RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.47■■□□□ 1.67
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JPH4Q96JJ6 628 aa25.42■■□□□ 1.66
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.38■■□□□ 1.65
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.38■■□□□ 1.65
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.38■■□□□ 1.65
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHROOM2Q13796 1616 aa25.33■■□□□ 1.65
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARAP1Q96P48 1450 aa25.3■■□□□ 1.64
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.28■■□□□ 1.64
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IQGAP2Q13576 1575 aa25.25■■□□□ 1.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.21■■□□□ 1.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF21BO75037 1637 aa25.19■■□□□ 1.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.18■■□□□ 1.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.17■■□□□ 1.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.16■■□□□ 1.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA3Q08378 1498 aa25.12■■□□□ 1.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.11■■□□□ 1.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DISP1Q96F81 1524 aa25.09■■□□□ 1.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPRGP23470 1445 aa25.07■■□□□ 1.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.04■■□□□ 1.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA0556O60303 1618 aa24.99■■□□□ 1.59
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.93■■□□□ 1.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UACAQ9BZF9 1416 aa24.9■■□□□ 1.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.89■■□□□ 1.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.87■■□□□ 1.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAMD9Q5K651 1589 aa24.87■■□□□ 1.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 P3H3Q8IVL6 736 aa24.84■■□□□ 1.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCC2Q92887 1545 aa24.81■■□□□ 1.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.8■■□□□ 1.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.77■■□□□ 1.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.77■■□□□ 1.56
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.74■■□□□ 1.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.74■■□□□ 1.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCA8O94911 1581 aa24.73■■□□□ 1.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAPKBP1O60336 1514 aa24.73■■□□□ 1.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FMN1Q68DA7 1419 aa24.69■■□□□ 1.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLIP1P30622 1438 aa24.68■■□□□ 1.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASXL2Q76L83 1435 aa24.62■■□□□ 1.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.62■■□□□ 1.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.61■■□□□ 1.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEP162Q5TB80 1403 aa24.59■■□□□ 1.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.58■■□□□ 1.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP10BO94823 1461 aa24.58■■□□□ 1.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.56■■□□□ 1.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.53■■□□□ 1.52
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARID3CA6NKF2 412 aa24.49■■□□□ 1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.48■■□□□ 1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIP2BQ9P265 1576 aa24.48■■□□□ 1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLI2P10070 1586 aa24.45■■□□□ 1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HECW1Q76N89 1606 aa24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.44■■□□□ 1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.42■■□□□ 1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNH8Q96L42 1107 aa24.38■■□□□ 1.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.38■■□□□ 1.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.31■■□□□ 1.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD109Q6YHK3 1445 aa24.3■■□□□ 1.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.3■■□□□ 1.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.27■■□□□ 1.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.26■■□□□ 1.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.24■■□□□ 1.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.21■■□□□ 1.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.18■■□□□ 1.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.18■■□□□ 1.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.15■■□□□ 1.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF14Q15058 1648 aa24.12■■□□□ 1.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEO1Q92859 1461 aa24.11■■□□□ 1.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLCH2O75038 1416 aa24.1■■□□□ 1.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K1Q13233 1512 aa24.1■■□□□ 1.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.08■■□□□ 1.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APLP2Q06481 763 aa24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.06■■□□□ 1.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.05■■□□□ 1.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.05■■□□□ 1.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM6BO15054 1643 aa24.04■■□□□ 1.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FANCAO15360 1455 aa24.04■■□□□ 1.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIAM1Q13009 1591 aa24.03■■□□□ 1.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPOAP1O95153 1857 aa24.01■■□□□ 1.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKNAQ7Z591 1439 aa24■■□□□ 1.43
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24■■□□□ 1.43
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