RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396914.3

CHCHD4-202, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-202ENST00000396914 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.8■■■■■ 5.4
CHCHD4-202ENST00000396914 PRXQ9BXM0 1461 aa48.75■■■■■ 5.39
CHCHD4-202ENST00000396914 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.68■■■■■ 5.38
CHCHD4-202ENST00000396914 JPH4Q96JJ6 628 aa48.63■■■■■ 5.38
CHCHD4-202ENST00000396914 SHROOM2Q13796 1616 aa48.59■■■■■ 5.37
CHCHD4-202ENST00000396914 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.51■■■■■ 5.36
CHCHD4-202ENST00000396914 IQGAP2Q13576 1575 aa48.49■■■■■ 5.35
CHCHD4-202ENST00000396914 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.48■■■■■ 5.35
CHCHD4-202ENST00000396914 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.47■■■■■ 5.35
CHCHD4-202ENST00000396914 ARAP1Q96P48 1450 aa48.44■■■■■ 5.34
CHCHD4-202ENST00000396914 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.43■■■■■ 5.34
CHCHD4-202ENST00000396914 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.42■■■■■ 5.34
CHCHD4-202ENST00000396914 KIF21BO75037 1637 aa48.4■■■■■ 5.34
CHCHD4-202ENST00000396914 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.23■■■■■ 5.31
CHCHD4-202ENST00000396914 GOLGA3Q08378 1498 aa48.21■■■■■ 5.31
CHCHD4-202ENST00000396914 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.31
CHCHD4-202ENST00000396914 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.18■■■■■ 5.3
CHCHD4-202ENST00000396914 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.13■■■■■ 5.3
CHCHD4-202ENST00000396914 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48.08■■■■■ 5.29
CHCHD4-202ENST00000396914 DISP1Q96F81 1524 aa48.08■■■■■ 5.29
CHCHD4-202ENST00000396914 KIAA0556O60303 1618 aa48■■■■■ 5.28
CHCHD4-202ENST00000396914 TNIKQ9UKE5 1360 aa48■■■■■ 5.28
CHCHD4-202ENST00000396914 PTPRGP23470 1445 aa47.98■■■■■ 5.27
CHCHD4-202ENST00000396914 P3H3Q8IVL6 736 aa47.9■■■■■ 5.26
CHCHD4-202ENST00000396914 SAMD9Q5K651 1589 aa47.76■■■■■ 5.24
CHCHD4-202ENST00000396914 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.67■■■■■ 5.22
CHCHD4-202ENST00000396914 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.66■■■■■ 5.22
CHCHD4-202ENST00000396914 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.65■■■■■ 5.22
CHCHD4-202ENST00000396914 UACAQ9BZF9 1416 aa47.63■■■■■ 5.22
CHCHD4-202ENST00000396914 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.6■■■■■ 5.21
CHCHD4-202ENST00000396914 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.56■■■■■ 5.2
CHCHD4-202ENST00000396914 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.53■■■■■ 5.2
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCC2Q92887 1545 aa47.52■■■■■ 5.2
CHCHD4-202ENST00000396914 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.5■■■■■ 5.2
CHCHD4-202ENST00000396914 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.47■■■■■ 5.19
CHCHD4-202ENST00000396914 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCA8O94911 1581 aa47.43■■■■■ 5.18
CHCHD4-202ENST00000396914 CLIP1P30622 1438 aa47.37■■■■■ 5.17
CHCHD4-202ENST00000396914 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.31■■■■■ 5.16
CHCHD4-202ENST00000396914 ARID3CA6NKF2 412 aa47.3■■■■■ 5.16
CHCHD4-202ENST00000396914 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.28■■■■■ 5.16
CHCHD4-202ENST00000396914 MAPKBP1O60336 1514 aa47.26■■■■■ 5.16
CHCHD4-202ENST00000396914 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
CHCHD4-202ENST00000396914 FMN1Q68DA7 1419 aa47.25■■■■■ 5.15
CHCHD4-202ENST00000396914 CEP162Q5TB80 1403 aa47.23■■■■■ 5.15
CHCHD4-202ENST00000396914 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.19■■■■■ 5.14
CHCHD4-202ENST00000396914 ASXL2Q76L83 1435 aa47.15■■■■■ 5.14
CHCHD4-202ENST00000396914 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
CHCHD4-202ENST00000396914 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
CHCHD4-202ENST00000396914 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
CHCHD4-202ENST00000396914 ATP10BO94823 1461 aa47.08■■■■■ 5.13
CHCHD4-202ENST00000396914 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.04■■■■■ 5.12
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.03■■■■■ 5.12
CHCHD4-202ENST00000396914 HECW1Q76N89 1606 aa46.99■■■■■ 5.11
CHCHD4-202ENST00000396914 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.97■■■■■ 5.11
CHCHD4-202ENST00000396914 DIP2BQ9P265 1576 aa46.96■■■■■ 5.11
CHCHD4-202ENST00000396914 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.95■■■■■ 5.11
CHCHD4-202ENST00000396914 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.91■■■■■ 5.1
CHCHD4-202ENST00000396914 KCNH8Q96L42 1107 aa46.9■■■■■ 5.1
CHCHD4-202ENST00000396914 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.89■■■■■ 5.1
CHCHD4-202ENST00000396914 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.87■■■■■ 5.09
CHCHD4-202ENST00000396914 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.84■■■■■ 5.09
CHCHD4-202ENST00000396914 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.81■■■■■ 5.08
CHCHD4-202ENST00000396914 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.8■■■■■ 5.08
CHCHD4-202ENST00000396914 GLI2P10070 1586 aa46.74■■■■■ 5.07
CHCHD4-202ENST00000396914 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.72■■■■■ 5.07
CHCHD4-202ENST00000396914 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
CHCHD4-202ENST00000396914 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.69■■■■■ 5.07
CHCHD4-202ENST00000396914 TSPOAP1O95153 1857 aa46.68■■■■■ 5.06
CHCHD4-202ENST00000396914 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.61■■■■■ 5.05
CHCHD4-202ENST00000396914 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.57■■■■■ 5.05
CHCHD4-202ENST00000396914 CD109Q6YHK3 1445 aa46.52■■■■■ 5.04
CHCHD4-202ENST00000396914 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.52■■■■■ 5.04
CHCHD4-202ENST00000396914 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.46■■■■■ 5.03
CHCHD4-202ENST00000396914 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.46■■■■■ 5.03
CHCHD4-202ENST00000396914 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
CHCHD4-202ENST00000396914 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.39■■■■■ 5.02
CHCHD4-202ENST00000396914 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.37■■■■■ 5.01
CHCHD4-202ENST00000396914 KIF14Q15058 1648 aa46.37■■■■■ 5.01
CHCHD4-202ENST00000396914 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.36■■■■■ 5.01
CHCHD4-202ENST00000396914 MTUS2Q5JR59 1369 aa46.32■■■■■ 5.01
CHCHD4-202ENST00000396914 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.32■■■■■ 5.01
CHCHD4-202ENST00000396914 APLP2Q06481 763 aa46.27■■■■■ 5
CHCHD4-202ENST00000396914 TIAM1Q13009 1591 aa46.24■■■■■ 4.99
CHCHD4-202ENST00000396914 KDM6BO15054 1643 aa46.19■■■■■ 4.99
CHCHD4-202ENST00000396914 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.16■■■■■ 4.98
CHCHD4-202ENST00000396914 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.13■■■■■ 4.98
CHCHD4-202ENST00000396914 PLCH2O75038 1416 aa46.1■■■■■ 4.97
CHCHD4-202ENST00000396914 MAP3K1Q13233 1512 aa46.09■■■■■ 4.97
CHCHD4-202ENST00000396914 FANCAO15360 1455 aa46.08■■■■■ 4.97
CHCHD4-202ENST00000396914 NEO1Q92859 1461 aa46.06■■■■■ 4.96
CHCHD4-202ENST00000396914 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa46.04■■■■■ 4.96
CHCHD4-202ENST00000396914 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.02■■■■■ 4.96
CHCHD4-202ENST00000396914 ARHGAP5Q13017 1502 aa46.02■■■■■ 4.96
CHCHD4-202ENST00000396914 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.02■■■■■ 4.96
CHCHD4-202ENST00000396914 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.01■■■■■ 4.96
CHCHD4-202ENST00000396914 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46■■■■■ 4.95
CHCHD4-202ENST00000396914 CCNB3Q8WWL7 1395 aa45.98■■■■■ 4.95
CHCHD4-202ENST00000396914 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
CHCHD4-202ENST00000396914 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP45.98■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms