RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422770.5

HERC3-204, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-204ENST00000422770 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.2■□□□□ 0.18
HERC3-204ENST00000422770 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC3-204ENST00000422770 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
HERC3-204ENST00000422770 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC3-204ENST00000422770 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
HERC3-204ENST00000422770 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC3-204ENST00000422770 IQGAP2Q13576 1575 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC3-204ENST00000422770 JPH4Q96JJ6 628 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC3-204ENST00000422770 EEA1Q15075 1411 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-204ENST00000422770 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-204ENST00000422770 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HERC3-204ENST00000422770 PRXQ9BXM0 1461 aa16.08■□□□□ 0.16
HERC3-204ENST00000422770 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.05■□□□□ 0.16
HERC3-204ENST00000422770 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.04■□□□□ 0.16
HERC3-204ENST00000422770 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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HERC3-204ENST00000422770 KIAA0556O60303 1618 aa16■□□□□ 0.15
HERC3-204ENST00000422770 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.99■□□□□ 0.15
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HERC3-204ENST00000422770 DISP1Q96F81 1524 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-204ENST00000422770 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.97■□□□□ 0.15
HERC3-204ENST00000422770 PTPRGP23470 1445 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-204ENST00000422770 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.96■□□□□ 0.15
HERC3-204ENST00000422770 GOLGA3Q08378 1498 aa15.95■□□□□ 0.14
HERC3-204ENST00000422770 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
HERC3-204ENST00000422770 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
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HERC3-204ENST00000422770 SAMD9Q5K651 1589 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-204ENST00000422770 UACAQ9BZF9 1416 aa15.85■□□□□ 0.13
HERC3-204ENST00000422770 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.84■□□□□ 0.13
HERC3-204ENST00000422770 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
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HERC3-204ENST00000422770 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-204ENST00000422770 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-204ENST00000422770 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-204ENST00000422770 TSPOAP1O95153 1857 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-204ENST00000422770 ABCA8O94911 1581 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-204ENST00000422770 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-204ENST00000422770 ARID3CA6NKF2 412 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-204ENST00000422770 DIP2BQ9P265 1576 aa15.76■□□□□ 0.11
HERC3-204ENST00000422770 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-204ENST00000422770 ASXL2Q76L83 1435 aa15.74■□□□□ 0.11
HERC3-204ENST00000422770 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.73■□□□□ 0.11
HERC3-204ENST00000422770 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.73■□□□□ 0.11
HERC3-204ENST00000422770 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
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HERC3-204ENST00000422770 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.68■□□□□ 0.1
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HERC3-204ENST00000422770 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.66■□□□□ 0.1
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HERC3-204ENST00000422770 KCNH8Q96L42 1107 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-204ENST00000422770 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-204ENST00000422770 FMN1Q68DA7 1419 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-204ENST00000422770 ATP10BO94823 1461 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-204ENST00000422770 GLI2P10070 1586 aa15.62■□□□□ 0.09
HERC3-204ENST00000422770 CLIP1P30622 1438 aa15.61■□□□□ 0.09
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HERC3-204ENST00000422770 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HERC3-204ENST00000422770 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.59■□□□□ 0.09
HERC3-204ENST00000422770 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
HERC3-204ENST00000422770 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
HERC3-204ENST00000422770 KDM6BO15054 1643 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-204ENST00000422770 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.57■□□□□ 0.08
HERC3-204ENST00000422770 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.56■□□□□ 0.08
HERC3-204ENST00000422770 CEP162Q5TB80 1403 aa15.54■□□□□ 0.08
HERC3-204ENST00000422770 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
HERC3-204ENST00000422770 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.52■□□□□ 0.08
HERC3-204ENST00000422770 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.52■□□□□ 0.08
HERC3-204ENST00000422770 CD109Q6YHK3 1445 aa15.51■□□□□ 0.07
HERC3-204ENST00000422770 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.51■□□□□ 0.07
HERC3-204ENST00000422770 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-204ENST00000422770 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.48■□□□□ 0.07
HERC3-204ENST00000422770 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.47■□□□□ 0.07
HERC3-204ENST00000422770 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.46■□□□□ 0.07
HERC3-204ENST00000422770 KIF14Q15058 1648 aa15.46■□□□□ 0.06
HERC3-204ENST00000422770 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
HERC3-204ENST00000422770 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-204ENST00000422770 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.44■□□□□ 0.06
HERC3-204ENST00000422770 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
HERC3-204ENST00000422770 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.41■□□□□ 0.06
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HERC3-204ENST00000422770 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HERC3-204ENST00000422770 NEO1Q92859 1461 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-204ENST00000422770 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-204ENST00000422770 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.34■□□□□ 0.05
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HERC3-204ENST00000422770 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.32■□□□□ 0.04
HERC3-204ENST00000422770 PREX2Q70Z35 1606 aa15.32■□□□□ 0.04
HERC3-204ENST00000422770 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC3-204ENST00000422770 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.31■□□□□ 0.04
HERC3-204ENST00000422770 AKNAQ7Z591 1439 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-204ENST00000422770 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.3■□□□□ 0.04
HERC3-204ENST00000422770 PLCH2O75038 1416 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-204ENST00000422770 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-204ENST00000422770 RICTORQ6R327 1708 aa15.29■□□□□ 0.04
HERC3-204ENST00000422770 TIAM1Q13009 1591 aa15.28■□□□□ 0.04
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