RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRN2-201ENST00000389413 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CUX2O14529 1486 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN2-201ENST00000389413 SMARCA2P51531 1590 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-201ENST00000389413 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-201ENST00000389413 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-201ENST00000389413 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-201ENST00000389413 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRN2-201ENST00000389413 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SMARCA4P51532 1647 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRN2-201ENST00000389413 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.074e-7■■■□□ 15.2
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PTPRN2-201ENST00000389413 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRN2-201ENST00000389413 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRN2-201ENST00000389413 NEFMP07197 916 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CCER2I3L3R5 266 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRN2-201ENST00000389413 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
PTPRN2-201ENST00000389413 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRN2-201ENST00000389413 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRN2-201ENST00000389413 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRN2-201ENST00000389413 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRN2-201ENST00000389413 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRN2-201ENST00000389413 RGL3Q3MIN7 710 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRN2-201ENST00000389413 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRN2-201ENST00000389413 FMN1Q68DA7 1419 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRN2-201ENST00000389413 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRN2-201ENST00000389413 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRN2-201ENST00000389413 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRN2-201ENST00000389413 BCL11AQ9H165 835 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRN2-201ENST00000389413 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-201ENST00000389413 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-201ENST00000389413 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRN2-201ENST00000389413 KCNH8Q96L42 1107 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRN2-201ENST00000389413 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRN2-201ENST00000389413 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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PTPRN2-201ENST00000389413 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.32■■□□□ 1
PTPRN2-201ENST00000389413 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.31■■□□□ 1
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PTPRN2-201ENST00000389413 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.31■■□□□ 1
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PTPRN2-201ENST00000389413 TMF1P82094 1093 aa21.14■□□□□ 0.98
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PTPRN2-201ENST00000389413 RGS3P49796 1198 aa21■□□□□ 0.95
PTPRN2-201ENST00000389413 NUDCQ9Y266 331 aa21■□□□□ 0.95
PTPRN2-201ENST00000389413 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRN2-201ENST00000389413 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRN2-201ENST00000389413 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRN2-201ENST00000389413 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.97■□□□□ 0.95
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PTPRN2-201ENST00000389413 PRXQ9BXM0 1461 aa20.96■□□□□ 0.95
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