RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412471.5

SLC5A6-204, Transcript of solute carrier family 5 member 6, humanhuman

TSL 5

Gene SLC5A6, Length 917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6-204ENST00000412471 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.17■■■■■ 5.46
SLC5A6-204ENST00000412471 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.14■■■■■ 5.46
SLC5A6-204ENST00000412471 JPH4Q96JJ6 628 aa49.11■■■■■ 5.45
SLC5A6-204ENST00000412471 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.07■■■■■ 5.45
SLC5A6-204ENST00000412471 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.06■■■■■ 5.44
SLC5A6-204ENST00000412471 EEA1Q15075 1411 aa49■■■■■ 5.44
SLC5A6-204ENST00000412471 PRXQ9BXM0 1461 aa48.99■■■■■ 5.43
SLC5A6-204ENST00000412471 IQGAP2Q13576 1575 aa48.92■■■■■ 5.42
SLC5A6-204ENST00000412471 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.88■■■■■ 5.42
SLC5A6-204ENST00000412471 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.75■■■■■ 5.39
SLC5A6-204ENST00000412471 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.67■■■■■ 5.38
SLC5A6-204ENST00000412471 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.65■■■■■ 5.38
SLC5A6-204ENST00000412471 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.63■■■■■ 5.38
SLC5A6-204ENST00000412471 DISP1Q96F81 1524 aa48.55■■■■■ 5.36
SLC5A6-204ENST00000412471 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.51■■■■■ 5.36
SLC5A6-204ENST00000412471 KIF21BO75037 1637 aa48.5■■■■■ 5.35
SLC5A6-204ENST00000412471 PTPRGP23470 1445 aa48.47■■■■■ 5.35
SLC5A6-204ENST00000412471 KIAA0556O60303 1618 aa48.45■■■■■ 5.35
SLC5A6-204ENST00000412471 GOLGA3Q08378 1498 aa48.39■■■■■ 5.34
SLC5A6-204ENST00000412471 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.35■■■■■ 5.33
SLC5A6-204ENST00000412471 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.29■■■■■ 5.32
SLC5A6-204ENST00000412471 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.29■■■■■ 5.32
SLC5A6-204ENST00000412471 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.19■■■■■ 5.3
SLC5A6-204ENST00000412471 UACAQ9BZF9 1416 aa48.15■■■■■ 5.3
SLC5A6-204ENST00000412471 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.15■■■■■ 5.3
SLC5A6-204ENST00000412471 SAMD9Q5K651 1589 aa48.11■■■■■ 5.29
SLC5A6-204ENST00000412471 ABCC2Q92887 1545 aa48.1■■■■■ 5.29
SLC5A6-204ENST00000412471 MAPKBP1O60336 1514 aa48.09■■■■■ 5.29
SLC5A6-204ENST00000412471 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
SLC5A6-204ENST00000412471 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.97■■■■■ 5.27
SLC5A6-204ENST00000412471 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.93■■■■■ 5.26
SLC5A6-204ENST00000412471 P3H3Q8IVL6 736 aa47.93■■■■■ 5.26
SLC5A6-204ENST00000412471 ABCA8O94911 1581 aa47.92■■■■■ 5.26
SLC5A6-204ENST00000412471 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.91■■■■■ 5.26
SLC5A6-204ENST00000412471 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.91■■■■■ 5.26
SLC5A6-204ENST00000412471 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.88■■■■■ 5.26
SLC5A6-204ENST00000412471 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.86■■■■■ 5.25
SLC5A6-204ENST00000412471 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.85■■■■■ 5.25
SLC5A6-204ENST00000412471 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
SLC5A6-204ENST00000412471 DIP2BQ9P265 1576 aa47.79■■■■■ 5.24
SLC5A6-204ENST00000412471 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.77■■■■■ 5.24
SLC5A6-204ENST00000412471 ASXL2Q76L83 1435 aa47.75■■■■■ 5.23
SLC5A6-204ENST00000412471 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.69■■■■■ 5.22
SLC5A6-204ENST00000412471 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.66■■■■■ 5.22
SLC5A6-204ENST00000412471 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.59■■■■■ 5.21
SLC5A6-204ENST00000412471 GLI2P10070 1586 aa47.53■■■■■ 5.2
SLC5A6-204ENST00000412471 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.53■■■■■ 5.2
SLC5A6-204ENST00000412471 ATP10BO94823 1461 aa47.49■■■■■ 5.19
SLC5A6-204ENST00000412471 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
SLC5A6-204ENST00000412471 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
SLC5A6-204ENST00000412471 FMN1Q68DA7 1419 aa47.44■■■■■ 5.18
SLC5A6-204ENST00000412471 ARID3CA6NKF2 412 aa47.41■■■■■ 5.18
SLC5A6-204ENST00000412471 TSPOAP1O95153 1857 aa47.34■■■■■ 5.17
SLC5A6-204ENST00000412471 CLIP1P30622 1438 aa47.3■■■■■ 5.16
SLC5A6-204ENST00000412471 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.29■■■■■ 5.16
SLC5A6-204ENST00000412471 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.25■■■■■ 5.15
SLC5A6-204ENST00000412471 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
SLC5A6-204ENST00000412471 HECW1Q76N89 1606 aa47.24■■■■■ 5.15
SLC5A6-204ENST00000412471 KCNH8Q96L42 1107 aa47.21■■■■■ 5.15
SLC5A6-204ENST00000412471 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
SLC5A6-204ENST00000412471 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.17■■■■■ 5.14
SLC5A6-204ENST00000412471 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
SLC5A6-204ENST00000412471 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.09■■■■■ 5.13
SLC5A6-204ENST00000412471 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.08■■■■■ 5.13
SLC5A6-204ENST00000412471 CD109Q6YHK3 1445 aa47.07■■■■■ 5.13
SLC5A6-204ENST00000412471 CEP162Q5TB80 1403 aa47.06■■■■■ 5.12
SLC5A6-204ENST00000412471 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.06■■■■■ 5.12
SLC5A6-204ENST00000412471 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
SLC5A6-204ENST00000412471 KDM6BO15054 1643 aa47.05■■■■■ 5.12
SLC5A6-204ENST00000412471 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa47.05■■■■■ 5.12
SLC5A6-204ENST00000412471 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.04■■■■■ 5.12
SLC5A6-204ENST00000412471 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.02■■■■■ 5.12
SLC5A6-204ENST00000412471 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47■■■■■ 5.11
SLC5A6-204ENST00000412471 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.95■■■■■ 5.11
SLC5A6-204ENST00000412471 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.93■■■■■ 5.1
SLC5A6-204ENST00000412471 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.9■■■■■ 5.1
SLC5A6-204ENST00000412471 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.89■■■■■ 5.1
SLC5A6-204ENST00000412471 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.79■■■■■ 5.08
SLC5A6-204ENST00000412471 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.76■■■■■ 5.08
SLC5A6-204ENST00000412471 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.74■■■■■ 5.07
SLC5A6-204ENST00000412471 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.73■■■■■ 5.07
SLC5A6-204ENST00000412471 KIF14Q15058 1648 aa46.68■■■■■ 5.06
SLC5A6-204ENST00000412471 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.67■■■■■ 5.06
SLC5A6-204ENST00000412471 NEO1Q92859 1461 aa46.67■■■■■ 5.06
SLC5A6-204ENST00000412471 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.61■■■■■ 5.05
SLC5A6-204ENST00000412471 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.56■■■■■ 5.04
SLC5A6-204ENST00000412471 FANCAO15360 1455 aa46.52■■■■■ 5.04
SLC5A6-204ENST00000412471 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.52■■■■■ 5.04
SLC5A6-204ENST00000412471 PLCH2O75038 1416 aa46.52■■■■■ 5.04
SLC5A6-204ENST00000412471 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.52■■■■■ 5.04
SLC5A6-204ENST00000412471 AKNAQ7Z591 1439 aa46.43■■■■■ 5.02
SLC5A6-204ENST00000412471 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.36■■■■■ 5.01
SLC5A6-204ENST00000412471 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.33■■■■■ 5.01
SLC5A6-204ENST00000412471 ARHGAP5Q13017 1502 aa46.32■■■■■ 5.01
SLC5A6-204ENST00000412471 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.32■■■■■ 5.01
SLC5A6-204ENST00000412471 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.31■■■■■ 5
SLC5A6-204ENST00000412471 PREX2Q70Z35 1606 aa46.31■■■■■ 5
SLC5A6-204ENST00000412471 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.3■■■■■ 5
SLC5A6-204ENST00000412471 ADGRL1O94910 1474 aa46.28■■■■■ 5
SLC5A6-204ENST00000412471 RAPGEF3O95398 923 aa46.28■■■■■ 5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms