RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.01■□□□□ 0.79
ZBED1-203ENST00000381223 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20■□□□□ 0.79
ZBED1-203ENST00000381223 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.98■□□□□ 0.79
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ZBED1-203ENST00000381223 TSPY10P0CW01 314 aa19.95■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 MRS2Q9HD23 443 aa19.95■□□□□ 0.78
ZBED1-203ENST00000381223 KCNH8Q96L42 1107 aa19.94■□□□□ 0.78
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ZBED1-203ENST00000381223 SMARCA2P51531 1590 aa19.86■□□□□ 0.77
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ZBED1-203ENST00000381223 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.38■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 NEUROD2Q15784 382 aa19.37■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.35■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 CCER2I3L3R5 266 aa19.35■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 NCAPD3P42695 1498 aa19.35■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 NUP155O75694 1391 aa19.34■□□□□ 0.69
ZBED1-203ENST00000381223 JPH4Q96JJ6 628 aa19.33■□□□□ 0.68
ZBED1-203ENST00000381223 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
ZBED1-203ENST00000381223 PLEKHG5O94827 1062 aa19.29■□□□□ 0.68
ZBED1-203ENST00000381223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.27■□□□□ 0.68
ZBED1-203ENST00000381223 NESP48681 1621 aa19.26■□□□□ 0.67
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ZBED1-203ENST00000381223 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.67
ZBED1-203ENST00000381223 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
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ZBED1-203ENST00000381223 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 ARXQ96QS3 562 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.16■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 RGS3P49796 1198 aa19.15■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.15■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 CDCA8Q53HL2 280 aa19.14■□□□□ 0.66
ZBED1-203ENST00000381223 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.14■□□□□ 0.65
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