RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
FAAP20-202ENST00000378546 JPH4Q96JJ6 628 aa43.9■■■■■ 4.62
FAAP20-202ENST00000378546 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.77■■■■■ 4.6
FAAP20-202ENST00000378546 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.76■■■■■ 4.6
FAAP20-202ENST00000378546 IQGAP2Q13576 1575 aa43.48■■■■■ 4.55
FAAP20-202ENST00000378546 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.45■■■■■ 4.55
FAAP20-202ENST00000378546 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.41■■■■■ 4.54
FAAP20-202ENST00000378546 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.4■■■■■ 4.54
FAAP20-202ENST00000378546 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.39■■■■■ 4.54
FAAP20-202ENST00000378546 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
FAAP20-202ENST00000378546 PTPRGP23470 1445 aa43.31■■■■■ 4.52
FAAP20-202ENST00000378546 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.3■■■■■ 4.52
FAAP20-202ENST00000378546 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.27■■■■■ 4.52
FAAP20-202ENST00000378546 MAPKBP1O60336 1514 aa43.25■■■■■ 4.51
FAAP20-202ENST00000378546 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.17■■■■■ 4.5
FAAP20-202ENST00000378546 DISP1Q96F81 1524 aa43.15■■■■■ 4.5
FAAP20-202ENST00000378546 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.15■■■■■ 4.5
FAAP20-202ENST00000378546 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.13■■■■■ 4.5
FAAP20-202ENST00000378546 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.11■■■■■ 4.49
FAAP20-202ENST00000378546 DIP2BQ9P265 1576 aa43.09■■■■■ 4.49
FAAP20-202ENST00000378546 KIAA0556O60303 1618 aa43.08■■■■■ 4.49
FAAP20-202ENST00000378546 PRXQ9BXM0 1461 aa43.04■■■■■ 4.48
FAAP20-202ENST00000378546 ABCC2Q92887 1545 aa43.02■■■■■ 4.48
FAAP20-202ENST00000378546 UACAQ9BZF9 1416 aa42.99■■■■■ 4.47
FAAP20-202ENST00000378546 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.95■■■■■ 4.47
FAAP20-202ENST00000378546 GOLGA3Q08378 1498 aa42.91■■■■■ 4.46
FAAP20-202ENST00000378546 TSPOAP1O95153 1857 aa42.85■■■■■ 4.45
FAAP20-202ENST00000378546 ASXL2Q76L83 1435 aa42.84■■■■■ 4.45
FAAP20-202ENST00000378546 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.83■■■■■ 4.45
FAAP20-202ENST00000378546 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.81■■■■■ 4.44
FAAP20-202ENST00000378546 EEA1Q15075 1411 aa42.78■■■■■ 4.44
FAAP20-202ENST00000378546 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
FAAP20-202ENST00000378546 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.76■■■■■ 4.44
FAAP20-202ENST00000378546 KDM6BO15054 1643 aa42.68■■■■■ 4.42
FAAP20-202ENST00000378546 GLI2P10070 1586 aa42.65■■■■■ 4.42
FAAP20-202ENST00000378546 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
FAAP20-202ENST00000378546 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
FAAP20-202ENST00000378546 ABCA8O94911 1581 aa42.6■■■■■ 4.41
FAAP20-202ENST00000378546 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
FAAP20-202ENST00000378546 P3H3Q8IVL6 736 aa42.56■■■■■ 4.4
FAAP20-202ENST00000378546 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.51■■■■■ 4.4
FAAP20-202ENST00000378546 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.39
FAAP20-202ENST00000378546 SAMD9Q5K651 1589 aa42.49■■■■■ 4.39
FAAP20-202ENST00000378546 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.47■■■■■ 4.39
FAAP20-202ENST00000378546 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
FAAP20-202ENST00000378546 KIF21BO75037 1637 aa42.43■■■■■ 4.38
FAAP20-202ENST00000378546 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.37■■■■■ 4.37
FAAP20-202ENST00000378546 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.36■■■■■ 4.37
FAAP20-202ENST00000378546 ARID3CA6NKF2 412 aa42.36■■■■■ 4.37
FAAP20-202ENST00000378546 KCNH8Q96L42 1107 aa42.31■■■■■ 4.36
FAAP20-202ENST00000378546 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.3■■■■■ 4.36
FAAP20-202ENST00000378546 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.25■■■■■ 4.35
FAAP20-202ENST00000378546 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.24■■■■■ 4.35
FAAP20-202ENST00000378546 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.23■■■■■ 4.35
FAAP20-202ENST00000378546 ATP10BO94823 1461 aa42.22■■■■■ 4.35
FAAP20-202ENST00000378546 CD109Q6YHK3 1445 aa42.2■■■■■ 4.35
FAAP20-202ENST00000378546 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.19■■■■■ 4.34
FAAP20-202ENST00000378546 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
FAAP20-202ENST00000378546 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
FAAP20-202ENST00000378546 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
FAAP20-202ENST00000378546 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.11■■■■■ 4.33
FAAP20-202ENST00000378546 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
FAAP20-202ENST00000378546 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
FAAP20-202ENST00000378546 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.98■■■■■ 4.31
FAAP20-202ENST00000378546 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.9■■■■■ 4.3
FAAP20-202ENST00000378546 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.83■■■■■ 4.29
FAAP20-202ENST00000378546 ADGRL1O94910 1474 aa41.8■■■■■ 4.28
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.8■■■■■ 4.28
FAAP20-202ENST00000378546 FMN1Q68DA7 1419 aa41.79■■■■■ 4.28
FAAP20-202ENST00000378546 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
FAAP20-202ENST00000378546 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.76■■■■■ 4.28
FAAP20-202ENST00000378546 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
FAAP20-202ENST00000378546 HECW1Q76N89 1606 aa41.75■■■■■ 4.27
FAAP20-202ENST00000378546 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.72■■■■■ 4.27
FAAP20-202ENST00000378546 NEO1Q92859 1461 aa41.7■■■■■ 4.27
FAAP20-202ENST00000378546 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.63■■■■■ 4.255e-8■■■□□ 16
FAAP20-202ENST00000378546 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.62■■■■■ 4.25
FAAP20-202ENST00000378546 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.58■■■■■ 4.25
FAAP20-202ENST00000378546 RAPGEF3O95398 923 aa41.54■■■■■ 4.24
FAAP20-202ENST00000378546 FANCAO15360 1455 aa41.53■■■■■ 4.24
FAAP20-202ENST00000378546 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
FAAP20-202ENST00000378546 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.49■■■■■ 4.23
FAAP20-202ENST00000378546 AKNAQ7Z591 1439 aa41.46■■■■■ 4.23
FAAP20-202ENST00000378546 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
FAAP20-202ENST00000378546 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
FAAP20-202ENST00000378546 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.43■■■■■ 4.22
FAAP20-202ENST00000378546 KIF14Q15058 1648 aa41.42■■■■■ 4.22
FAAP20-202ENST00000378546 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.39■■■■■ 4.22
FAAP20-202ENST00000378546 CLIP1P30622 1438 aa41.39■■■■■ 4.22
FAAP20-202ENST00000378546 RICTORQ6R327 1708 aa41.38■■■■■ 4.22
FAAP20-202ENST00000378546 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
FAAP20-202ENST00000378546 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.35■■■■■ 4.21
FAAP20-202ENST00000378546 PLCH2O75038 1416 aa41.34■■■■■ 4.21
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.33■■■■■ 4.21
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.3■■■■■ 4.2
FAAP20-202ENST00000378546 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
FAAP20-202ENST00000378546 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.25■■■■■ 4.19
FAAP20-202ENST00000378546 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.23■■■■■ 4.19
FAAP20-202ENST00000378546 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.22■■■■■ 4.19
FAAP20-202ENST00000378546 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.21■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms