RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393766.6

MSMO1-202, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSMO1, Length 1,789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-202ENST00000393766 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
MSMO1-202ENST00000393766 GRIN2AQ12879 1464 aa25.91■■□□□ 1.74
MSMO1-202ENST00000393766 FBLN2P98095 1184 aa25.91■■□□□ 1.74
MSMO1-202ENST00000393766 ARAP1Q96P48 1450 aa25.9■■□□□ 1.74
MSMO1-202ENST00000393766 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.88■■□□□ 1.73
MSMO1-202ENST00000393766 IQGAP2Q13576 1575 aa25.83■■□□□ 1.73
MSMO1-202ENST00000393766 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.81■■□□□ 1.72
MSMO1-202ENST00000393766 P3H3Q8IVL6 736 aa25.79■■□□□ 1.72
MSMO1-202ENST00000393766 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
MSMO1-202ENST00000393766 CEP170Q5SW79 1584 aa25.76■■□□□ 1.71
MSMO1-202ENST00000393766 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.75■■□□□ 1.71
MSMO1-202ENST00000393766 CHD1O14646 1710 aa25.75■■□□□ 1.71
MSMO1-202ENST00000393766 SAMD9Q5K651 1589 aa25.74■■□□□ 1.71
MSMO1-202ENST00000393766 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.73■■□□□ 1.71
MSMO1-202ENST00000393766 APLP2Q06481 763 aa25.71■■□□□ 1.71
MSMO1-202ENST00000393766 NUP160Q12769 1436 aa25.7■■□□□ 1.7
MSMO1-202ENST00000393766 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.66■■□□□ 1.7
MSMO1-202ENST00000393766 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
MSMO1-202ENST00000393766 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
MSMO1-202ENST00000393766 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.59■■□□□ 1.69
MSMO1-202ENST00000393766 FMN1Q68DA7 1419 aa25.59■■□□□ 1.69
MSMO1-202ENST00000393766 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
MSMO1-202ENST00000393766 KIAA0556O60303 1618 aa25.56■■□□□ 1.68
MSMO1-202ENST00000393766 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
MSMO1-202ENST00000393766 DISP1Q96F81 1524 aa25.54■■□□□ 1.68
MSMO1-202ENST00000393766 JPH4Q96JJ6 628 aa25.53■■□□□ 1.68
MSMO1-202ENST00000393766 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.51■■□□□ 1.67
MSMO1-202ENST00000393766 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.5■■□□□ 1.67
MSMO1-202ENST00000393766 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.48■■□□□ 1.67
MSMO1-202ENST00000393766 TIAM1Q13009 1591 aa25.45■■□□□ 1.66
MSMO1-202ENST00000393766 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.43■■□□□ 1.66
MSMO1-202ENST00000393766 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
MSMO1-202ENST00000393766 MAP3K1Q13233 1512 aa25.41■■□□□ 1.66
MSMO1-202ENST00000393766 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
MSMO1-202ENST00000393766 SHROOM2Q13796 1616 aa25.38■■□□□ 1.65
MSMO1-202ENST00000393766 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.37■■□□□ 1.65
MSMO1-202ENST00000393766 HECW1Q76N89 1606 aa25.37■■□□□ 1.65
MSMO1-202ENST00000393766 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.36■■□□□ 1.65
MSMO1-202ENST00000393766 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.31■■□□□ 1.64
MSMO1-202ENST00000393766 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.31■■□□□ 1.64
MSMO1-202ENST00000393766 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.28■■□□□ 1.64
MSMO1-202ENST00000393766 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
MSMO1-202ENST00000393766 ARID3CA6NKF2 412 aa25.24■■□□□ 1.63
MSMO1-202ENST00000393766 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.24■■□□□ 1.63
MSMO1-202ENST00000393766 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.24■■□□□ 1.63
MSMO1-202ENST00000393766 OSCARQ8IYS5 282 aa25.22■■□□□ 1.63
MSMO1-202ENST00000393766 PTPRGP23470 1445 aa25.22■■□□□ 1.63
MSMO1-202ENST00000393766 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MSMO1-202ENST00000393766 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.21■■□□□ 1.63
MSMO1-202ENST00000393766 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
MSMO1-202ENST00000393766 ABCA8O94911 1581 aa25.17■■□□□ 1.62
MSMO1-202ENST00000393766 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
MSMO1-202ENST00000393766 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
MSMO1-202ENST00000393766 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.15■■□□□ 1.62
MSMO1-202ENST00000393766 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.12■■□□□ 1.61
MSMO1-202ENST00000393766 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
MSMO1-202ENST00000393766 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.08■■□□□ 1.61
MSMO1-202ENST00000393766 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
MSMO1-202ENST00000393766 UACAQ9BZF9 1416 aa25.06■■□□□ 1.6
MSMO1-202ENST00000393766 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
MSMO1-202ENST00000393766 NCOA2Q15596 1464 aa25.04■■□□□ 1.6
MSMO1-202ENST00000393766 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.02■■□□□ 1.6
MSMO1-202ENST00000393766 ATP10BO94823 1461 aa25■■□□□ 1.59
MSMO1-202ENST00000393766 ABCC2Q92887 1545 aa25■■□□□ 1.59
MSMO1-202ENST00000393766 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
MSMO1-202ENST00000393766 ARHGEF11O15085 1522 aa24.94■■□□□ 1.58
MSMO1-202ENST00000393766 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.93■■□□□ 1.58
MSMO1-202ENST00000393766 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
MSMO1-202ENST00000393766 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.92■■□□□ 1.58
MSMO1-202ENST00000393766 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.92■■□□□ 1.58
MSMO1-202ENST00000393766 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.9■■□□□ 1.58
MSMO1-202ENST00000393766 ITGAEP38570 1179 aa24.89■■□□□ 1.57
MSMO1-202ENST00000393766 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.88■■□□□ 1.57
MSMO1-202ENST00000393766 KIF14Q15058 1648 aa24.88■■□□□ 1.57
MSMO1-202ENST00000393766 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
MSMO1-202ENST00000393766 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.83■■□□□ 1.56
MSMO1-202ENST00000393766 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.81■■□□□ 1.56
MSMO1-202ENST00000393766 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.563e-7■■□□□ 11.7
MSMO1-202ENST00000393766 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.79■■□□□ 1.56
MSMO1-202ENST00000393766 MIA2Q96PC5 1412 aa24.77■■□□□ 1.56
MSMO1-202ENST00000393766 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
MSMO1-202ENST00000393766 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.72■■□□□ 1.55
MSMO1-202ENST00000393766 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.71■■□□□ 1.55
MSMO1-202ENST00000393766 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
MSMO1-202ENST00000393766 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.71■■□□□ 1.55
MSMO1-202ENST00000393766 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.71■■□□□ 1.55
MSMO1-202ENST00000393766 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.71■■□□□ 1.55
MSMO1-202ENST00000393766 KCNH8Q96L42 1107 aa24.7■■□□□ 1.54
MSMO1-202ENST00000393766 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
MSMO1-202ENST00000393766 HRCP23327 699 aa24.68■■□□□ 1.54
MSMO1-202ENST00000393766 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
MSMO1-202ENST00000393766 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
MSMO1-202ENST00000393766 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
MSMO1-202ENST00000393766 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.65■■□□□ 1.54
MSMO1-202ENST00000393766 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
MSMO1-202ENST00000393766 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
MSMO1-202ENST00000393766 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.63■■□□□ 1.53
MSMO1-202ENST00000393766 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.62■■□□□ 1.53
MSMO1-202ENST00000393766 PREX2Q70Z35 1606 aa24.61■■□□□ 1.53
MSMO1-202ENST00000393766 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms