RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388835.3

KRT18-201, Transcript of keratin 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRT18, Length 1,562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18-201ENST00000388835 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.38■■■■■ 4.69
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KRT18-201ENST00000388835 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.15■■■■■ 4.66
KRT18-201ENST00000388835 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.85■■■■■ 4.61
KRT18-201ENST00000388835 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.84■■■■■ 4.61
KRT18-201ENST00000388835 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.82■■■■■ 4.61
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KRT18-201ENST00000388835 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.73■■■■■ 4.59
KRT18-201ENST00000388835 PTPRGP23470 1445 aa43.73■■■■■ 4.59
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KRT18-201ENST00000388835 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.63■■■■■ 4.57
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KRT18-201ENST00000388835 DIP2BQ9P265 1576 aa43.55■■■■■ 4.56
KRT18-201ENST00000388835 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.51■■■■■ 4.56
KRT18-201ENST00000388835 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.44■■■■■ 4.54
KRT18-201ENST00000388835 ABCC2Q92887 1545 aa43.44■■■■■ 4.54
KRT18-201ENST00000388835 KIAA0556O60303 1618 aa43.41■■■■■ 4.54
KRT18-201ENST00000388835 UACAQ9BZF9 1416 aa43.39■■■■■ 4.54
KRT18-201ENST00000388835 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.36■■■■■ 4.53
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KRT18-201ENST00000388835 TSPOAP1O95153 1857 aa43.34■■■■■ 4.53
KRT18-201ENST00000388835 ASXL2Q76L83 1435 aa43.28■■■■■ 4.52
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KRT18-201ENST00000388835 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.18■■■■■ 4.5
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KRT18-201ENST00000388835 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
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KRT18-201ENST00000388835 ABCA8O94911 1581 aa42.98■■■■■ 4.47
KRT18-201ENST00000388835 P3H3Q8IVL6 736 aa42.97■■■■■ 4.47
KRT18-201ENST00000388835 EEA1Q15075 1411 aa42.95■■■■■ 4.47
KRT18-201ENST00000388835 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
KRT18-201ENST00000388835 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.9■■■■■ 4.46
KRT18-201ENST00000388835 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.9■■■■■ 4.46
KRT18-201ENST00000388835 SAMD9Q5K651 1589 aa42.79■■■■■ 4.44
KRT18-201ENST00000388835 ARID3CA6NKF2 412 aa42.78■■■■■ 4.44
KRT18-201ENST00000388835 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
KRT18-201ENST00000388835 KCNH8Q96L42 1107 aa42.78■■■■■ 4.44
KRT18-201ENST00000388835 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.74■■■■■ 4.43
KRT18-201ENST00000388835 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
KRT18-201ENST00000388835 ATP10BO94823 1461 aa42.64■■■■■ 4.42
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KRT18-201ENST00000388835 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.62■■■■■ 4.41
KRT18-201ENST00000388835 CD109Q6YHK3 1445 aa42.62■■■■■ 4.41
KRT18-201ENST00000388835 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.61■■■■■ 4.41
KRT18-201ENST00000388835 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.57■■■■■ 4.4
KRT18-201ENST00000388835 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.56■■■■■ 4.4
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KRT18-201ENST00000388835 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.53■■■■■ 4.4
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KRT18-201ENST00000388835 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
KRT18-201ENST00000388835 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.35■■■■■ 4.37
KRT18-201ENST00000388835 ADGRL1O94910 1474 aa42.3■■■■■ 4.36
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KRT18-201ENST00000388835 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
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KRT18-201ENST00000388835 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.63■■■■■ 4.26
KRT18-201ENST00000388835 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.62■■■■■ 4.25
KRT18-201ENST00000388835 CLIP1P30622 1438 aa41.62■■■■■ 4.25
KRT18-201ENST00000388835 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.61■■■■■ 4.25
KRT18-201ENST00000388835 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.61■■■■■ 4.25
KRT18-201ENST00000388835 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.59■■■■■ 4.25
KRT18-201ENST00000388835 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.58■■■■■ 4.25
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