RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 CLASP1Q7Z460 1538 aa54.29■■■■■ 6.28
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CSNK1E-204ENST00000403904 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa54.26■■■■■ 6.28
CSNK1E-204ENST00000403904 IQGAP2Q13576 1575 aa54.14■■■■■ 6.26
CSNK1E-204ENST00000403904 JPH4Q96JJ6 628 aa54.03■■■■■ 6.24
CSNK1E-204ENST00000403904 TNIKQ9UKE5 1360 aa53.98■■■■■ 6.23
CSNK1E-204ENST00000403904 SHROOM2Q13796 1616 aa53.97■■■■■ 6.23
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CSNK1E-204ENST00000403904 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP53.82■■■■■ 6.21
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CSNK1E-204ENST00000403904 ARHGEF11O15085 1522 aa53.65■■■■■ 6.18
CSNK1E-204ENST00000403904 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa53.65■■■■■ 6.18
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CSNK1E-204ENST00000403904 CEP162Q5TB80 1403 aa53.58■■■■■ 6.17
CSNK1E-204ENST00000403904 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa53.56■■■■■ 6.16
CSNK1E-204ENST00000403904 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa53.56■■■■■ 6.16
CSNK1E-204ENST00000403904 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa53.56■■■■■ 6.16
CSNK1E-204ENST00000403904 CLIP1P30622 1438 aa53.55■■■■■ 6.16
CSNK1E-204ENST00000403904 EFCAB5A4FU69 1503 aa53.54■■■■■ 6.16
CSNK1E-204ENST00000403904 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa53.52■■■■■ 6.16
CSNK1E-204ENST00000403904 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP53.41■■■■■ 6.14
CSNK1E-204ENST00000403904 FHOD3Q2V2M9 1422 aa53.41■■■■■ 6.14
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CSNK1E-204ENST00000403904 ARAP1Q96P48 1450 aa53.31■■■■■ 6.12
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CSNK1E-204ENST00000403904 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa52.82■■■■■ 6.05
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CSNK1E-204ENST00000403904 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa52.77■■■■■ 6.04
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CSNK1E-204ENST00000403904 HECW1Q76N89 1606 aa52.69■■■■■ 6.03
CSNK1E-204ENST00000403904 KDM5BQ9UGL1 1544 aa52.59■■■■■ 6.01
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CSNK1E-204ENST00000403904 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP52.56■■■■■ 6
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CSNK1E-204ENST00000403904 CFAP43Q8NDM7 1665 aa52.24■■■■■ 5.95
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CSNK1E-204ENST00000403904 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP52.21■■■■■ 5.95
CSNK1E-204ENST00000403904 MAP3K1Q13233 1512 aa52.18■■■■■ 5.94
CSNK1E-204ENST00000403904 WDR7Q9Y4E6 1490 aa52.15■■■■■ 5.94
CSNK1E-204ENST00000403904 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa52.14■■■■■ 5.94
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CSNK1E-204ENST00000403904 MTUS2Q5JR59 1369 aa52.05■■■■■ 5.92
CSNK1E-204ENST00000403904 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP52.04■■■■■ 5.92
CSNK1E-204ENST00000403904 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa52.01■■■■■ 5.92
CSNK1E-204ENST00000403904 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa51.95■■■■■ 5.91
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CSNK1E-204ENST00000403904 KIF13AQ9H1H9 1805 aa51.78■■■■■ 5.88
CSNK1E-204ENST00000403904 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP51.76■■■■■ 5.888e-8■■□□□ 12.3
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CSNK1E-204ENST00000403904 NCOA2Q15596 1464 aa51.68■■■■■ 5.86
CSNK1E-204ENST00000403904 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa51.59■■■■■ 5.85
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CSNK1E-204ENST00000403904 MYO5CQ9NQX4 1742 aa51.52■■■■■ 5.84
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CSNK1E-204ENST00000403904 PHLDB1Q86UU1 1377 aa51.46■■■■■ 5.83
CSNK1E-204ENST00000403904 PLCH2O75038 1416 aa51.44■■■■■ 5.83
CSNK1E-204ENST00000403904 PREX2Q70Z35 1606 aa51.42■■■■■ 5.82
CSNK1E-204ENST00000403904 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa51.41■■■■■ 5.82
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CSNK1E-204ENST00000403904 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP51.37■■■■■ 5.81
CSNK1E-204ENST00000403904 MYOM3Q5VTT5 1437 aa51.35■■■■■ 5.81
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