RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399687.3

ABCD1P4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene ABCD1P4, Length 604 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P4-201ENST00000399687 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD1P4-201ENST00000399687 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P4-201ENST00000399687 PRXQ9BXM0 1461 aa22.76■■□□□ 1.23
ABCD1P4-201ENST00000399687 IQGAP2Q13576 1575 aa22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P4-201ENST00000399687 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P4-201ENST00000399687 KIF21BO75037 1637 aa22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P4-201ENST00000399687 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P4-201ENST00000399687 JPH4Q96JJ6 628 aa22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P4-201ENST00000399687 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P4-201ENST00000399687 ARAP1Q96P48 1450 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P4-201ENST00000399687 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P4-201ENST00000399687 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.57■■□□□ 1.2
ABCD1P4-201ENST00000399687 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P4-201ENST00000399687 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P4-201ENST00000399687 GOLGA3Q08378 1498 aa22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P4-201ENST00000399687 KIAA0556O60303 1618 aa22.48■■□□□ 1.19
ABCD1P4-201ENST00000399687 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P4-201ENST00000399687 DISP1Q96F81 1524 aa22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P4-201ENST00000399687 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P4-201ENST00000399687 PTPRGP23470 1445 aa22.4■■□□□ 1.18
ABCD1P4-201ENST00000399687 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.39■■□□□ 1.17
ABCD1P4-201ENST00000399687 SAMD9Q5K651 1589 aa22.37■■□□□ 1.17
ABCD1P4-201ENST00000399687 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.3■■□□□ 1.16
ABCD1P4-201ENST00000399687 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P4-201ENST00000399687 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.29■■□□□ 1.16
ABCD1P4-201ENST00000399687 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
ABCD1P4-201ENST00000399687 UACAQ9BZF9 1416 aa22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P4-201ENST00000399687 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.27■■□□□ 1.16
ABCD1P4-201ENST00000399687 ABCC2Q92887 1545 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCD1P4-201ENST00000399687 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ABCD1P4-201ENST00000399687 MAPKBP1O60336 1514 aa22.2■■□□□ 1.14
ABCD1P4-201ENST00000399687 ABCA8O94911 1581 aa22.18■■□□□ 1.14
ABCD1P4-201ENST00000399687 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P4-201ENST00000399687 P3H3Q8IVL6 736 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCD1P4-201ENST00000399687 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P4-201ENST00000399687 FMN1Q68DA7 1419 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P4-201ENST00000399687 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCD1P4-201ENST00000399687 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.14■■□□□ 1.13
ABCD1P4-201ENST00000399687 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCD1P4-201ENST00000399687 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ABCD1P4-201ENST00000399687 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P4-201ENST00000399687 CLIP1P30622 1438 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD1P4-201ENST00000399687 HECW1Q76N89 1606 aa22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P4-201ENST00000399687 CEP162Q5TB80 1403 aa22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P4-201ENST00000399687 ASXL2Q76L83 1435 aa22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P4-201ENST00000399687 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P4-201ENST00000399687 DIP2BQ9P265 1576 aa22.01■■□□□ 1.11
ABCD1P4-201ENST00000399687 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22■■□□□ 1.11
ABCD1P4-201ENST00000399687 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P4-201ENST00000399687 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD1P4-201ENST00000399687 ATP10BO94823 1461 aa21.95■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.95■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 GLI2P10070 1586 aa21.93■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.92■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.92■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.92■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P4-201ENST00000399687 ARID3CA6NKF2 412 aa21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P4-201ENST00000399687 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P4-201ENST00000399687 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P4-201ENST00000399687 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD1P4-201ENST00000399687 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ABCD1P4-201ENST00000399687 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD1P4-201ENST00000399687 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD1P4-201ENST00000399687 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD1P4-201ENST00000399687 TSPOAP1O95153 1857 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD1P4-201ENST00000399687 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCD1P4-201ENST00000399687 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P4-201ENST00000399687 KCNH8Q96L42 1107 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P4-201ENST00000399687 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCD1P4-201ENST00000399687 KIF14Q15058 1648 aa21.77■■□□□ 1.08
ABCD1P4-201ENST00000399687 CD109Q6YHK3 1445 aa21.73■■□□□ 1.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.71■■□□□ 1.07
ABCD1P4-201ENST00000399687 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P4-201ENST00000399687 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
ABCD1P4-201ENST00000399687 KDM6BO15054 1643 aa21.67■■□□□ 1.06
ABCD1P4-201ENST00000399687 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
ABCD1P4-201ENST00000399687 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.66■■□□□ 1.06
ABCD1P4-201ENST00000399687 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.65■■□□□ 1.06
ABCD1P4-201ENST00000399687 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.65■■□□□ 1.06
ABCD1P4-201ENST00000399687 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.64■■□□□ 1.06
ABCD1P4-201ENST00000399687 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.63■■□□□ 1.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 TIAM1Q13009 1591 aa21.63■■□□□ 1.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 APLP2Q06481 763 aa21.62■■□□□ 1.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 MAP3K1Q13233 1512 aa21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 NEO1Q92859 1461 aa21.61■■□□□ 1.05
ABCD1P4-201ENST00000399687 FANCAO15360 1455 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 PREX2Q70Z35 1606 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 PLCH2O75038 1416 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD1P4-201ENST00000399687 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.5■■□□□ 1.03
ABCD1P4-201ENST00000399687 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.49■■□□□ 1.03
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