RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.65■■□□□ 1.86
SPC24-201ENST00000423327 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.62■■□□□ 1.85
SPC24-201ENST00000423327 JPH4Q96JJ6 628 aa26.62■■□□□ 1.85
SPC24-201ENST00000423327 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SPC24-201ENST00000423327 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.48■■□□□ 1.83
SPC24-201ENST00000423327 IQGAP2Q13576 1575 aa26.45■■□□□ 1.82
SPC24-201ENST00000423327 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.37■■□□□ 1.81
SPC24-201ENST00000423327 PRXQ9BXM0 1461 aa26.36■■□□□ 1.81
SPC24-201ENST00000423327 DISP1Q96F81 1524 aa26.33■■□□□ 1.81
SPC24-201ENST00000423327 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.31■■□□□ 1.8
SPC24-201ENST00000423327 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.3■■□□□ 1.8
SPC24-201ENST00000423327 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.27■■□□□ 1.8
SPC24-201ENST00000423327 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.26■■□□□ 1.79
SPC24-201ENST00000423327 PTPRGP23470 1445 aa26.25■■□□□ 1.79
SPC24-201ENST00000423327 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.25■■□□□ 1.79
SPC24-201ENST00000423327 KIAA0556O60303 1618 aa26.24■■□□□ 1.79
SPC24-201ENST00000423327 MAPKBP1O60336 1514 aa26.23■■□□□ 1.79
SPC24-201ENST00000423327 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SPC24-201ENST00000423327 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.14■■□□□ 1.78
SPC24-201ENST00000423327 EEA1Q15075 1411 aa26.14■■□□□ 1.77
SPC24-201ENST00000423327 DIP2BQ9P265 1576 aa26.13■■□□□ 1.77
SPC24-201ENST00000423327 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.13■■□□□ 1.77
SPC24-201ENST00000423327 ABCC2Q92887 1545 aa26.12■■□□□ 1.77
SPC24-201ENST00000423327 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.11■■□□□ 1.77
SPC24-201ENST00000423327 UACAQ9BZF9 1416 aa26.09■■□□□ 1.77
SPC24-201ENST00000423327 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
SPC24-201ENST00000423327 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.07■■□□□ 1.76
SPC24-201ENST00000423327 GOLGA3Q08378 1498 aa26.04■■□□□ 1.76
SPC24-201ENST00000423327 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.01■■□□□ 1.75
SPC24-201ENST00000423327 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.01■■□□□ 1.75
SPC24-201ENST00000423327 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SPC24-201ENST00000423327 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.99■■□□□ 1.75
SPC24-201ENST00000423327 ASXL2Q76L83 1435 aa25.98■■□□□ 1.75
SPC24-201ENST00000423327 KIF21BO75037 1637 aa25.98■■□□□ 1.75
SPC24-201ENST00000423327 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SPC24-201ENST00000423327 ABCA8O94911 1581 aa25.97■■□□□ 1.75
SPC24-201ENST00000423327 SAMD9Q5K651 1589 aa25.97■■□□□ 1.75
SPC24-201ENST00000423327 TSPOAP1O95153 1857 aa25.89■■□□□ 1.73
SPC24-201ENST00000423327 GLI2P10070 1586 aa25.88■■□□□ 1.73
SPC24-201ENST00000423327 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SPC24-201ENST00000423327 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SPC24-201ENST00000423327 P3H3Q8IVL6 736 aa25.85■■□□□ 1.73
SPC24-201ENST00000423327 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.79■■□□□ 1.72
SPC24-201ENST00000423327 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.78■■□□□ 1.72
SPC24-201ENST00000423327 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.77■■□□□ 1.72
SPC24-201ENST00000423327 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.75■■□□□ 1.71
SPC24-201ENST00000423327 KDM6BO15054 1643 aa25.74■■□□□ 1.71
SPC24-201ENST00000423327 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SPC24-201ENST00000423327 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.73■■□□□ 1.71
SPC24-201ENST00000423327 ATP10BO94823 1461 aa25.72■■□□□ 1.71
SPC24-201ENST00000423327 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.7■■□□□ 1.7
SPC24-201ENST00000423327 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SPC24-201ENST00000423327 ARID3CA6NKF2 412 aa25.67■■□□□ 1.7
SPC24-201ENST00000423327 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.63■■□□□ 1.69
SPC24-201ENST00000423327 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
SPC24-201ENST00000423327 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.6■■□□□ 1.69
SPC24-201ENST00000423327 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SPC24-201ENST00000423327 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.58■■□□□ 1.69
SPC24-201ENST00000423327 KCNH8Q96L42 1107 aa25.57■■□□□ 1.68
SPC24-201ENST00000423327 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.56■■□□□ 1.68
SPC24-201ENST00000423327 CD109Q6YHK3 1445 aa25.55■■□□□ 1.68
SPC24-201ENST00000423327 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.53■■□□□ 1.68
SPC24-201ENST00000423327 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SPC24-201ENST00000423327 FMN1Q68DA7 1419 aa25.44■■□□□ 1.66
SPC24-201ENST00000423327 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SPC24-201ENST00000423327 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SPC24-201ENST00000423327 HECW1Q76N89 1606 aa25.42■■□□□ 1.66
SPC24-201ENST00000423327 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.39■■□□□ 1.65
SPC24-201ENST00000423327 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
SPC24-201ENST00000423327 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.35■■□□□ 1.65
SPC24-201ENST00000423327 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.35■■□□□ 1.65
SPC24-201ENST00000423327 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.34■■□□□ 1.65
SPC24-201ENST00000423327 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SPC24-201ENST00000423327 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SPC24-201ENST00000423327 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.31■■□□□ 1.64
SPC24-201ENST00000423327 NEO1Q92859 1461 aa25.29■■□□□ 1.64
SPC24-201ENST00000423327 CLIP1P30622 1438 aa25.28■■□□□ 1.64
SPC24-201ENST00000423327 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.27■■□□□ 1.64
SPC24-201ENST00000423327 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SPC24-201ENST00000423327 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.25■■□□□ 1.63
SPC24-201ENST00000423327 KIF14Q15058 1648 aa25.24■■□□□ 1.63
SPC24-201ENST00000423327 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.24■■□□□ 1.63
SPC24-201ENST00000423327 ADGRL1O94910 1474 aa25.21■■□□□ 1.63
SPC24-201ENST00000423327 FANCAO15360 1455 aa25.2■■□□□ 1.62
SPC24-201ENST00000423327 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SPC24-201ENST00000423327 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.18■■□□□ 1.62
SPC24-201ENST00000423327 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.18■■□□□ 1.62
SPC24-201ENST00000423327 RAPGEF3O95398 923 aa25.17■■□□□ 1.62
SPC24-201ENST00000423327 RICTORQ6R327 1708 aa25.17■■□□□ 1.62
SPC24-201ENST00000423327 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.16■■□□□ 1.62
SPC24-201ENST00000423327 AKNAQ7Z591 1439 aa25.16■■□□□ 1.62
SPC24-201ENST00000423327 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.15■■□□□ 1.62
SPC24-201ENST00000423327 PLCH2O75038 1416 aa25.14■■□□□ 1.62
SPC24-201ENST00000423327 CEP162Q5TB80 1403 aa25.12■■□□□ 1.61
SPC24-201ENST00000423327 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SPC24-201ENST00000423327 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SPC24-201ENST00000423327 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.07■■□□□ 1.6
SPC24-201ENST00000423327 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.06■■□□□ 1.6
SPC24-201ENST00000423327 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.04■■□□□ 1.6
SPC24-201ENST00000423327 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.03■■□□□ 1.6
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