RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371368.5

LRRC42-202, Transcript of leucine rich repeat containing 42, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC42, Length 838 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42-202ENST00000371368 CUL7Q14999 1698 aa29.47■■■□□ 2.31
LRRC42-202ENST00000371368 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.45■■■□□ 2.3
LRRC42-202ENST00000371368 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.41■■■□□ 2.3
LRRC42-202ENST00000371368 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.38■■■□□ 2.29
LRRC42-202ENST00000371368 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.15■■■□□ 2.26
LRRC42-202ENST00000371368 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
LRRC42-202ENST00000371368 IQGAP2Q13576 1575 aa29.11■■■□□ 2.25
LRRC42-202ENST00000371368 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.09■■■□□ 2.25
LRRC42-202ENST00000371368 PTPRGP23470 1445 aa29.07■■■□□ 2.24
LRRC42-202ENST00000371368 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.06■■■□□ 2.24
LRRC42-202ENST00000371368 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.04■■■□□ 2.24
LRRC42-202ENST00000371368 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
LRRC42-202ENST00000371368 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.98■■■□□ 2.23
LRRC42-202ENST00000371368 MAPKBP1O60336 1514 aa28.97■■■□□ 2.23
LRRC42-202ENST00000371368 DISP1Q96F81 1524 aa28.97■■■□□ 2.23
LRRC42-202ENST00000371368 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.95■■■□□ 2.23
LRRC42-202ENST00000371368 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.95■■■□□ 2.22
LRRC42-202ENST00000371368 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.94■■■□□ 2.22
LRRC42-202ENST00000371368 PRXQ9BXM0 1461 aa28.92■■■□□ 2.22
LRRC42-202ENST00000371368 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.86■■■□□ 2.21
LRRC42-202ENST00000371368 UACAQ9BZF9 1416 aa28.85■■■□□ 2.21
LRRC42-202ENST00000371368 ABCC2Q92887 1545 aa28.84■■■□□ 2.21
LRRC42-202ENST00000371368 DIP2BQ9P265 1576 aa28.84■■■□□ 2.21
LRRC42-202ENST00000371368 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.84■■■□□ 2.21
LRRC42-202ENST00000371368 KIAA0556O60303 1618 aa28.83■■■□□ 2.21
LRRC42-202ENST00000371368 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.83■■■□□ 2.21
LRRC42-202ENST00000371368 GOLGA3Q08378 1498 aa28.76■■■□□ 2.19
LRRC42-202ENST00000371368 ASXL2Q76L83 1435 aa28.73■■■□□ 2.19
LRRC42-202ENST00000371368 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.72■■■□□ 2.19
LRRC42-202ENST00000371368 EEA1Q15075 1411 aa28.7■■■□□ 2.19
LRRC42-202ENST00000371368 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.7■■■□□ 2.19
LRRC42-202ENST00000371368 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
LRRC42-202ENST00000371368 TSPOAP1O95153 1857 aa28.63■■■□□ 2.17
LRRC42-202ENST00000371368 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
LRRC42-202ENST00000371368 GLI2P10070 1586 aa28.61■■■□□ 2.17
LRRC42-202ENST00000371368 P3H3Q8IVL6 736 aa28.59■■■□□ 2.17
LRRC42-202ENST00000371368 ABCA8O94911 1581 aa28.58■■■□□ 2.17
LRRC42-202ENST00000371368 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.56■■■□□ 2.16
LRRC42-202ENST00000371368 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
LRRC42-202ENST00000371368 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
LRRC42-202ENST00000371368 KDM6BO15054 1643 aa28.53■■■□□ 2.16
LRRC42-202ENST00000371368 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.48■■■□□ 2.15
LRRC42-202ENST00000371368 SAMD9Q5K651 1589 aa28.48■■■□□ 2.15
LRRC42-202ENST00000371368 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
LRRC42-202ENST00000371368 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
LRRC42-202ENST00000371368 KIF21BO75037 1637 aa28.43■■■□□ 2.14
LRRC42-202ENST00000371368 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.43■■■□□ 2.14
LRRC42-202ENST00000371368 KCNH8Q96L42 1107 aa28.42■■■□□ 2.14
LRRC42-202ENST00000371368 ARID3CA6NKF2 412 aa28.39■■■□□ 2.14
LRRC42-202ENST00000371368 ATP10BO94823 1461 aa28.37■■■□□ 2.13
LRRC42-202ENST00000371368 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.35■■■□□ 2.13
LRRC42-202ENST00000371368 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.32■■■□□ 2.12
LRRC42-202ENST00000371368 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.32■■■□□ 2.12
LRRC42-202ENST00000371368 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.32■■■□□ 2.12
LRRC42-202ENST00000371368 CD109Q6YHK3 1445 aa28.31■■■□□ 2.12
LRRC42-202ENST00000371368 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
LRRC42-202ENST00000371368 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
LRRC42-202ENST00000371368 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.28■■■□□ 2.12
LRRC42-202ENST00000371368 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
LRRC42-202ENST00000371368 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
LRRC42-202ENST00000371368 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.25■■■□□ 2.11
LRRC42-202ENST00000371368 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.25■■■□□ 2.11
LRRC42-202ENST00000371368 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
LRRC42-202ENST00000371368 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.17■■■□□ 2.1
LRRC42-202ENST00000371368 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.12■■■□□ 2.09
LRRC42-202ENST00000371368 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.11■■■□□ 2.09
LRRC42-202ENST00000371368 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.07■■■□□ 2.08
LRRC42-202ENST00000371368 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.03■■■□□ 2.08
LRRC42-202ENST00000371368 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.03■■■□□ 2.08
LRRC42-202ENST00000371368 FMN1Q68DA7 1419 aa28.02■■■□□ 2.08
LRRC42-202ENST00000371368 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
LRRC42-202ENST00000371368 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
LRRC42-202ENST00000371368 ADGRL1O94910 1474 aa27.97■■■□□ 2.07
LRRC42-202ENST00000371368 NEO1Q92859 1461 aa27.97■■■□□ 2.07
LRRC42-202ENST00000371368 HECW1Q76N89 1606 aa27.92■■■□□ 2.06
LRRC42-202ENST00000371368 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
LRRC42-202ENST00000371368 RAPGEF3O95398 923 aa27.91■■■□□ 2.06
LRRC42-202ENST00000371368 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
LRRC42-202ENST00000371368 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.85■■■□□ 2.05
LRRC42-202ENST00000371368 AKNAQ7Z591 1439 aa27.84■■■□□ 2.05
LRRC42-202ENST00000371368 FANCAO15360 1455 aa27.83■■■□□ 2.04
LRRC42-202ENST00000371368 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.79■■■□□ 2.04
LRRC42-202ENST00000371368 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.78■■■□□ 2.04
LRRC42-202ENST00000371368 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
LRRC42-202ENST00000371368 PLCH2O75038 1416 aa27.77■■■□□ 2.04
LRRC42-202ENST00000371368 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.75■■■□□ 2.03
LRRC42-202ENST00000371368 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.75■■■□□ 2.03
LRRC42-202ENST00000371368 CLIP1P30622 1438 aa27.75■■■□□ 2.03
LRRC42-202ENST00000371368 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
LRRC42-202ENST00000371368 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
LRRC42-202ENST00000371368 RICTORQ6R327 1708 aa27.71■■■□□ 2.03
LRRC42-202ENST00000371368 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.7■■■□□ 2.02
LRRC42-202ENST00000371368 KIF14Q15058 1648 aa27.7■■■□□ 2.02
LRRC42-202ENST00000371368 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.68■■■□□ 2.02
LRRC42-202ENST00000371368 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.67■■■□□ 2.02
LRRC42-202ENST00000371368 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.67■■■□□ 2.02
LRRC42-202ENST00000371368 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
LRRC42-202ENST00000371368 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.64■■■□□ 2.01
LRRC42-202ENST00000371368 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.61■■■□□ 2.01
LRRC42-202ENST00000371368 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms