RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 SHROOM2Q13796 1616 aa30.83■■■□□ 2.53
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PTPRN2-204ENST00000404321 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.34■■■□□ 2.29
PTPRN2-204ENST00000404321 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
PTPRN2-204ENST00000404321 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.3■■■□□ 2.28
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PTPRN2-204ENST00000404321 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.02■■■□□ 2.24
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PTPRN2-204ENST00000404321 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRN2-204ENST00000404321 ADGRL1O94910 1474 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRN2-204ENST00000404321 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.98■■■□□ 2.23
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PTPRN2-204ENST00000404321 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.94■■■□□ 2.22
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