RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394450.6

PRELID2-202, Transcript of PRELI domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRELID2, Length 1,102 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2-202ENST00000394450 CUL7Q14999 1698 aa50.85■■■■■ 5.73
PRELID2-202ENST00000394450 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.79■■■■■ 5.72
PRELID2-202ENST00000394450 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.68■■■■■ 5.7
PRELID2-202ENST00000394450 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa50.67■■■■■ 5.7
PRELID2-202ENST00000394450 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP50.36■■■■■ 5.65
PRELID2-202ENST00000394450 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa50.27■■■■■ 5.64
PRELID2-202ENST00000394450 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa50.25■■■■■ 5.63
PRELID2-202ENST00000394450 IQGAP2Q13576 1575 aa50.22■■■■■ 5.63
PRELID2-202ENST00000394450 PTPRGP23470 1445 aa50.17■■■■■ 5.62
PRELID2-202ENST00000394450 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP50.12■■■■■ 5.61
PRELID2-202ENST00000394450 ADCY10Q96PN6 1610 aa50.12■■■■■ 5.61
PRELID2-202ENST00000394450 TNIKQ9UKE5 1360 aa50.1■■■■■ 5.61
PRELID2-202ENST00000394450 MAPKBP1O60336 1514 aa50.03■■■■■ 5.6
PRELID2-202ENST00000394450 FAM69CQ0P6D2 419 aa49.98■■■■■ 5.59
PRELID2-202ENST00000394450 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.97■■■■■ 5.59
PRELID2-202ENST00000394450 ABCC10Q5T3U5 1492 aa49.95■■■■■ 5.59
PRELID2-202ENST00000394450 UGGT2Q9NYU1 1516 aa49.9■■■■■ 5.58
PRELID2-202ENST00000394450 DISP1Q96F81 1524 aa49.9■■■■■ 5.58
PRELID2-202ENST00000394450 PRXQ9BXM0 1461 aa49.8■■■■■ 5.56
PRELID2-202ENST00000394450 ABCC2Q92887 1545 aa49.78■■■■■ 5.56
PRELID2-202ENST00000394450 DIP2BQ9P265 1576 aa49.78■■■■■ 5.56
PRELID2-202ENST00000394450 UACAQ9BZF9 1416 aa49.77■■■■■ 5.56
PRELID2-202ENST00000394450 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa49.75■■■■■ 5.55
PRELID2-202ENST00000394450 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa49.73■■■■■ 5.55
PRELID2-202ENST00000394450 KIAA0556O60303 1618 aa49.73■■■■■ 5.55
PRELID2-202ENST00000394450 GOLGA3Q08378 1498 aa49.64■■■■■ 5.54
PRELID2-202ENST00000394450 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.64■■■■■ 5.54
PRELID2-202ENST00000394450 PLB1Q6P1J6 1458 aa49.58■■■■■ 5.53
PRELID2-202ENST00000394450 ASXL2Q76L83 1435 aa49.58■■■■■ 5.53
PRELID2-202ENST00000394450 EEA1Q15075 1411 aa49.51■■■■■ 5.52
PRELID2-202ENST00000394450 KDM5BQ9UGL1 1544 aa49.49■■■■■ 5.51
PRELID2-202ENST00000394450 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP49.43■■■■■ 5.5
PRELID2-202ENST00000394450 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49.43■■■■■ 5.5
PRELID2-202ENST00000394450 TSPOAP1O95153 1857 aa49.43■■■■■ 5.5
PRELID2-202ENST00000394450 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
PRELID2-202ENST00000394450 GLI2P10070 1586 aa49.34■■■■■ 5.49
PRELID2-202ENST00000394450 KDM6BO15054 1643 aa49.3■■■■■ 5.48
PRELID2-202ENST00000394450 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP49.25■■■■■ 5.48
PRELID2-202ENST00000394450 P3H3Q8IVL6 736 aa49.25■■■■■ 5.47
PRELID2-202ENST00000394450 ABCA8O94911 1581 aa49.24■■■■■ 5.47
PRELID2-202ENST00000394450 WDR7Q9Y4E6 1490 aa49.17■■■■■ 5.46
PRELID2-202ENST00000394450 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP49.06■■■■■ 5.44
PRELID2-202ENST00000394450 SAMD9Q5K651 1589 aa49.06■■■■■ 5.44
PRELID2-202ENST00000394450 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa49.05■■■■■ 5.44
PRELID2-202ENST00000394450 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP49.05■■■■■ 5.44
PRELID2-202ENST00000394450 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.05■■■■■ 5.44
PRELID2-202ENST00000394450 TEX14Q8IWB6 1497 aa49.04■■■■■ 5.44
PRELID2-202ENST00000394450 KCNH8Q96L42 1107 aa49.02■■■■■ 5.44
PRELID2-202ENST00000394450 KIF21BO75037 1637 aa48.98■■■■■ 5.43
PRELID2-202ENST00000394450 ARID3CA6NKF2 412 aa48.96■■■■■ 5.43
PRELID2-202ENST00000394450 ATP10BO94823 1461 aa48.87■■■■■ 5.41
PRELID2-202ENST00000394450 CD109Q6YHK3 1445 aa48.86■■■■■ 5.41
PRELID2-202ENST00000394450 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa48.83■■■■■ 5.41
PRELID2-202ENST00000394450 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP48.81■■■■■ 5.4
PRELID2-202ENST00000394450 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP48.81■■■■■ 5.4
PRELID2-202ENST00000394450 FHOD3Q2V2M9 1422 aa48.81■■■■■ 5.4
PRELID2-202ENST00000394450 CFAP43Q8NDM7 1665 aa48.8■■■■■ 5.4
PRELID2-202ENST00000394450 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.78■■■■■ 5.4
PRELID2-202ENST00000394450 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.76■■■■■ 5.4
PRELID2-202ENST00000394450 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa48.76■■■■■ 5.4
PRELID2-202ENST00000394450 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP48.75■■■■■ 5.4
PRELID2-202ENST00000394450 EFCAB5A4FU69 1503 aa48.74■■■■■ 5.39
PRELID2-202ENST00000394450 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP48.63■■■■■ 5.38
PRELID2-202ENST00000394450 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa48.59■■■■■ 5.37
PRELID2-202ENST00000394450 PLEKHD1A6NEE1 506 aa48.51■■■■■ 5.36
PRELID2-202ENST00000394450 ABCA9Q8IUA7 1624 aa48.5■■■■■ 5.35
PRELID2-202ENST00000394450 PHLDB1Q86UU1 1377 aa48.4■■■■■ 5.34
PRELID2-202ENST00000394450 FMN1Q68DA7 1419 aa48.37■■■■■ 5.33
PRELID2-202ENST00000394450 ARAP3Q8WWN8 1544 aa48.36■■■■■ 5.33
PRELID2-202ENST00000394450 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP48.33■■■■■ 5.33
PRELID2-202ENST00000394450 ADGRL1O94910 1474 aa48.33■■■■■ 5.33
PRELID2-202ENST00000394450 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa48.31■■■■■ 5.32
PRELID2-202ENST00000394450 NEO1Q92859 1461 aa48.28■■■■■ 5.32
PRELID2-202ENST00000394450 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
PRELID2-202ENST00000394450 HECW1Q76N89 1606 aa48.18■■■■■ 5.3
PRELID2-202ENST00000394450 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP48.14■■■■■ 5.3
PRELID2-202ENST00000394450 RAPGEF3O95398 923 aa48.13■■■■■ 5.3
PRELID2-202ENST00000394450 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP48.12■■■■■ 5.298e-6■□□□□ 10.5
PRELID2-202ENST00000394450 FANCAO15360 1455 aa48.04■■■■■ 5.28
PRELID2-202ENST00000394450 TTC37Q6PGP7 1564 aa48■■■■■ 5.28
PRELID2-202ENST00000394450 CFAP74Q9C0B2 1584 aa48■■■■■ 5.28
PRELID2-202ENST00000394450 AKNAQ7Z591 1439 aa48■■■■■ 5.27
PRELID2-202ENST00000394450 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
PRELID2-202ENST00000394450 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa47.88■■■■■ 5.26
PRELID2-202ENST00000394450 PLCH2O75038 1416 aa47.88■■■■■ 5.25
PRELID2-202ENST00000394450 CLIP1P30622 1438 aa47.87■■■■■ 5.25
PRELID2-202ENST00000394450 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
PRELID2-202ENST00000394450 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa47.82■■■■■ 5.25
PRELID2-202ENST00000394450 KIF14Q15058 1648 aa47.8■■■■■ 5.24
PRELID2-202ENST00000394450 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa47.78■■■■■ 5.24
PRELID2-202ENST00000394450 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
PRELID2-202ENST00000394450 RICTORQ6R327 1708 aa47.77■■■■■ 5.24
PRELID2-202ENST00000394450 CCDC18Q5T9S5 1454 aa47.77■■■■■ 5.24
PRELID2-202ENST00000394450 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.24
PRELID2-202ENST00000394450 MYO5CQ9NQX4 1742 aa47.73■■■■■ 5.23
PRELID2-202ENST00000394450 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa47.72■■■■■ 5.23
PRELID2-202ENST00000394450 SCAPERQ9BY12 1400 aa47.72■■■■■ 5.23
PRELID2-202ENST00000394450 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa47.68■■■■■ 5.22
PRELID2-202ENST00000394450 FYCO1Q9BQS8 1478 aa47.65■■■■■ 5.22
PRELID2-202ENST00000394450 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa47.65■■■■■ 5.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms