RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403027.6

CNOT8-202, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-202ENST00000403027 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.44■■□□□ 1.34
CNOT8-202ENST00000403027 ITGAEP38570 1179 aa23.42■■□□□ 1.34
CNOT8-202ENST00000403027 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
CNOT8-202ENST00000403027 TIAM1Q13009 1591 aa23.41■■□□□ 1.34
CNOT8-202ENST00000403027 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.41■■□□□ 1.34
CNOT8-202ENST00000403027 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CNOT8-202ENST00000403027 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CNOT8-202ENST00000403027 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.36■■□□□ 1.33
CNOT8-202ENST00000403027 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.334e-10■■■■■ 49.3
CNOT8-202ENST00000403027 MAP3K1Q13233 1512 aa23.35■■□□□ 1.33
CNOT8-202ENST00000403027 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CNOT8-202ENST00000403027 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.34■■□□□ 1.33
CNOT8-202ENST00000403027 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CNOT8-202ENST00000403027 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.31■■□□□ 1.32
CNOT8-202ENST00000403027 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.31■■□□□ 1.32
CNOT8-202ENST00000403027 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.31■■□□□ 1.32
CNOT8-202ENST00000403027 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CNOT8-202ENST00000403027 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.27■■□□□ 1.32
CNOT8-202ENST00000403027 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.24■■□□□ 1.31
CNOT8-202ENST00000403027 FMN1Q68DA7 1419 aa23.23■■□□□ 1.31
CNOT8-202ENST00000403027 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CNOT8-202ENST00000403027 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.2■■□□□ 1.3
CNOT8-202ENST00000403027 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.18■■□□□ 1.3
CNOT8-202ENST00000403027 NEUROD1Q13562 356 aa23.17■■□□□ 1.3
CNOT8-202ENST00000403027 SAMD9Q5K651 1589 aa23.17■■□□□ 1.3
CNOT8-202ENST00000403027 PBRM1Q86U86 1689 aa23.17■■□□□ 1.3
CNOT8-202ENST00000403027 GRIN2BQ13224 1484 aa23.14■■□□□ 1.3
CNOT8-202ENST00000403027 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.14■■□□□ 1.29
CNOT8-202ENST00000403027 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.13■■□□□ 1.29
CNOT8-202ENST00000403027 WDR62O43379 1518 aa23.12■■□□□ 1.29
CNOT8-202ENST00000403027 IFT140Q96RY7 1462 aa23.12■■□□□ 1.29
CNOT8-202ENST00000403027 ERCC6Q03468 1493 aa23.11■■□□□ 1.29
CNOT8-202ENST00000403027 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.1■■□□□ 1.29
CNOT8-202ENST00000403027 ADAMTS12P58397 1594 aa23.09■■□□□ 1.29
CNOT8-202ENST00000403027 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CNOT8-202ENST00000403027 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.05■■□□□ 1.28
CNOT8-202ENST00000403027 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CNOT8-202ENST00000403027 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.04■■□□□ 1.28
CNOT8-202ENST00000403027 IQGAP2Q13576 1575 aa23.03■■□□□ 1.28
CNOT8-202ENST00000403027 ARID3CA6NKF2 412 aa23.02■■□□□ 1.28
CNOT8-202ENST00000403027 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.99■■□□□ 1.27
CNOT8-202ENST00000403027 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
CNOT8-202ENST00000403027 NCOA2Q15596 1464 aa22.95■■□□□ 1.27
CNOT8-202ENST00000403027 FBLN2P98095 1184 aa22.94■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.93■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 MIER1Q8N108 512 aa22.92■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 MAPKBP1O60336 1514 aa22.92■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.91■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.9■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 GRIN2AQ12879 1464 aa22.9■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 PTPRKQ15262 1439 aa22.89■■□□□ 1.26
CNOT8-202ENST00000403027 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.89■■□□□ 1.25
CNOT8-202ENST00000403027 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.89■■□□□ 1.25
CNOT8-202ENST00000403027 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.88■■□□□ 1.25
CNOT8-202ENST00000403027 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CNOT8-202ENST00000403027 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CNOT8-202ENST00000403027 DISP1Q96F81 1524 aa22.85■■□□□ 1.25
CNOT8-202ENST00000403027 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.85■■□□□ 1.25
CNOT8-202ENST00000403027 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.85■■□□□ 1.25
CNOT8-202ENST00000403027 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CNOT8-202ENST00000403027 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CNOT8-202ENST00000403027 HECW1Q76N89 1606 aa22.83■■□□□ 1.24
CNOT8-202ENST00000403027 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CNOT8-202ENST00000403027 ARHGEF11O15085 1522 aa22.79■■□□□ 1.24
CNOT8-202ENST00000403027 KIAA0556O60303 1618 aa22.78■■□□□ 1.24
CNOT8-202ENST00000403027 SYNJ2O15056 1496 aa22.78■■□□□ 1.24
CNOT8-202ENST00000403027 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.78■■□□□ 1.24
CNOT8-202ENST00000403027 MYT1Q01538 1121 aa22.77■■□□□ 1.24
CNOT8-202ENST00000403027 CEP170Q5SW79 1584 aa22.75■■□□□ 1.23
CNOT8-202ENST00000403027 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.75■■□□□ 1.23
CNOT8-202ENST00000403027 HFM1A2PYH4 1435 aa22.75■■□□□ 1.23
CNOT8-202ENST00000403027 JPH4Q96JJ6 628 aa22.74■■□□□ 1.23
CNOT8-202ENST00000403027 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.74■■□□□ 1.23
CNOT8-202ENST00000403027 NAIPQ13075 1403 aa22.72■■□□□ 1.23
CNOT8-202ENST00000403027 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CNOT8-202ENST00000403027 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.66■■□□□ 1.22
CNOT8-202ENST00000403027 NUP160Q12769 1436 aa22.66■■□□□ 1.22
CNOT8-202ENST00000403027 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CNOT8-202ENST00000403027 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.64■■□□□ 1.22
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CNOT8-202ENST00000403027 UACAQ9BZF9 1416 aa22.63■■□□□ 1.21
CNOT8-202ENST00000403027 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CNOT8-202ENST00000403027 MIA2Q96PC5 1412 aa22.62■■□□□ 1.21
CNOT8-202ENST00000403027 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CNOT8-202ENST00000403027 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.59■■□□□ 1.21
CNOT8-202ENST00000403027 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CNOT8-202ENST00000403027 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.58■■□□□ 1.21
CNOT8-202ENST00000403027 TRIM52Q96A61 297 aa22.56■■□□□ 1.2
CNOT8-202ENST00000403027 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CNOT8-202ENST00000403027 KDM6BO15054 1643 aa22.52■■□□□ 1.19
CNOT8-202ENST00000403027 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CNOT8-202ENST00000403027 TONSLQ96HA7 1378 aa22.5■■□□□ 1.19
CNOT8-202ENST00000403027 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CNOT8-202ENST00000403027 ABCC5O15440 1437 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms