RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.06■■■□□ 2.08
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 JPH4Q96JJ6 628 aa27.98■■■□□ 2.07
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.92■■■□□ 2.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 IQGAP2Q13576 1575 aa27.88■■■□□ 2.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRXQ9BXM0 1461 aa27.87■■■□□ 2.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.79■■■□□ 2.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.77■■■□□ 2.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 DISP1Q96F81 1524 aa27.75■■■□□ 2.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.74■■■□□ 2.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 EEA1Q15075 1411 aa27.67■■■□□ 2.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA0556O60303 1618 aa27.66■■■□□ 2.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.65■■■□□ 2.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.62■■■□□ 2.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.61■■■□□ 2.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.61■■■□□ 2.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.6■■■□□ 2.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTPRGP23470 1445 aa27.59■■■□□ 2.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAPKBP1O60336 1514 aa27.59■■■□□ 2.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.53■■■□□ 2
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF21BO75037 1637 aa27.51■■□□□ 1.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCC2Q92887 1545 aa27.48■■□□□ 1.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 GOLGA3Q08378 1498 aa27.46■■□□□ 1.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 UACAQ9BZF9 1416 aa27.46■■□□□ 1.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 DIP2BQ9P265 1576 aa27.46■■□□□ 1.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 SAMD9Q5K651 1589 aa27.45■■□□□ 1.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.44■■□□□ 1.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.41■■□□□ 1.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCA8O94911 1581 aa27.39■■□□□ 1.97
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.35■■□□□ 1.97
NME1-NME2-202ENST00000393193 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
NME1-NME2-202ENST00000393193 ASXL2Q76L83 1435 aa27.29■■□□□ 1.96
NME1-NME2-202ENST00000393193 GLI2P10070 1586 aa27.26■■□□□ 1.96
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.23■■□□□ 1.95
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
NME1-NME2-202ENST00000393193 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.19■■□□□ 1.94
NME1-NME2-202ENST00000393193 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
NME1-NME2-202ENST00000393193 TSPOAP1O95153 1857 aa27.17■■□□□ 1.94
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.16■■□□□ 1.94
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.15■■□□□ 1.94
NME1-NME2-202ENST00000393193 P3H3Q8IVL6 736 aa27.14■■□□□ 1.94
NME1-NME2-202ENST00000393193 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.13■■□□□ 1.93
NME1-NME2-202ENST00000393193 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.12■■□□□ 1.93
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP10BO94823 1461 aa27.09■■□□□ 1.93
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.04■■□□□ 1.92
NME1-NME2-202ENST00000393193 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27■■□□□ 1.91
NME1-NME2-202ENST00000393193 KDM6BO15054 1643 aa26.99■■□□□ 1.91
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NME1-NME2-202ENST00000393193 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
NME1-NME2-202ENST00000393193 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.94■■□□□ 1.9
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.91■■□□□ 1.9
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.9■■□□□ 1.9
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARID3CA6NKF2 412 aa26.88■■□□□ 1.89
NME1-NME2-202ENST00000393193 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.87■■□□□ 1.89
NME1-NME2-202ENST00000393193 FMN1Q68DA7 1419 aa26.85■■□□□ 1.89
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.85■■□□□ 1.89
NME1-NME2-202ENST00000393193 CD109Q6YHK3 1445 aa26.84■■□□□ 1.89
NME1-NME2-202ENST00000393193 HECW1Q76N89 1606 aa26.82■■□□□ 1.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNH8Q96L42 1107 aa26.81■■□□□ 1.88
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.874e-7■■■□□ 16.9
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.71■■□□□ 1.87
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLIP1P30622 1438 aa26.7■■□□□ 1.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.7■■□□□ 1.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.68■■□□□ 1.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.65■■□□□ 1.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 NEO1Q92859 1461 aa26.64■■□□□ 1.86
NME1-NME2-202ENST00000393193 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.62■■□□□ 1.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF14Q15058 1648 aa26.61■■□□□ 1.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.6■■□□□ 1.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.59■■□□□ 1.85
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.57■■□□□ 1.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEP162Q5TB80 1403 aa26.55■■□□□ 1.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.54■■□□□ 1.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.53■■□□□ 1.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 RICTORQ6R327 1708 aa26.53■■□□□ 1.84
NME1-NME2-202ENST00000393193 FANCAO15360 1455 aa26.5■■□□□ 1.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLCH2O75038 1416 aa26.5■■□□□ 1.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 AKNAQ7Z591 1439 aa26.47■■□□□ 1.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.46■■□□□ 1.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.45■■□□□ 1.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.42■■□□□ 1.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.41■■□□□ 1.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 PREX2Q70Z35 1606 aa26.41■■□□□ 1.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAPGEF3O95398 923 aa26.4■■□□□ 1.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADGRL1O94910 1474 aa26.4■■□□□ 1.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.39■■□□□ 1.82
NME1-NME2-202ENST00000393193 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms