RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427455.1

HERPUD2-205, Transcript of HERPUD family member 2, humanhuman

TSL 3

Gene HERPUD2, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2-205ENST00000427455 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.09■■■■■ 4.33
HERPUD2-205ENST00000427455 PRXQ9BXM0 1461 aa42.08■■■■■ 4.33
HERPUD2-205ENST00000427455 ARAP1Q96P48 1450 aa42.02■■■■■ 4.32
HERPUD2-205ENST00000427455 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.01■■■■■ 4.32
HERPUD2-205ENST00000427455 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.94■■■■■ 4.3
HERPUD2-205ENST00000427455 JPH4Q96JJ6 628 aa41.94■■■■■ 4.3
HERPUD2-205ENST00000427455 IQGAP2Q13576 1575 aa41.91■■■■■ 4.3
HERPUD2-205ENST00000427455 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
HERPUD2-205ENST00000427455 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
HERPUD2-205ENST00000427455 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.85■■■■■ 4.29
HERPUD2-205ENST00000427455 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.84■■■■■ 4.29
HERPUD2-205ENST00000427455 KIF21BO75037 1637 aa41.76■■■■■ 4.28
HERPUD2-205ENST00000427455 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.68■■■■■ 4.26
HERPUD2-205ENST00000427455 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.63■■■■■ 4.26
HERPUD2-205ENST00000427455 DISP1Q96F81 1524 aa41.57■■■■■ 4.25
HERPUD2-205ENST00000427455 KIAA0556O60303 1618 aa41.51■■■■■ 4.23
HERPUD2-205ENST00000427455 GOLGA3Q08378 1498 aa41.49■■■■■ 4.23
HERPUD2-205ENST00000427455 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.47■■■■■ 4.23
HERPUD2-205ENST00000427455 PTPRGP23470 1445 aa41.41■■■■■ 4.22
HERPUD2-205ENST00000427455 SAMD9Q5K651 1589 aa41.3■■■■■ 4.2
HERPUD2-205ENST00000427455 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.29■■■■■ 4.2
HERPUD2-205ENST00000427455 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.29■■■■■ 4.2
HERPUD2-205ENST00000427455 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
HERPUD2-205ENST00000427455 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
HERPUD2-205ENST00000427455 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.16■■■■■ 4.18
HERPUD2-205ENST00000427455 UACAQ9BZF9 1416 aa41.16■■■■■ 4.18
HERPUD2-205ENST00000427455 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.15■■■■■ 4.18
HERPUD2-205ENST00000427455 ABCC2Q92887 1545 aa41.13■■■■■ 4.17
HERPUD2-205ENST00000427455 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
HERPUD2-205ENST00000427455 P3H3Q8IVL6 736 aa41.08■■■■■ 4.17
HERPUD2-205ENST00000427455 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.16
HERPUD2-205ENST00000427455 ABCA8O94911 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
HERPUD2-205ENST00000427455 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.03■■■■■ 4.16
HERPUD2-205ENST00000427455 MAPKBP1O60336 1514 aa41.02■■■■■ 4.16
HERPUD2-205ENST00000427455 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.01■■■■■ 4.15
HERPUD2-205ENST00000427455 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.94■■■■■ 4.14
HERPUD2-205ENST00000427455 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
HERPUD2-205ENST00000427455 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.92■■■■■ 4.14
HERPUD2-205ENST00000427455 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
HERPUD2-205ENST00000427455 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.85■■■■■ 4.13
HERPUD2-205ENST00000427455 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.77■■■■■ 4.12
HERPUD2-205ENST00000427455 ASXL2Q76L83 1435 aa40.76■■■■■ 4.12
HERPUD2-205ENST00000427455 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.75■■■■■ 4.11
HERPUD2-205ENST00000427455 DIP2BQ9P265 1576 aa40.74■■■■■ 4.11
HERPUD2-205ENST00000427455 FMN1Q68DA7 1419 aa40.74■■■■■ 4.11
HERPUD2-205ENST00000427455 CLIP1P30622 1438 aa40.73■■■■■ 4.11
HERPUD2-205ENST00000427455 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
HERPUD2-205ENST00000427455 ATP10BO94823 1461 aa40.64■■■■■ 4.1
HERPUD2-205ENST00000427455 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.62■■■■■ 4.09
HERPUD2-205ENST00000427455 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.61■■■■■ 4.09
HERPUD2-205ENST00000427455 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.6■■■■■ 4.09
HERPUD2-205ENST00000427455 CEP162Q5TB80 1403 aa40.59■■■■■ 4.09
HERPUD2-205ENST00000427455 ARID3CA6NKF2 412 aa40.58■■■■■ 4.09
HERPUD2-205ENST00000427455 HECW1Q76N89 1606 aa40.56■■■■■ 4.08
HERPUD2-205ENST00000427455 GLI2P10070 1586 aa40.54■■■■■ 4.08
HERPUD2-205ENST00000427455 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
HERPUD2-205ENST00000427455 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
HERPUD2-205ENST00000427455 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
HERPUD2-205ENST00000427455 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
HERPUD2-205ENST00000427455 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.42■■■■■ 4.06
HERPUD2-205ENST00000427455 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
HERPUD2-205ENST00000427455 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
HERPUD2-205ENST00000427455 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.38■■■■■ 4.05
HERPUD2-205ENST00000427455 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.38■■■■■ 4.05
HERPUD2-205ENST00000427455 TSPOAP1O95153 1857 aa40.33■■■■■ 4.05
HERPUD2-205ENST00000427455 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.33■■■■■ 4.05
HERPUD2-205ENST00000427455 KCNH8Q96L42 1107 aa40.32■■■■■ 4.05
HERPUD2-205ENST00000427455 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.3■■■■■ 4.04
HERPUD2-205ENST00000427455 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.29■■■■■ 4.04
HERPUD2-205ENST00000427455 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.27■■■■■ 4.04
HERPUD2-205ENST00000427455 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
HERPUD2-205ENST00000427455 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.23■■■■■ 4.03
HERPUD2-205ENST00000427455 CD109Q6YHK3 1445 aa40.18■■■■■ 4.02
HERPUD2-205ENST00000427455 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
HERPUD2-205ENST00000427455 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.17■■■■■ 4.02
HERPUD2-205ENST00000427455 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.14■■■■■ 4.02
HERPUD2-205ENST00000427455 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.1■■■■■ 4.01
HERPUD2-205ENST00000427455 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
HERPUD2-205ENST00000427455 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 4
HERPUD2-205ENST00000427455 KIF14Q15058 1648 aa40.05■■■■■ 4
HERPUD2-205ENST00000427455 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.04■■■■■ 4
HERPUD2-205ENST00000427455 KDM6BO15054 1643 aa40.04■■■■■ 4
HERPUD2-205ENST00000427455 NEO1Q92859 1461 aa39.87■■■■□ 3.97
HERPUD2-205ENST00000427455 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.86■■■■□ 3.97
HERPUD2-205ENST00000427455 TIAM1Q13009 1591 aa39.84■■■■□ 3.97
HERPUD2-205ENST00000427455 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.84■■■■□ 3.97
HERPUD2-205ENST00000427455 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.83■■■■□ 3.97
HERPUD2-205ENST00000427455 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.83■■■■□ 3.97
HERPUD2-205ENST00000427455 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.83■■■■□ 3.97
HERPUD2-205ENST00000427455 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
HERPUD2-205ENST00000427455 PLCH2O75038 1416 aa39.81■■■■□ 3.96
HERPUD2-205ENST00000427455 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.81■■■■□ 3.96
HERPUD2-205ENST00000427455 FANCAO15360 1455 aa39.8■■■■□ 3.96
HERPUD2-205ENST00000427455 MAP3K1Q13233 1512 aa39.75■■■■□ 3.95
HERPUD2-205ENST00000427455 PREX2Q70Z35 1606 aa39.73■■■■□ 3.95
HERPUD2-205ENST00000427455 AKNAQ7Z591 1439 aa39.69■■■■□ 3.94
HERPUD2-205ENST00000427455 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.68■■■■□ 3.94
HERPUD2-205ENST00000427455 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.67■■■■□ 3.94
HERPUD2-205ENST00000427455 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.65■■■■□ 3.94
HERPUD2-205ENST00000427455 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.64■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.1 ms