RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369484.7

CMC4-202, Transcript of C-X9-C motif containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMC4, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC4-202ENST00000369484 CUL7Q14999 1698 aa46.83■■■■■ 5.09
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CMC4-202ENST00000369484 IGF1RP08069 1367 aa46.79■■■■■ 5.08
CMC4-202ENST00000369484 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.72■■■■■ 5.07
CMC4-202ENST00000369484 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.62■■■■■ 5.05
CMC4-202ENST00000369484 MAPKBP1O60336 1514 aa46.59■■■■■ 5.05
CMC4-202ENST00000369484 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.52■■■■■ 5.04
CMC4-202ENST00000369484 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
CMC4-202ENST00000369484 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.48■■■■■ 5.03
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CMC4-202ENST00000369484 DIP2BQ9P265 1576 aa46.46■■■■■ 5.03
CMC4-202ENST00000369484 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.39■■■■■ 5.02
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CMC4-202ENST00000369484 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.2■■■■■ 4.99
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CMC4-202ENST00000369484 ABCC2Q92887 1545 aa46.11■■■■■ 4.97
CMC4-202ENST00000369484 DISP1Q96F81 1524 aa46.08■■■■■ 4.97
CMC4-202ENST00000369484 KDM6BO15054 1643 aa46.07■■■■■ 4.97
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CMC4-202ENST00000369484 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
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CMC4-202ENST00000369484 ASXL2Q76L83 1435 aa45.94■■■■■ 4.94
CMC4-202ENST00000369484 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.93■■■■■ 4.94
CMC4-202ENST00000369484 GLI2P10070 1586 aa45.91■■■■■ 4.94
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CMC4-202ENST00000369484 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.82■■■■■ 4.93
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CMC4-202ENST00000369484 PRXQ9BXM0 1461 aa45.57■■■■■ 4.89
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CMC4-202ENST00000369484 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.49■■■■■ 4.87
CMC4-202ENST00000369484 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.49■■■■■ 4.87
CMC4-202ENST00000369484 ABCA8O94911 1581 aa45.48■■■■■ 4.87
CMC4-202ENST00000369484 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
CMC4-202ENST00000369484 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.33■■■■■ 4.85
CMC4-202ENST00000369484 ADGRL1O94910 1474 aa45.24■■■■■ 4.83
CMC4-202ENST00000369484 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.22■■■■■ 4.83
CMC4-202ENST00000369484 CD109Q6YHK3 1445 aa45.18■■■■■ 4.82
CMC4-202ENST00000369484 SAMD9Q5K651 1589 aa45.13■■■■■ 4.82
CMC4-202ENST00000369484 KCNH8Q96L42 1107 aa45.12■■■■■ 4.81
CMC4-202ENST00000369484 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.08■■■■■ 4.81
CMC4-202ENST00000369484 ATP10BO94823 1461 aa45.04■■■■■ 4.8
CMC4-202ENST00000369484 P3H3Q8IVL6 736 aa45.03■■■■■ 4.8
CMC4-202ENST00000369484 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
CMC4-202ENST00000369484 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.97■■■■■ 4.79
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CMC4-202ENST00000369484 ARID3CA6NKF2 412 aa44.93■■■■■ 4.78
CMC4-202ENST00000369484 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.93■■■■■ 4.78
CMC4-202ENST00000369484 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.88■■■■■ 4.78
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CMC4-202ENST00000369484 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.71■■■■■ 4.75
CMC4-202ENST00000369484 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.71■■■■■ 4.75
CMC4-202ENST00000369484 NEO1Q92859 1461 aa44.66■■■■■ 4.74
CMC4-202ENST00000369484 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
CMC4-202ENST00000369484 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.62■■■■■ 4.73
CMC4-202ENST00000369484 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.61■■■■■ 4.73
CMC4-202ENST00000369484 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
CMC4-202ENST00000369484 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.55■■■■■ 4.72
CMC4-202ENST00000369484 RAPGEF3O95398 923 aa44.5■■■■■ 4.71
CMC4-202ENST00000369484 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.47■■■■■ 4.71
CMC4-202ENST00000369484 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.43■■■■■ 4.7
CMC4-202ENST00000369484 RICTORQ6R327 1708 aa44.4■■■■■ 4.7
CMC4-202ENST00000369484 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.4■■■■■ 4.7
CMC4-202ENST00000369484 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.39■■■■■ 4.7
CMC4-202ENST00000369484 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.36■■■■■ 4.69
CMC4-202ENST00000369484 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.36■■■■■ 4.69
CMC4-202ENST00000369484 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
CMC4-202ENST00000369484 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.32■■■■■ 4.69
CMC4-202ENST00000369484 FANCAO15360 1455 aa44.31■■■■■ 4.68
CMC4-202ENST00000369484 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.3■■■■■ 4.68
CMC4-202ENST00000369484 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
CMC4-202ENST00000369484 PTPRMP28827 1452 aa44.3■■■■■ 4.68
CMC4-202ENST00000369484 AKNAQ7Z591 1439 aa44.3■■■■■ 4.68
CMC4-202ENST00000369484 MADDQ8WXG6 1647 aa44.24■■■■■ 4.67
CMC4-202ENST00000369484 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.19■■■■■ 4.67
CMC4-202ENST00000369484 HECW1Q76N89 1606 aa44.17■■■■■ 4.66
CMC4-202ENST00000369484 FMN1Q68DA7 1419 aa44.16■■■■■ 4.66
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CMC4-202ENST00000369484 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
CMC4-202ENST00000369484 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.09■■■■■ 4.65
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CMC4-202ENST00000369484 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.01■■■■■ 4.64
CMC4-202ENST00000369484 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.99■■■■■ 4.63
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