■■■■ 4.97
TRIOBP-209ENST00000428075 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
TRIOBP-209ENST00000428075 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.02■■■■■ 4.96
TRIOBP-209ENST00000428075 NEO1Q92859 1461 aa46■■■■■ 4.95
TRIOBP-209ENST00000428075 FMN1Q68DA7 1419 aa45.97■■■■■ 4.95
TRIOBP-209ENST00000428075 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.93■■■■■ 4.94
TRIOBP-209ENST00000428075 RAPGEF3O95398 923 aa45.91■■■■■ 4.94
TRIOBP-209ENST00000428075 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.86■■■■■ 4.93
TRIOBP-209ENST00000428075 HECW1Q76N89 1606 aa45.85■■■■■ 4.93
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.83■■■■■ 4.93
TRIOBP-209ENST00000428075 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.83■■■■■ 4.93
TRIOBP-209ENST00000428075 FANCAO15360 1455 aa45.75■■■■■ 4.91
TRIOBP-209ENST00000428075 AKNAQ7Z591 1439 aa45.75■■■■■ 4.91
TRIOBP-209ENST00000428075 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.69■■■■■ 4.9
TRIOBP-209ENST00000428075 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
TRIOBP-209ENST00000428075 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.65■■■■■ 4.9
TRIOBP-209ENST00000428075 PLCH2O75038 1416 aa45.64■■■■■ 4.9
TRIOBP-209ENST00000428075 RICTORQ6R327 1708 aa45.63■■■■■ 4.9
TRIOBP-209ENST00000428075 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.61■■■■■ 4.89
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF14Q15058 1648 aa45.59■■■■■ 4.89
TRIOBP-209ENST00000428075 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
TRIOBP-209ENST00000428075 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.58■■■■■ 4.89
TRIOBP-209ENST00000428075 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.5■■■■■ 4.87
TRIOBP-209ENST00000428075 CLIP1P30622 1438 aa45.5■■■■■ 4.87
TRIOBP-209ENST00000428075 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.47■■■■■ 4.87
TRIOBP-209ENST00000428075 ADAMTSL3P82987 1691 aa45.47■■■■■ 4.87
TRIOBP-209ENST00000428075 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.46■■■■■ 4.87
TRIOBP-209ENST00000428075 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.46■■■■■ 4.87
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.42■■■■■ 4.86
TRIOBP-209ENST00000428075 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.42■■■■■ 4.86
TRIOBP-209ENST00000428075 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.41■■■■■ 4.86
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