RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR97A6NE52 1622 aa27.66■■■□□ 2.02
SH3BP1-202ENST00000417536 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.65■■■□□ 2.02
SH3BP1-202ENST00000417536 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.022e-6■■■■■ 30.4
SH3BP1-202ENST00000417536 MIER1Q8N108 512 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP1-202ENST00000417536 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP1-202ENST00000417536 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
SH3BP1-202ENST00000417536 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
SH3BP1-202ENST00000417536 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
SH3BP1-202ENST00000417536 CUL7Q14999 1698 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP1-202ENST00000417536 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR62O43379 1518 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP1-202ENST00000417536 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP1-202ENST00000417536 PBRM1Q86U86 1689 aa27.39■■□□□ 1.98
SH3BP1-202ENST00000417536 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SH3BP1-202ENST00000417536 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SH3BP1-202ENST00000417536 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP1-202ENST00000417536 FBLN2P98095 1184 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP1-202ENST00000417536 IFT140Q96RY7 1462 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGAEP38570 1179 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.28■■□□□ 1.96
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP1-202ENST00000417536 GRIN2BQ13224 1484 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP1-202ENST00000417536 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP1-202ENST00000417536 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ARID3CA6NKF2 412 aa27.23■■□□□ 1.95
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS12P58397 1594 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP1-202ENST00000417536 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.2■■□□□ 1.95
SH3BP1-202ENST00000417536 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SH3BP1-202ENST00000417536 TIAM1Q13009 1591 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.08■■□□□ 1.92
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP1-202ENST00000417536 IQGAP2Q13576 1575 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP1-202ENST00000417536 SAMD9Q5K651 1589 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K1Q13233 1512 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP1-202ENST00000417536 GRIN2AQ12879 1464 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP1-202ENST00000417536 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPKBP1O60336 1514 aa26.96■■□□□ 1.91
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
SH3BP1-202ENST00000417536 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.95■■□□□ 1.91
SH3BP1-202ENST00000417536 FMN1Q68DA7 1419 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP1-202ENST00000417536 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP170Q5SW79 1584 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNJ2O15056 1496 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP1-202ENST00000417536 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.85■■□□□ 1.89
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.84■■□□□ 1.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SH3BP1-202ENST00000417536 DISP1Q96F81 1524 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP1-202ENST00000417536 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BP1-202ENST00000417536 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0556O60303 1618 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1-202ENST00000417536 JPH4Q96JJ6 628 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNH8Q96L42 1107 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SH3BP1-202ENST00000417536 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SH3BP1-202ENST00000417536 CHD1O14646 1710 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP1-202ENST00000417536 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP1-202ENST00000417536 NUP160Q12769 1436 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP1-202ENST00000417536 NCOA2Q15596 1464 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP1-202ENST00000417536 HECW1Q76N89 1606 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP1-202ENST00000417536 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SH3BP1-202ENST00000417536 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
SH3BP1-202ENST00000417536 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1-202ENST00000417536 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1-202ENST00000417536 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP1-202ENST00000417536 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP1-202ENST00000417536 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SH3BP1-202ENST00000417536 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP1-202ENST00000417536 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.53■■□□□ 1.84
SH3BP1-202ENST00000417536 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SH3BP1-202ENST00000417536 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP1-202ENST00000417536 MYT1Q01538 1121 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP1-202ENST00000417536 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPRKQ15262 1439 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP1-202ENST00000417536 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP1-202ENST00000417536 TONSLQ96HA7 1378 aa26.45■■□□□ 1.83
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SH3BP1-202ENST00000417536 HFM1A2PYH4 1435 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP1-202ENST00000417536 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP1-202ENST00000417536 UACAQ9BZF9 1416 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP1-202ENST00000417536 ANP32CO43423 234 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPRGP23470 1445 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF11O15085 1522 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP1-202ENST00000417536 BCANQ96GW7 911 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP1-202ENST00000417536 NAIPQ13075 1403 aa26.35■■□□□ 1.81
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