RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412425.1

RAB6C-AS1-201, RAB6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB6C-AS1, Length 2,454 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.43□□□□□ -0.74
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.41□□□□□ -0.74
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IL27Q8NEV9 243 aa10.4□□□□□ -0.74
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MROH2BQ7Z745 1585 aa10.4□□□□□ -0.74
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.39□□□□□ -0.75
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ARHGEF11O15085 1522 aa10.38□□□□□ -0.75
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.38□□□□□ -0.75
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MIER1Q8N108 512 aa10.31□□□□□ -0.76
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IFT140Q96RY7 1462 aa10.29□□□□□ -0.76
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ARAP1Q96P48 1450 aa10.24□□□□□ -0.77
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PRDM2Q13029 1718 aa10.24□□□□□ -0.77
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.23□□□□□ -0.77
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ABCC8Q09428 1581 aa10.18□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CHD1O14646 1710 aa10.18□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10.17□□□□□ -0.78
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.16□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NBR1Q14596 966 aa10.16□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BCANQ96GW7 911 aa10.15□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TOPBP1Q92547 1522 aa10.15□□□□□ -0.78
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.12□□□□□ -0.79
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FKBP8Q14318 412 aa10.11□□□□□ -0.79
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.1□□□□□ -0.79
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 WDR97A6NE52 1622 aa10.09□□□□□ -0.79
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.05□□□□□ -0.8
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 WASHC2AQ641Q2 1341 aa10.03□□□□□ -0.8
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ITGAEP38570 1179 aa10□□□□□ -0.81
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10□□□□□ -0.81
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FAM43AQ8N2R8 423 aa10□□□□□ -0.81
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCDC88BA6NC98 1476 aa10□□□□□ -0.81
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.99□□□□□ -0.81
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.98□□□□□ -0.81
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 USP35Q9P2H5 1018 aa9.97□□□□□ -0.81
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SYNJ2O15056 1496 aa9.96□□□□□ -0.81
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RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SOGA1O94964 1423 aa9.95□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.93□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.93□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NEFMP07197 916 aa9.93□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 STAC3Q96MF2 364 aa9.9□□□□□ -0.83
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.89□□□□□ -0.83
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.89□□□□□ -0.83
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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