RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369031.4

PDSS2-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS2, Length 1,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2-201ENST00000369031 PRXQ9BXM0 1461 aa26.85■■□□□ 1.89
PDSS2-201ENST00000369031 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PDSS2-201ENST00000369031 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.79■■□□□ 1.88
PDSS2-201ENST00000369031 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.78■■□□□ 1.88
PDSS2-201ENST00000369031 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.77■■□□□ 1.88
PDSS2-201ENST00000369031 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.76■■□□□ 1.87
PDSS2-201ENST00000369031 ARAP1Q96P48 1450 aa26.74■■□□□ 1.87
PDSS2-201ENST00000369031 IQGAP2Q13576 1575 aa26.73■■□□□ 1.87
PDSS2-201ENST00000369031 KIF21BO75037 1637 aa26.69■■□□□ 1.86
PDSS2-201ENST00000369031 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PDSS2-201ENST00000369031 JPH4Q96JJ6 628 aa26.65■■□□□ 1.86
PDSS2-201ENST00000369031 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.57■■□□□ 1.84
PDSS2-201ENST00000369031 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.55■■□□□ 1.84
PDSS2-201ENST00000369031 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.54■■□□□ 1.84
PDSS2-201ENST00000369031 DISP1Q96F81 1524 aa26.51■■□□□ 1.83
PDSS2-201ENST00000369031 GOLGA3Q08378 1498 aa26.51■■□□□ 1.83
PDSS2-201ENST00000369031 KIAA0556O60303 1618 aa26.5■■□□□ 1.83
PDSS2-201ENST00000369031 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.46■■□□□ 1.83
PDSS2-201ENST00000369031 SAMD9Q5K651 1589 aa26.37■■□□□ 1.81
PDSS2-201ENST00000369031 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.37■■□□□ 1.81
PDSS2-201ENST00000369031 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PDSS2-201ENST00000369031 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PDSS2-201ENST00000369031 PTPRGP23470 1445 aa26.33■■□□□ 1.81
PDSS2-201ENST00000369031 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.33■■□□□ 1.81
PDSS2-201ENST00000369031 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
PDSS2-201ENST00000369031 P3H3Q8IVL6 736 aa26.25■■□□□ 1.79
PDSS2-201ENST00000369031 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.24■■□□□ 1.79
PDSS2-201ENST00000369031 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.22■■□□□ 1.79
PDSS2-201ENST00000369031 ABCC2Q92887 1545 aa26.19■■□□□ 1.78
PDSS2-201ENST00000369031 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.18■■□□□ 1.78
PDSS2-201ENST00000369031 UACAQ9BZF9 1416 aa26.18■■□□□ 1.78
PDSS2-201ENST00000369031 ABCA8O94911 1581 aa26.16■■□□□ 1.78
PDSS2-201ENST00000369031 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.16■■□□□ 1.78
PDSS2-201ENST00000369031 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.16■■□□□ 1.78
PDSS2-201ENST00000369031 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PDSS2-201ENST00000369031 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.08■■□□□ 1.77
PDSS2-201ENST00000369031 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.06■■□□□ 1.76
PDSS2-201ENST00000369031 MAPKBP1O60336 1514 aa26.05■■□□□ 1.76
PDSS2-201ENST00000369031 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.04■■□□□ 1.76
PDSS2-201ENST00000369031 CLIP1P30622 1438 aa26.03■■□□□ 1.76
PDSS2-201ENST00000369031 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
PDSS2-201ENST00000369031 CEP162Q5TB80 1403 aa25.98■■□□□ 1.75
PDSS2-201ENST00000369031 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.98■■□□□ 1.75
PDSS2-201ENST00000369031 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PDSS2-201ENST00000369031 ARID3CA6NKF2 412 aa25.96■■□□□ 1.75
PDSS2-201ENST00000369031 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PDSS2-201ENST00000369031 ASXL2Q76L83 1435 aa25.95■■□□□ 1.74
PDSS2-201ENST00000369031 DIP2BQ9P265 1576 aa25.95■■□□□ 1.74
PDSS2-201ENST00000369031 FMN1Q68DA7 1419 aa25.94■■□□□ 1.74
PDSS2-201ENST00000369031 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PDSS2-201ENST00000369031 HECW1Q76N89 1606 aa25.9■■□□□ 1.74
PDSS2-201ENST00000369031 ATP10BO94823 1461 aa25.9■■□□□ 1.74
PDSS2-201ENST00000369031 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.89■■□□□ 1.73
PDSS2-201ENST00000369031 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.87■■□□□ 1.73
PDSS2-201ENST00000369031 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PDSS2-201ENST00000369031 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.85■■□□□ 1.73
PDSS2-201ENST00000369031 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PDSS2-201ENST00000369031 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.79■■□□□ 1.72
PDSS2-201ENST00000369031 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.78■■□□□ 1.72
PDSS2-201ENST00000369031 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PDSS2-201ENST00000369031 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.77■■□□□ 1.72
PDSS2-201ENST00000369031 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PDSS2-201ENST00000369031 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PDSS2-201ENST00000369031 GLI2P10070 1586 aa25.76■■□□□ 1.71
PDSS2-201ENST00000369031 TSPOAP1O95153 1857 aa25.76■■□□□ 1.71
PDSS2-201ENST00000369031 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.72■■□□□ 1.71
PDSS2-201ENST00000369031 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PDSS2-201ENST00000369031 KCNH8Q96L42 1107 aa25.68■■□□□ 1.7
PDSS2-201ENST00000369031 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.67■■□□□ 1.7
PDSS2-201ENST00000369031 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.67■■□□□ 1.7
PDSS2-201ENST00000369031 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.63■■□□□ 1.69
PDSS2-201ENST00000369031 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.63■■□□□ 1.69
PDSS2-201ENST00000369031 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.6■■□□□ 1.69
PDSS2-201ENST00000369031 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.6■■□□□ 1.69
PDSS2-201ENST00000369031 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.59■■□□□ 1.69
PDSS2-201ENST00000369031 KIF14Q15058 1648 aa25.59■■□□□ 1.69
PDSS2-201ENST00000369031 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
PDSS2-201ENST00000369031 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PDSS2-201ENST00000369031 CD109Q6YHK3 1445 aa25.54■■□□□ 1.68
PDSS2-201ENST00000369031 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PDSS2-201ENST00000369031 TIAM1Q13009 1591 aa25.49■■□□□ 1.67
PDSS2-201ENST00000369031 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.49■■□□□ 1.67
PDSS2-201ENST00000369031 KDM6BO15054 1643 aa25.46■■□□□ 1.67
PDSS2-201ENST00000369031 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.46■■□□□ 1.67
PDSS2-201ENST00000369031 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.43■■□□□ 1.66
PDSS2-201ENST00000369031 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.4■■□□□ 1.66
PDSS2-201ENST00000369031 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS2-201ENST00000369031 PREX2Q70Z35 1606 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS2-201ENST00000369031 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.36■■□□□ 1.65
PDSS2-201ENST00000369031 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PDSS2-201ENST00000369031 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.35■■□□□ 1.65
PDSS2-201ENST00000369031 MAP3K1Q13233 1512 aa25.35■■□□□ 1.65
PDSS2-201ENST00000369031 FANCAO15360 1455 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS2-201ENST00000369031 NEO1Q92859 1461 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS2-201ENST00000369031 PLCH2O75038 1416 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS2-201ENST00000369031 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS2-201ENST00000369031 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PDSS2-201ENST00000369031 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.32■■□□□ 1.64
PDSS2-201ENST00000369031 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.31■■□□□ 1.64
PDSS2-201ENST00000369031 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
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