RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395053.7

TCEA2-204, Transcript of transcription elongation factor A2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCEA2, Length 1,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2-204ENST00000395053 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
TCEA2-204ENST00000395053 FBLN2P98095 1184 aa42.71■■■■■ 4.43
TCEA2-204ENST00000395053 CEP170Q5SW79 1584 aa42.58■■■■■ 4.41
TCEA2-204ENST00000395053 CHD1O14646 1710 aa42.56■■■■■ 4.4
TCEA2-204ENST00000395053 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.55■■■■■ 4.4
TCEA2-204ENST00000395053 NUP160Q12769 1436 aa42.53■■■■■ 4.4
TCEA2-204ENST00000395053 IQGAP2Q13576 1575 aa42.5■■■■■ 4.39
TCEA2-204ENST00000395053 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.49■■■■■ 4.39
TCEA2-204ENST00000395053 ARAP1Q96P48 1450 aa42.48■■■■■ 4.39
TCEA2-204ENST00000395053 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.36■■■■■ 4.37
TCEA2-204ENST00000395053 SAMD9Q5K651 1589 aa42.34■■■■■ 4.37
TCEA2-204ENST00000395053 P3H3Q8IVL6 736 aa42.33■■■■■ 4.37
TCEA2-204ENST00000395053 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.31■■■■■ 4.36
TCEA2-204ENST00000395053 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.31■■■■■ 4.36
TCEA2-204ENST00000395053 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.27■■■■■ 4.36
TCEA2-204ENST00000395053 DISP1Q96F81 1524 aa42.16■■■■■ 4.34
TCEA2-204ENST00000395053 JPH4Q96JJ6 628 aa42.16■■■■■ 4.34
TCEA2-204ENST00000395053 KIAA0556O60303 1618 aa42.1■■■■■ 4.33
TCEA2-204ENST00000395053 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.1■■■■■ 4.33
TCEA2-204ENST00000395053 SHROOM2Q13796 1616 aa42.01■■■■■ 4.32
TCEA2-204ENST00000395053 FMN1Q68DA7 1419 aa41.97■■■■■ 4.31
TCEA2-204ENST00000395053 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
TCEA2-204ENST00000395053 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
TCEA2-204ENST00000395053 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
TCEA2-204ENST00000395053 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.93■■■■■ 4.3
TCEA2-204ENST00000395053 OSCARQ8IYS5 282 aa41.87■■■■■ 4.29
TCEA2-204ENST00000395053 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.87■■■■■ 4.29
TCEA2-204ENST00000395053 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.82■■■■■ 4.29
TCEA2-204ENST00000395053 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.82■■■■■ 4.29
TCEA2-204ENST00000395053 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
TCEA2-204ENST00000395053 APLP2Q06481 763 aa41.77■■■■■ 4.28
TCEA2-204ENST00000395053 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
TCEA2-204ENST00000395053 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.67■■■■■ 4.26
TCEA2-204ENST00000395053 TIAM1Q13009 1591 aa41.66■■■■■ 4.26
TCEA2-204ENST00000395053 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
TCEA2-204ENST00000395053 MAP3K1Q13233 1512 aa41.64■■■■■ 4.26
TCEA2-204ENST00000395053 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.62■■■■■ 4.25
TCEA2-204ENST00000395053 PTPRGP23470 1445 aa41.61■■■■■ 4.25
TCEA2-204ENST00000395053 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.61■■■■■ 4.25
TCEA2-204ENST00000395053 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.61■■■■■ 4.25
TCEA2-204ENST00000395053 HECW1Q76N89 1606 aa41.6■■■■■ 4.25
TCEA2-204ENST00000395053 ABCA8O94911 1581 aa41.54■■■■■ 4.24
TCEA2-204ENST00000395053 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
TCEA2-204ENST00000395053 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
TCEA2-204ENST00000395053 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.47■■■■■ 4.23
TCEA2-204ENST00000395053 ARID3CA6NKF2 412 aa41.47■■■■■ 4.23
TCEA2-204ENST00000395053 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
TCEA2-204ENST00000395053 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.46■■■■■ 4.23
TCEA2-204ENST00000395053 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
TCEA2-204ENST00000395053 UACAQ9BZF9 1416 aa41.37■■■■■ 4.21
TCEA2-204ENST00000395053 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.34■■■■■ 4.21
TCEA2-204ENST00000395053 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.28■■■■■ 4.2
TCEA2-204ENST00000395053 ABCC2Q92887 1545 aa41.27■■■■■ 4.2
TCEA2-204ENST00000395053 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.26■■■■■ 4.2
TCEA2-204ENST00000395053 ATP10BO94823 1461 aa41.25■■■■■ 4.19
TCEA2-204ENST00000395053 ARHGEF11O15085 1522 aa41.23■■■■■ 4.19
TCEA2-204ENST00000395053 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
TCEA2-204ENST00000395053 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
TCEA2-204ENST00000395053 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.21■■■■■ 4.19
TCEA2-204ENST00000395053 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.19■■■■■ 4.18
TCEA2-204ENST00000395053 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.11■■■■■ 4.17
TCEA2-204ENST00000395053 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.1■■■■■ 4.17
TCEA2-204ENST00000395053 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
TCEA2-204ENST00000395053 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
TCEA2-204ENST00000395053 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.08■■■■■ 4.17
TCEA2-204ENST00000395053 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
TCEA2-204ENST00000395053 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
TCEA2-204ENST00000395053 NCOA2Q15596 1464 aa41.06■■■■■ 4.16
TCEA2-204ENST00000395053 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
TCEA2-204ENST00000395053 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.03■■■■■ 4.16
TCEA2-204ENST00000395053 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
TCEA2-204ENST00000395053 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.97■■■■■ 4.15
TCEA2-204ENST00000395053 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
TCEA2-204ENST00000395053 KIF14Q15058 1648 aa40.91■■■■■ 4.14
TCEA2-204ENST00000395053 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.86■■■■■ 4.13
TCEA2-204ENST00000395053 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.84■■■■■ 4.13
TCEA2-204ENST00000395053 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.84■■■■■ 4.13
TCEA2-204ENST00000395053 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.8■■■■■ 4.12
TCEA2-204ENST00000395053 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.76■■■■■ 4.11
TCEA2-204ENST00000395053 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
TCEA2-204ENST00000395053 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.66■■■■■ 4.1
TCEA2-204ENST00000395053 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
TCEA2-204ENST00000395053 KCNH8Q96L42 1107 aa40.66■■■■■ 4.1
TCEA2-204ENST00000395053 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.65■■■■■ 4.1
TCEA2-204ENST00000395053 ASXL2Q76L83 1435 aa40.65■■■■■ 4.1
TCEA2-204ENST00000395053 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.64■■■■■ 4.1
TCEA2-204ENST00000395053 MIA2Q96PC5 1412 aa40.63■■■■■ 4.1
TCEA2-204ENST00000395053 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.093e-6■■■■□ 19.4
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TCEA2-204ENST00000395053 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.6■■■■■ 4.09
TCEA2-204ENST00000395053 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.6■■■■■ 4.09
TCEA2-204ENST00000395053 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.59■■■■■ 4.09
TCEA2-204ENST00000395053 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
TCEA2-204ENST00000395053 ITGAEP38570 1179 aa40.53■■■■■ 4.08
TCEA2-204ENST00000395053 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
TCEA2-204ENST00000395053 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
TCEA2-204ENST00000395053 PREX2Q70Z35 1606 aa40.47■■■■■ 4.07
TCEA2-204ENST00000395053 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.45■■■■■ 4.07
TCEA2-204ENST00000395053 MAPKBP1O60336 1514 aa40.44■■■■■ 4.06
TCEA2-204ENST00000395053 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.41■■■■■ 4.06
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