RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399683.7

C20orf27-204, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2

Gene C20orf27, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-204ENST00000399683 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.15■■□□□ 1.94
C20orf27-204ENST00000399683 IQGAP2Q13576 1575 aa27.14■■□□□ 1.94
C20orf27-204ENST00000399683 GOLGA3Q08378 1498 aa27.13■■□□□ 1.93
C20orf27-204ENST00000399683 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.99■■□□□ 1.91
C20orf27-204ENST00000399683 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.98■■□□□ 1.91
C20orf27-204ENST00000399683 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.98■■□□□ 1.91
C20orf27-204ENST00000399683 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.98■■□□□ 1.91
C20orf27-204ENST00000399683 ARHGEF11O15085 1522 aa26.97■■□□□ 1.91
C20orf27-204ENST00000399683 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.96■■□□□ 1.91
C20orf27-204ENST00000399683 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.91■■□□□ 1.9
C20orf27-204ENST00000399683 JPH4Q96JJ6 628 aa26.89■■□□□ 1.9
C20orf27-204ENST00000399683 KIAA0556O60303 1618 aa26.88■■□□□ 1.89
C20orf27-204ENST00000399683 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
C20orf27-204ENST00000399683 SAMD9Q5K651 1589 aa26.88■■□□□ 1.89
C20orf27-204ENST00000399683 DISP1Q96F81 1524 aa26.85■■□□□ 1.89
C20orf27-204ENST00000399683 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
C20orf27-204ENST00000399683 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.83■■□□□ 1.89
C20orf27-204ENST00000399683 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
C20orf27-204ENST00000399683 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.81■■□□□ 1.88
C20orf27-204ENST00000399683 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.81■■□□□ 1.88
C20orf27-204ENST00000399683 ARAP1Q96P48 1450 aa26.77■■□□□ 1.88
C20orf27-204ENST00000399683 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.66■■□□□ 1.86
C20orf27-204ENST00000399683 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.65■■□□□ 1.86
C20orf27-204ENST00000399683 CLIP1P30622 1438 aa26.61■■□□□ 1.85
C20orf27-204ENST00000399683 CEP162Q5TB80 1403 aa26.61■■□□□ 1.85
C20orf27-204ENST00000399683 PTPRGP23470 1445 aa26.59■■□□□ 1.85
C20orf27-204ENST00000399683 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.58■■□□□ 1.85
C20orf27-204ENST00000399683 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
C20orf27-204ENST00000399683 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.55■■□□□ 1.84
C20orf27-204ENST00000399683 ABCA8O94911 1581 aa26.54■■□□□ 1.84
C20orf27-204ENST00000399683 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.51■■□□□ 1.83
C20orf27-204ENST00000399683 ABCC2Q92887 1545 aa26.51■■□□□ 1.83
C20orf27-204ENST00000399683 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.5■■□□□ 1.83
C20orf27-204ENST00000399683 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.49■■□□□ 1.83
C20orf27-204ENST00000399683 P3H3Q8IVL6 736 aa26.49■■□□□ 1.83
C20orf27-204ENST00000399683 FMN1Q68DA7 1419 aa26.48■■□□□ 1.83
C20orf27-204ENST00000399683 UACAQ9BZF9 1416 aa26.48■■□□□ 1.83
C20orf27-204ENST00000399683 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.45■■□□□ 1.82
C20orf27-204ENST00000399683 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
C20orf27-204ENST00000399683 HECW1Q76N89 1606 aa26.41■■□□□ 1.82
C20orf27-204ENST00000399683 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
C20orf27-204ENST00000399683 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
C20orf27-204ENST00000399683 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.36■■□□□ 1.81
C20orf27-204ENST00000399683 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.36■■□□□ 1.81
C20orf27-204ENST00000399683 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
C20orf27-204ENST00000399683 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.34■■□□□ 1.81
C20orf27-204ENST00000399683 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.32■■□□□ 1.8
C20orf27-204ENST00000399683 MAPKBP1O60336 1514 aa26.3■■□□□ 1.8
C20orf27-204ENST00000399683 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.28■■□□□ 1.8
C20orf27-204ENST00000399683 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
C20orf27-204ENST00000399683 ATP10BO94823 1461 aa26.22■■□□□ 1.79
C20orf27-204ENST00000399683 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.22■■□□□ 1.79
C20orf27-204ENST00000399683 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.21■■□□□ 1.79
C20orf27-204ENST00000399683 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
C20orf27-204ENST00000399683 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
C20orf27-204ENST00000399683 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.15■■□□□ 1.78
C20orf27-204ENST00000399683 ASXL2Q76L83 1435 aa26.14■■□□□ 1.77
C20orf27-204ENST00000399683 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.12■■□□□ 1.77
C20orf27-204ENST00000399683 DIP2BQ9P265 1576 aa26.11■■□□□ 1.77
C20orf27-204ENST00000399683 TIAM1Q13009 1591 aa26.08■■□□□ 1.77
C20orf27-204ENST00000399683 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
C20orf27-204ENST00000399683 MAP3K1Q13233 1512 aa26.07■■□□□ 1.76
C20orf27-204ENST00000399683 ARID3CA6NKF2 412 aa26.06■■□□□ 1.76
C20orf27-204ENST00000399683 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.04■■□□□ 1.76
C20orf27-204ENST00000399683 GLI2P10070 1586 aa26.03■■□□□ 1.76
C20orf27-204ENST00000399683 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.01■■□□□ 1.75
C20orf27-204ENST00000399683 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
C20orf27-204ENST00000399683 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
C20orf27-204ENST00000399683 KIF14Q15058 1648 aa25.99■■□□□ 1.75
C20orf27-204ENST00000399683 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.99■■□□□ 1.75
C20orf27-204ENST00000399683 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.98■■□□□ 1.75
C20orf27-204ENST00000399683 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
C20orf27-204ENST00000399683 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.98■■□□□ 1.75
C20orf27-204ENST00000399683 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
C20orf27-204ENST00000399683 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.94■■□□□ 1.74
C20orf27-204ENST00000399683 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.91■■□□□ 1.74
C20orf27-204ENST00000399683 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
C20orf27-204ENST00000399683 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.9■■□□□ 1.74
C20orf27-204ENST00000399683 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.9■■□□□ 1.74
C20orf27-204ENST00000399683 TSPOAP1O95153 1857 aa25.89■■□□□ 1.74
C20orf27-204ENST00000399683 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
C20orf27-204ENST00000399683 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
C20orf27-204ENST00000399683 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.88■■□□□ 1.73
C20orf27-204ENST00000399683 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.85■■□□□ 1.73
C20orf27-204ENST00000399683 APLP2Q06481 763 aa25.83■■□□□ 1.73
C20orf27-204ENST00000399683 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.83■■□□□ 1.73
C20orf27-204ENST00000399683 PREX2Q70Z35 1606 aa25.82■■□□□ 1.72
C20orf27-204ENST00000399683 KCNH8Q96L42 1107 aa25.82■■□□□ 1.72
C20orf27-204ENST00000399683 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.81■■□□□ 1.72
C20orf27-204ENST00000399683 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.79■■□□□ 1.72
C20orf27-204ENST00000399683 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
C20orf27-204ENST00000399683 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.79■■□□□ 1.72
C20orf27-204ENST00000399683 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.78■■□□□ 1.72
C20orf27-204ENST00000399683 CD109Q6YHK3 1445 aa25.76■■□□□ 1.71
C20orf27-204ENST00000399683 NCOA2Q15596 1464 aa25.75■■□□□ 1.71
C20orf27-204ENST00000399683 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.73■■□□□ 1.71
C20orf27-204ENST00000399683 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
C20orf27-204ENST00000399683 PLCH2O75038 1416 aa25.69■■□□□ 1.7
C20orf27-204ENST00000399683 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
C20orf27-204ENST00000399683 NEO1Q92859 1461 aa25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms