RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 SHROOM2Q13796 1616 aa42.15■■■■■ 4.34
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.07■■■■■ 4.33
HTATSF1-202ENST00000425695 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
HTATSF1-202ENST00000425695 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.05■■■■■ 4.32
HTATSF1-202ENST00000425695 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.05■■■■■ 4.32
HTATSF1-202ENST00000425695 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.89■■■■■ 4.3
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
HTATSF1-202ENST00000425695 PRXQ9BXM0 1461 aa41.85■■■■■ 4.29
HTATSF1-202ENST00000425695 IQGAP2Q13576 1575 aa41.81■■■■■ 4.28
HTATSF1-202ENST00000425695 EEA1Q15075 1411 aa41.77■■■■■ 4.28
HTATSF1-202ENST00000425695 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
HTATSF1-202ENST00000425695 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
HTATSF1-202ENST00000425695 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.65■■■■■ 4.26
HTATSF1-202ENST00000425695 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.62■■■■■ 4.25
HTATSF1-202ENST00000425695 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.56■■■■■ 4.24
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPRGP23470 1445 aa41.56■■■■■ 4.24
HTATSF1-202ENST00000425695 DISP1Q96F81 1524 aa41.54■■■■■ 4.24
HTATSF1-202ENST00000425695 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.53■■■■■ 4.24
HTATSF1-202ENST00000425695 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.42■■■■■ 4.22
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA0556O60303 1618 aa41.41■■■■■ 4.22
HTATSF1-202ENST00000425695 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.22
HTATSF1-202ENST00000425695 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.4■■■■■ 4.22
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF21BO75037 1637 aa41.35■■■■■ 4.21
HTATSF1-202ENST00000425695 GOLGA3Q08378 1498 aa41.34■■■■■ 4.21
HTATSF1-202ENST00000425695 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
HTATSF1-202ENST00000425695 P3H3Q8IVL6 736 aa41.28■■■■■ 4.2
HTATSF1-202ENST00000425695 UACAQ9BZF9 1416 aa41.24■■■■■ 4.19
HTATSF1-202ENST00000425695 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
HTATSF1-202ENST00000425695 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.15■■■■■ 4.18
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCC2Q92887 1545 aa41.13■■■■■ 4.18
HTATSF1-202ENST00000425695 MAPKBP1O60336 1514 aa41.1■■■■■ 4.17
HTATSF1-202ENST00000425695 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.09■■■■■ 4.17
HTATSF1-202ENST00000425695 SAMD9Q5K651 1589 aa41.07■■■■■ 4.16
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.03■■■■■ 4.16
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.01■■■■■ 4.16
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.99■■■■■ 4.15
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCA8O94911 1581 aa40.97■■■■■ 4.15
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.97■■■■■ 4.15
HTATSF1-202ENST00000425695 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.93■■■■■ 4.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ASXL2Q76L83 1435 aa40.93■■■■■ 4.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
HTATSF1-202ENST00000425695 DIP2BQ9P265 1576 aa40.9■■■■■ 4.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ARID3CA6NKF2 412 aa40.87■■■■■ 4.13
HTATSF1-202ENST00000425695 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.85■■■■■ 4.13
HTATSF1-202ENST00000425695 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.75■■■■■ 4.11
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.7■■■■■ 4.11
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP10BO94823 1461 aa40.7■■■■■ 4.11
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPOAP1O95153 1857 aa40.69■■■■■ 4.1
HTATSF1-202ENST00000425695 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.66■■■■■ 4.1
HTATSF1-202ENST00000425695 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
HTATSF1-202ENST00000425695 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNH8Q96L42 1107 aa40.66■■■■■ 4.1
HTATSF1-202ENST00000425695 GLI2P10070 1586 aa40.62■■■■■ 4.09
HTATSF1-202ENST00000425695 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
HTATSF1-202ENST00000425695 FMN1Q68DA7 1419 aa40.52■■■■■ 4.08
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.45■■■■■ 4.07
HTATSF1-202ENST00000425695 CLIP1P30622 1438 aa40.44■■■■■ 4.06
HTATSF1-202ENST00000425695 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.43■■■■■ 4.06
HTATSF1-202ENST00000425695 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.38■■■■■ 4.05
HTATSF1-202ENST00000425695 CD109Q6YHK3 1445 aa40.36■■■■■ 4.05
HTATSF1-202ENST00000425695 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
HTATSF1-202ENST00000425695 HECW1Q76N89 1606 aa40.32■■■■■ 4.05
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM6BO15054 1643 aa40.31■■■■■ 4.04
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.31■■■■■ 4.04
HTATSF1-202ENST00000425695 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.28■■■■■ 4.04
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP162Q5TB80 1403 aa40.22■■■■■ 4.03
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.21■■■■■ 4.03
HTATSF1-202ENST00000425695 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
HTATSF1-202ENST00000425695 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.2■■■■■ 4.03
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.2■■■■■ 4.03
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.16■■■■■ 4.02
HTATSF1-202ENST00000425695 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
HTATSF1-202ENST00000425695 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
HTATSF1-202ENST00000425695 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.07■■■■■ 4
HTATSF1-202ENST00000425695 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.05■■■■■ 4
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.02■■■■■ 4
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.99■■■■□ 3.99
HTATSF1-202ENST00000425695 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF14Q15058 1648 aa39.92■■■■□ 3.98
HTATSF1-202ENST00000425695 NEO1Q92859 1461 aa39.89■■■■□ 3.98
HTATSF1-202ENST00000425695 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.89■■■■□ 3.98
HTATSF1-202ENST00000425695 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.87■■■■□ 3.97
HTATSF1-202ENST00000425695 FANCAO15360 1455 aa39.83■■■■□ 3.97
HTATSF1-202ENST00000425695 RAPGEF3O95398 923 aa39.82■■■■□ 3.97
HTATSF1-202ENST00000425695 PLCH2O75038 1416 aa39.82■■■■□ 3.96
HTATSF1-202ENST00000425695 AKNAQ7Z591 1439 aa39.8■■■■□ 3.96
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.77■■■■□ 3.96
HTATSF1-202ENST00000425695 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.74■■■■□ 3.95
HTATSF1-202ENST00000425695 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.73■■■■□ 3.95
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.72■■■■□ 3.95
HTATSF1-202ENST00000425695 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.69■■■■□ 3.94
HTATSF1-202ENST00000425695 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.65■■■■□ 3.94
HTATSF1-202ENST00000425695 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRL1O94910 1474 aa39.62■■■■□ 3.93
HTATSF1-202ENST00000425695 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.61■■■■□ 3.93
HTATSF1-202ENST00000425695 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.61■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms