RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369484.7

CMC4-202, Transcript of C-X9-C motif containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMC4, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC4-202ENST00000369484 CUL7Q14999 1698 aa46.83■■■■■ 5.09
CMC4-202ENST00000369484 KIF27Q86VH2 1401 aa46.8■■■■■ 5.08
CMC4-202ENST00000369484 IGF1RP08069 1367 aa46.79■■■■■ 5.08
CMC4-202ENST00000369484 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.72■■■■■ 5.07
CMC4-202ENST00000369484 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.62■■■■■ 5.05
CMC4-202ENST00000369484 MAPKBP1O60336 1514 aa46.59■■■■■ 5.05
CMC4-202ENST00000369484 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.52■■■■■ 5.04
CMC4-202ENST00000369484 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
CMC4-202ENST00000369484 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.48■■■■■ 5.03
CMC4-202ENST00000369484 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.47■■■■■ 5.03
CMC4-202ENST00000369484 DIP2BQ9P265 1576 aa46.46■■■■■ 5.03
CMC4-202ENST00000369484 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.39■■■■■ 5.02
CMC4-202ENST00000369484 IQGAP2Q13576 1575 aa46.3■■■■■ 5
CMC4-202ENST00000369484 PTPRGP23470 1445 aa46.27■■■■■ 5
CMC4-202ENST00000369484 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.23■■■■■ 4.99
CMC4-202ENST00000369484 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.2■■■■■ 4.99
CMC4-202ENST00000369484 TSPOAP1O95153 1857 aa46.18■■■■■ 4.98
CMC4-202ENST00000369484 ABCC2Q92887 1545 aa46.11■■■■■ 4.97
CMC4-202ENST00000369484 DISP1Q96F81 1524 aa46.08■■■■■ 4.97
CMC4-202ENST00000369484 KDM6BO15054 1643 aa46.07■■■■■ 4.97
CMC4-202ENST00000369484 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.06■■■■■ 4.96
CMC4-202ENST00000369484 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
CMC4-202ENST00000369484 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.03■■■■■ 4.96
CMC4-202ENST00000369484 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.99■■■■■ 4.95
CMC4-202ENST00000369484 UACAQ9BZF9 1416 aa45.94■■■■■ 4.95
CMC4-202ENST00000369484 ASXL2Q76L83 1435 aa45.94■■■■■ 4.94
CMC4-202ENST00000369484 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.93■■■■■ 4.94
CMC4-202ENST00000369484 GLI2P10070 1586 aa45.91■■■■■ 4.94
CMC4-202ENST00000369484 KIAA0556O60303 1618 aa45.89■■■■■ 4.94
CMC4-202ENST00000369484 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
CMC4-202ENST00000369484 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.85■■■■■ 4.93
CMC4-202ENST00000369484 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.82■■■■■ 4.93
CMC4-202ENST00000369484 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
CMC4-202ENST00000369484 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
CMC4-202ENST00000369484 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.68■■■■■ 4.9
CMC4-202ENST00000369484 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.59■■■■■ 4.89
CMC4-202ENST00000369484 PRXQ9BXM0 1461 aa45.57■■■■■ 4.89
CMC4-202ENST00000369484 GOLGA3Q08378 1498 aa45.56■■■■■ 4.88
CMC4-202ENST00000369484 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.49■■■■■ 4.87
CMC4-202ENST00000369484 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.49■■■■■ 4.87
CMC4-202ENST00000369484 ABCA8O94911 1581 aa45.48■■■■■ 4.87
CMC4-202ENST00000369484 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
CMC4-202ENST00000369484 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.33■■■■■ 4.85
CMC4-202ENST00000369484 ADGRL1O94910 1474 aa45.24■■■■■ 4.83
CMC4-202ENST00000369484 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.22■■■■■ 4.83
CMC4-202ENST00000369484 CD109Q6YHK3 1445 aa45.18■■■■■ 4.82
CMC4-202ENST00000369484 SAMD9Q5K651 1589 aa45.13■■■■■ 4.82
CMC4-202ENST00000369484 KCNH8Q96L42 1107 aa45.12■■■■■ 4.81
CMC4-202ENST00000369484 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.08■■■■■ 4.81
CMC4-202ENST00000369484 ATP10BO94823 1461 aa45.04■■■■■ 4.8
CMC4-202ENST00000369484 P3H3Q8IVL6 736 aa45.03■■■■■ 4.8
CMC4-202ENST00000369484 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
CMC4-202ENST00000369484 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.97■■■■■ 4.79
CMC4-202ENST00000369484 EEA1Q15075 1411 aa44.94■■■■■ 4.79
CMC4-202ENST00000369484 ARID3CA6NKF2 412 aa44.93■■■■■ 4.78
CMC4-202ENST00000369484 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.93■■■■■ 4.78
CMC4-202ENST00000369484 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.88■■■■■ 4.78
CMC4-202ENST00000369484 KIF21BO75037 1637 aa44.8■■■■■ 4.76
CMC4-202ENST00000369484 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
CMC4-202ENST00000369484 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.73■■■■■ 4.75
CMC4-202ENST00000369484 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.71■■■■■ 4.75
CMC4-202ENST00000369484 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.71■■■■■ 4.75
CMC4-202ENST00000369484 NEO1Q92859 1461 aa44.66■■■■■ 4.74
CMC4-202ENST00000369484 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
CMC4-202ENST00000369484 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.62■■■■■ 4.73
CMC4-202ENST00000369484 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.61■■■■■ 4.73
CMC4-202ENST00000369484 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
CMC4-202ENST00000369484 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.55■■■■■ 4.72
CMC4-202ENST00000369484 RAPGEF3O95398 923 aa44.5■■■■■ 4.71
CMC4-202ENST00000369484 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.47■■■■■ 4.71
CMC4-202ENST00000369484 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.43■■■■■ 4.7
CMC4-202ENST00000369484 RICTORQ6R327 1708 aa44.4■■■■■ 4.7
CMC4-202ENST00000369484 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.4■■■■■ 4.7
CMC4-202ENST00000369484 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.39■■■■■ 4.7
CMC4-202ENST00000369484 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.36■■■■■ 4.69
CMC4-202ENST00000369484 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.36■■■■■ 4.69
CMC4-202ENST00000369484 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
CMC4-202ENST00000369484 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.32■■■■■ 4.69
CMC4-202ENST00000369484 FANCAO15360 1455 aa44.31■■■■■ 4.68
CMC4-202ENST00000369484 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.3■■■■■ 4.68
CMC4-202ENST00000369484 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
CMC4-202ENST00000369484 PTPRMP28827 1452 aa44.3■■■■■ 4.68
CMC4-202ENST00000369484 AKNAQ7Z591 1439 aa44.3■■■■■ 4.68
CMC4-202ENST00000369484 MADDQ8WXG6 1647 aa44.24■■■■■ 4.67
CMC4-202ENST00000369484 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.19■■■■■ 4.67
CMC4-202ENST00000369484 HECW1Q76N89 1606 aa44.17■■■■■ 4.66
CMC4-202ENST00000369484 FMN1Q68DA7 1419 aa44.16■■■■■ 4.66
CMC4-202ENST00000369484 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.15■■■■■ 4.66
CMC4-202ENST00000369484 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
CMC4-202ENST00000369484 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
CMC4-202ENST00000369484 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.09■■■■■ 4.65
CMC4-202ENST00000369484 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.09■■■■■ 4.65
CMC4-202ENST00000369484 PLCH2O75038 1416 aa44.07■■■■■ 4.65
CMC4-202ENST00000369484 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
CMC4-202ENST00000369484 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.07■■■■■ 4.65
CMC4-202ENST00000369484 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.07■■■■■ 4.64
CMC4-202ENST00000369484 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.06■■■■■ 4.64
CMC4-202ENST00000369484 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.03■■■■■ 4.64
CMC4-202ENST00000369484 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.01■■■■■ 4.64
CMC4-202ENST00000369484 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.99■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms