RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 NUP160Q12769 1436 aa28.95■■■□□ 2.22
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SH3BP5-203ENST00000408919 IQGAP2Q13576 1575 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP5-203ENST00000408919 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
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SH3BP5-203ENST00000408919 CEP162Q5TB80 1403 aa28.77■■■□□ 2.2
SH3BP5-203ENST00000408919 OSCARQ8IYS5 282 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BP5-203ENST00000408919 CLIP1P30622 1438 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP5-203ENST00000408919 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BP5-203ENST00000408919 SHROOM2Q13796 1616 aa28.67■■■□□ 2.18
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SH3BP5-203ENST00000408919 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.65■■■□□ 2.18
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SH3BP5-203ENST00000408919 P3H3Q8IVL6 736 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 KIAA0556O60303 1618 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.55■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 ARAP1Q96P48 1450 aa28.54■■■□□ 2.16
SH3BP5-203ENST00000408919 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.52■■■□□ 2.16
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SH3BP5-203ENST00000408919 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
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SH3BP5-203ENST00000408919 ARHGEF11O15085 1522 aa28.34■■■□□ 2.13
SH3BP5-203ENST00000408919 FMN1Q68DA7 1419 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 PTPRGP23470 1445 aa28.29■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.28■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.28■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.28■■■□□ 2.12
SH3BP5-203ENST00000408919 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
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SH3BP5-203ENST00000408919 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.19■■■□□ 2.1
SH3BP5-203ENST00000408919 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.18■■■□□ 2.1
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SH3BP5-203ENST00000408919 HECW1Q76N89 1606 aa28.12■■■□□ 2.09
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SH3BP5-203ENST00000408919 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.07■■■□□ 2.08
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SH3BP5-203ENST00000408919 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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SH3BP5-203ENST00000408919 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SH3BP5-203ENST00000408919 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.03■■■□□ 2.08
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SH3BP5-203ENST00000408919 ATP10BO94823 1461 aa27.97■■■□□ 2.07
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SH3BP5-203ENST00000408919 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.86■■■□□ 2.05
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SH3BP5-203ENST00000408919 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
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SH3BP5-203ENST00000408919 KIF14Q15058 1648 aa27.71■■■□□ 2.03
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SH3BP5-203ENST00000408919 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.45■■□□□ 1.98
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SH3BP5-203ENST00000408919 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-203ENST00000408919 GLI2P10070 1586 aa27.41■■□□□ 1.98
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SH3BP5-203ENST00000408919 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP5-203ENST00000408919 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.37■■□□□ 1.97
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SH3BP5-203ENST00000408919 MIA2Q96PC5 1412 aa27.35■■□□□ 1.97
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