RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
SH3BP4-204ENST00000416021 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.5■■■■□ 3.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SHROOM2Q13796 1616 aa35.48■■■■□ 3.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.48■■■■□ 3.27
SH3BP4-204ENST00000416021 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.47■■■■□ 3.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.39■■■■□ 3.26
SH3BP4-204ENST00000416021 PRXQ9BXM0 1461 aa35.3■■■■□ 3.24
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
SH3BP4-204ENST00000416021 EEA1Q15075 1411 aa35.23■■■■□ 3.23
SH3BP4-204ENST00000416021 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
SH3BP4-204ENST00000416021 IQGAP2Q13576 1575 aa35.19■■■■□ 3.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.16■■■■□ 3.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRGP23470 1445 aa35.11■■■■□ 3.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.09■■■■□ 3.21
SH3BP4-204ENST00000416021 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.04■■■■□ 3.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DISP1Q96F81 1524 aa35.03■■■■□ 3.2
SH3BP4-204ENST00000416021 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.03■■■■□ 3.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.9■■■■□ 3.18
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGA3Q08378 1498 aa34.87■■■■□ 3.17
SH3BP4-204ENST00000416021 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.85■■■■□ 3.17
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0556O60303 1618 aa34.84■■■■□ 3.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.84■■■■□ 3.17
SH3BP4-204ENST00000416021 UACAQ9BZF9 1416 aa34.82■■■■□ 3.17
SH3BP4-204ENST00000416021 P3H3Q8IVL6 736 aa34.82■■■■□ 3.16
SH3BP4-204ENST00000416021 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF21BO75037 1637 aa34.77■■■■□ 3.16
SH3BP4-204ENST00000416021 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
SH3BP4-204ENST00000416021 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.74■■■■□ 3.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC2Q92887 1545 aa34.71■■■■□ 3.15
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.69■■■■□ 3.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MAPKBP1O60336 1514 aa34.67■■■■□ 3.14
SH3BP4-204ENST00000416021 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.64■■■■□ 3.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.61■■■■□ 3.13
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.57■■■■□ 3.12
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMD9Q5K651 1589 aa34.55■■■■□ 3.12
SH3BP4-204ENST00000416021 ASXL2Q76L83 1435 aa34.55■■■■□ 3.12
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCA8O94911 1581 aa34.52■■■■□ 3.12
SH3BP4-204ENST00000416021 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.48■■■■□ 3.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ARID3CA6NKF2 412 aa34.45■■■■□ 3.11
SH3BP4-204ENST00000416021 DIP2BQ9P265 1576 aa34.43■■■■□ 3.1
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.43■■■■□ 3.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SH3BP4-204ENST00000416021 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.4■■■■□ 3.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP10BO94823 1461 aa34.34■■■■□ 3.09
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNH8Q96L42 1107 aa34.34■■■■□ 3.09
SH3BP4-204ENST00000416021 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.3■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.3■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 GLI2P10070 1586 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
SH3BP4-204ENST00000416021 FMN1Q68DA7 1419 aa34.19■■■■□ 3.06
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.15■■■■□ 3.06
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPOAP1O95153 1857 aa34.12■■■■□ 3.05
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.1■■■■□ 3.05
SH3BP4-204ENST00000416021 CD109Q6YHK3 1445 aa34.09■■■■□ 3.05
SH3BP4-204ENST00000416021 CLIP1P30622 1438 aa34.08■■■■□ 3.05
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.04■■■■□ 3.04
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX14Q8IWB6 1497 aa34■■■■□ 3.03
SH3BP4-204ENST00000416021 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.95■■■■□ 3.03
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM6BO15054 1643 aa33.93■■■■□ 3.02
SH3BP4-204ENST00000416021 HECW1Q76N89 1606 aa33.91■■■■□ 3.02
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.9■■■■□ 3.02
SH3BP4-204ENST00000416021 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.9■■■■□ 3.02
SH3BP4-204ENST00000416021 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP162Q5TB80 1403 aa33.87■■■■□ 3.01
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.84■■■■□ 3.01
SH3BP4-204ENST00000416021 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.76■■■■□ 3
SH3BP4-204ENST00000416021 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
SH3BP4-204ENST00000416021 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.75■■■□□ 2.99
SH3BP4-204ENST00000416021 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.74■■■□□ 2.99
SH3BP4-204ENST00000416021 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.72■■■□□ 2.99
SH3BP4-204ENST00000416021 NEO1Q92859 1461 aa33.68■■■□□ 2.98
SH3BP4-204ENST00000416021 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.67■■■□□ 2.98
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.65■■■□□ 2.98
SH3BP4-204ENST00000416021 RAPGEF3O95398 923 aa33.64■■■□□ 2.98
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCH2O75038 1416 aa33.63■■■□□ 2.97
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.62■■■□□ 2.97
SH3BP4-204ENST00000416021 FANCAO15360 1455 aa33.6■■■□□ 2.97
SH3BP4-204ENST00000416021 AKNAQ7Z591 1439 aa33.6■■■□□ 2.97
SH3BP4-204ENST00000416021 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.59■■■□□ 2.97
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF14Q15058 1648 aa33.54■■■□□ 2.96
SH3BP4-204ENST00000416021 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
SH3BP4-204ENST00000416021 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
SH3BP4-204ENST00000416021 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.47■■■□□ 2.95
SH3BP4-204ENST00000416021 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.46■■■□□ 2.95
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.46■■■□□ 2.95
SH3BP4-204ENST00000416021 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.44■■■□□ 2.94
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.43■■■□□ 2.94
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRL1O94910 1474 aa33.4■■■□□ 2.94
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.39■■■□□ 2.94
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms