RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.01■□□□□ 0.79
ZBED1-203ENST00000381223 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20■□□□□ 0.79
ZBED1-203ENST00000381223 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.98■□□□□ 0.79
ZBED1-203ENST00000381223 TSPY4P0CV99 314 aa19.95■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 TSPY10P0CW01 314 aa19.95■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 MRS2Q9HD23 443 aa19.95■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 KCNH8Q96L42 1107 aa19.94■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.93■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 SMARCA4P51532 1647 aa19.92■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.91■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 RGL3Q3MIN7 710 aa19.89■□□□□ 0.77
ZBED1-203ENST00000381223 BCL11AQ9H165 835 aa19.87■□□□□ 0.77
ZBED1-203ENST00000381223 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
ZBED1-203ENST00000381223 SMARCA2P51531 1590 aa19.86■□□□□ 0.77
ZBED1-203ENST00000381223 FOXD1Q16676 465 aa19.85■□□□□ 0.77
ZBED1-203ENST00000381223 TMC1Q8TDI8 760 aa19.85■□□□□ 0.77
ZBED1-203ENST00000381223 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.83■□□□□ 0.77
ZBED1-203ENST00000381223 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
ZBED1-203ENST00000381223 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.79■□□□□ 0.76
ZBED1-203ENST00000381223 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
ZBED1-203ENST00000381223 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
ZBED1-203ENST00000381223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.76■□□□□ 0.75
ZBED1-203ENST00000381223 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
ZBED1-203ENST00000381223 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.73■□□□□ 0.75
ZBED1-203ENST00000381223 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.72■□□□□ 0.75
ZBED1-203ENST00000381223 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
ZBED1-203ENST00000381223 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.72■□□□□ 0.75
ZBED1-203ENST00000381223 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.69■□□□□ 0.74
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.66■□□□□ 0.74
ZBED1-203ENST00000381223 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.65■□□□□ 0.74
ZBED1-203ENST00000381223 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.64■□□□□ 0.73
ZBED1-203ENST00000381223 ERCC6Q03468 1493 aa19.61■□□□□ 0.73
ZBED1-203ENST00000381223 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
ZBED1-203ENST00000381223 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.61■□□□□ 0.73
ZBED1-203ENST00000381223 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
ZBED1-203ENST00000381223 SLC24A1O60721 1099 aa19.57■□□□□ 0.72
ZBED1-203ENST00000381223 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.57■□□□□ 0.72
ZBED1-203ENST00000381223 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
ZBED1-203ENST00000381223 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
ZBED1-203ENST00000381223 IGF1RP08069 1367 aa19.55■□□□□ 0.72
ZBED1-203ENST00000381223 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.55■□□□□ 0.72
ZBED1-203ENST00000381223 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.53■□□□□ 0.72
ZBED1-203ENST00000381223 PKD2Q13563 968 aa19.51■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.51■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.5■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.49■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 NBR1Q14596 966 aa19.48■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.48■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 FMN1Q68DA7 1419 aa19.48■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.48■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.47■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 SYNJ1O43426 1573 aa19.46■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
ZBED1-203ENST00000381223 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.45■□□□□ 0.7
ZBED1-203ENST00000381223 NEFMP07197 916 aa19.44■□□□□ 0.7
ZBED1-203ENST00000381223 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
ZBED1-203ENST00000381223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.43■□□□□ 0.7
ZBED1-203ENST00000381223 KIF21BO75037 1637 aa19.43■□□□□ 0.7
ZBED1-203ENST00000381223 ARAP1Q96P48 1450 aa19.38■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.38■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 NEUROD2Q15784 382 aa19.37■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.35■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 CCER2I3L3R5 266 aa19.35■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 NCAPD3P42695 1498 aa19.35■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 NUP155O75694 1391 aa19.34■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 JPH4Q96JJ6 628 aa19.33■□□□□ 0.68
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
ZBED1-203ENST00000381223 PLEKHG5O94827 1062 aa19.29■□□□□ 0.68
ZBED1-203ENST00000381223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.27■□□□□ 0.68
ZBED1-203ENST00000381223 NESP48681 1621 aa19.26■□□□□ 0.67
ZBED1-203ENST00000381223 PPP4R2Q9NY27 417 aa19.26■□□□□ 0.67
ZBED1-203ENST00000381223 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
ZBED1-203ENST00000381223 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.67
ZBED1-203ENST00000381223 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
ZBED1-203ENST00000381223 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.22■□□□□ 0.67
ZBED1-203ENST00000381223 GGT6Q6P531 493 aa19.22■□□□□ 0.67
ZBED1-203ENST00000381223 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.67
ZBED1-203ENST00000381223 CFTRP13569 1480 aa19.21■□□□□ 0.67
ZBED1-203ENST00000381223 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.2■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 PRXQ9BXM0 1461 aa19.2■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.18■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 CUX1P39880 1505 aa19.18■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 TMF1P82094 1093 aa19.18■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.18■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 ARXQ96QS3 562 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.16■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 RGS3P49796 1198 aa19.15■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.15■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 CDCA8Q53HL2 280 aa19.14■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms