RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425225.1

SOHLH1-202, Transcript of spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOHLH1, Length 1,411 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1-202ENST00000425225 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41■■■■■ 4.15
SOHLH1-202ENST00000425225 CUL7Q14999 1698 aa40.91■■■■■ 4.14
SOHLH1-202ENST00000425225 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.85■■■■■ 4.13
SOHLH1-202ENST00000425225 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.79■■■■■ 4.12
SOHLH1-202ENST00000425225 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.59■■■■■ 4.09
SOHLH1-202ENST00000425225 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.56■■■■■ 4.08
SOHLH1-202ENST00000425225 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.08
SOHLH1-202ENST00000425225 MAPKBP1O60336 1514 aa40.46■■■■■ 4.07
SOHLH1-202ENST00000425225 IQGAP2Q13576 1575 aa40.45■■■■■ 4.07
SOHLH1-202ENST00000425225 PTPRGP23470 1445 aa40.44■■■■■ 4.06
SOHLH1-202ENST00000425225 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.43■■■■■ 4.06
SOHLH1-202ENST00000425225 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.41■■■■■ 4.06
SOHLH1-202ENST00000425225 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.41■■■■■ 4.06
SOHLH1-202ENST00000425225 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.4■■■■■ 4.06
SOHLH1-202ENST00000425225 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.38■■■■■ 4.05
SOHLH1-202ENST00000425225 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
SOHLH1-202ENST00000425225 DIP2BQ9P265 1576 aa40.31■■■■■ 4.04
SOHLH1-202ENST00000425225 DISP1Q96F81 1524 aa40.3■■■■■ 4.04
SOHLH1-202ENST00000425225 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.23■■■■■ 4.03
SOHLH1-202ENST00000425225 ABCC2Q92887 1545 aa40.19■■■■■ 4.02
SOHLH1-202ENST00000425225 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.15■■■■■ 4.02
SOHLH1-202ENST00000425225 UACAQ9BZF9 1416 aa40.13■■■■■ 4.01
SOHLH1-202ENST00000425225 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
SOHLH1-202ENST00000425225 KIAA0556O60303 1618 aa40.08■■■■■ 4.01
SOHLH1-202ENST00000425225 PRXQ9BXM0 1461 aa40.07■■■■■ 4.01
SOHLH1-202ENST00000425225 TSPOAP1O95153 1857 aa40.05■■■■■ 4
SOHLH1-202ENST00000425225 ASXL2Q76L83 1435 aa40.05■■■■■ 4
SOHLH1-202ENST00000425225 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.04■■■■■ 4
SOHLH1-202ENST00000425225 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.01■■■■■ 4
SOHLH1-202ENST00000425225 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.98■■■■□ 3.99
SOHLH1-202ENST00000425225 GLI2P10070 1586 aa39.91■■■■□ 3.98
SOHLH1-202ENST00000425225 KDM6BO15054 1643 aa39.89■■■■□ 3.98
SOHLH1-202ENST00000425225 GOLGA3Q08378 1498 aa39.88■■■■□ 3.97
SOHLH1-202ENST00000425225 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
SOHLH1-202ENST00000425225 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.82■■■■□ 3.96
SOHLH1-202ENST00000425225 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.96
SOHLH1-202ENST00000425225 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
SOHLH1-202ENST00000425225 ABCA8O94911 1581 aa39.74■■■■□ 3.95
SOHLH1-202ENST00000425225 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.69■■■■□ 3.94
SOHLH1-202ENST00000425225 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.66■■■■□ 3.94
SOHLH1-202ENST00000425225 P3H3Q8IVL6 736 aa39.62■■■■□ 3.93
SOHLH1-202ENST00000425225 EEA1Q15075 1411 aa39.6■■■■□ 3.93
SOHLH1-202ENST00000425225 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
SOHLH1-202ENST00000425225 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.54■■■■□ 3.92
SOHLH1-202ENST00000425225 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.53■■■■□ 3.92
SOHLH1-202ENST00000425225 KCNH8Q96L42 1107 aa39.51■■■■□ 3.92
SOHLH1-202ENST00000425225 SAMD9Q5K651 1589 aa39.51■■■■□ 3.92
SOHLH1-202ENST00000425225 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
SOHLH1-202ENST00000425225 ATP10BO94823 1461 aa39.44■■■■□ 3.9
SOHLH1-202ENST00000425225 CD109Q6YHK3 1445 aa39.43■■■■□ 3.9
SOHLH1-202ENST00000425225 ARID3CA6NKF2 412 aa39.42■■■■□ 3.9
SOHLH1-202ENST00000425225 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.41■■■■□ 3.9
SOHLH1-202ENST00000425225 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.39■■■■□ 3.9
SOHLH1-202ENST00000425225 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
SOHLH1-202ENST00000425225 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.31■■■■□ 3.88
SOHLH1-202ENST00000425225 KIF21BO75037 1637 aa39.29■■■■□ 3.88
SOHLH1-202ENST00000425225 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.26■■■■□ 3.88
SOHLH1-202ENST00000425225 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.24■■■■□ 3.87
SOHLH1-202ENST00000425225 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
SOHLH1-202ENST00000425225 ADGRL1O94910 1474 aa39.17■■■■□ 3.86
SOHLH1-202ENST00000425225 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.15■■■■□ 3.86
SOHLH1-202ENST00000425225 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
SOHLH1-202ENST00000425225 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
SOHLH1-202ENST00000425225 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.11■■■■□ 3.85
SOHLH1-202ENST00000425225 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.09■■■■□ 3.85
SOHLH1-202ENST00000425225 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.05■■■■□ 3.84
SOHLH1-202ENST00000425225 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
SOHLH1-202ENST00000425225 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.01■■■■□ 3.84
SOHLH1-202ENST00000425225 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.98■■■■□ 3.83
SOHLH1-202ENST00000425225 NEO1Q92859 1461 aa38.93■■■■□ 3.82
SOHLH1-202ENST00000425225 RAPGEF3O95398 923 aa38.89■■■■□ 3.82
SOHLH1-202ENST00000425225 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.86■■■■□ 3.81
SOHLH1-202ENST00000425225 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.81
SOHLH1-202ENST00000425225 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.81■■■■□ 3.8
SOHLH1-202ENST00000425225 FMN1Q68DA7 1419 aa38.78■■■■□ 3.8
SOHLH1-202ENST00000425225 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.77■■■■□ 3.8
SOHLH1-202ENST00000425225 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.74■■■■□ 3.79
SOHLH1-202ENST00000425225 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
SOHLH1-202ENST00000425225 AKNAQ7Z591 1439 aa38.71■■■■□ 3.79
SOHLH1-202ENST00000425225 FANCAO15360 1455 aa38.7■■■■□ 3.79
SOHLH1-202ENST00000425225 HECW1Q76N89 1606 aa38.67■■■■□ 3.78
SOHLH1-202ENST00000425225 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
SOHLH1-202ENST00000425225 RICTORQ6R327 1708 aa38.63■■■■□ 3.78
SOHLH1-202ENST00000425225 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.63■■■■□ 3.78
SOHLH1-202ENST00000425225 PLCH2O75038 1416 aa38.59■■■■□ 3.77
SOHLH1-202ENST00000425225 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.58■■■■□ 3.77
SOHLH1-202ENST00000425225 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.77
SOHLH1-202ENST00000425225 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.57■■■■□ 3.76
SOHLH1-202ENST00000425225 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.52■■■■□ 3.76
SOHLH1-202ENST00000425225 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.5■■■■□ 3.75
SOHLH1-202ENST00000425225 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.49■■■■□ 3.75
SOHLH1-202ENST00000425225 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
SOHLH1-202ENST00000425225 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
SOHLH1-202ENST00000425225 KIF14Q15058 1648 aa38.48■■■■□ 3.75
SOHLH1-202ENST00000425225 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.47■■■■□ 3.75
SOHLH1-202ENST00000425225 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.46■■■■□ 3.75
SOHLH1-202ENST00000425225 PTPRMP28827 1452 aa38.45■■■■□ 3.75
SOHLH1-202ENST00000425225 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.44■■■■□ 3.74
SOHLH1-202ENST00000425225 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.44■■■■□ 3.74
SOHLH1-202ENST00000425225 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.41■■■■□ 3.74
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