RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362091.8

FBXO18-201, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO18, Length 3,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-201ENST00000362091 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
FBXO18-201ENST00000362091 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.96■■□□□ 1.43
FBXO18-201ENST00000362091 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
FBXO18-201ENST00000362091 ANP32CO43423 234 aa23.93■■□□□ 1.42
FBXO18-201ENST00000362091 KIF27Q86VH2 1401 aa23.93■■□□□ 1.42
FBXO18-201ENST00000362091 MSH5O43196 834 aa23.9■■□□□ 1.42
FBXO18-201ENST00000362091 CUX1P39880 1505 aa23.88■■□□□ 1.41
FBXO18-201ENST00000362091 CCER2I3L3R5 266 aa23.87■■□□□ 1.41
FBXO18-201ENST00000362091 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.85■■□□□ 1.41
FBXO18-201ENST00000362091 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
FBXO18-201ENST00000362091 TIAM1Q13009 1591 aa23.83■■□□□ 1.41
FBXO18-201ENST00000362091 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
FBXO18-201ENST00000362091 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.77■■□□□ 1.4
FBXO18-201ENST00000362091 P3H3Q8IVL6 736 aa23.75■■□□□ 1.39
FBXO18-201ENST00000362091 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.72■■□□□ 1.39
FBXO18-201ENST00000362091 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
FBXO18-201ENST00000362091 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.7■■□□□ 1.38
FBXO18-201ENST00000362091 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FBXO18-201ENST00000362091 MAP3K1Q13233 1512 aa23.67■■□□□ 1.38
FBXO18-201ENST00000362091 TONSLQ96HA7 1378 aa23.67■■□□□ 1.38
FBXO18-201ENST00000362091 IGF1RP08069 1367 aa23.65■■□□□ 1.38
FBXO18-201ENST00000362091 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.64■■□□□ 1.37
FBXO18-201ENST00000362091 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.58■■□□□ 1.37
FBXO18-201ENST00000362091 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
FBXO18-201ENST00000362091 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.54■■□□□ 1.36
FBXO18-201ENST00000362091 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.52■■□□□ 1.36
FBXO18-201ENST00000362091 CFTRP13569 1480 aa23.51■■□□□ 1.35
FBXO18-201ENST00000362091 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.5■■□□□ 1.35
FBXO18-201ENST00000362091 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.48■■□□□ 1.35
FBXO18-201ENST00000362091 CCDC184Q52MB2 194 aa23.46■■□□□ 1.35
FBXO18-201ENST00000362091 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.45■■□□□ 1.34
FBXO18-201ENST00000362091 NCAPD3P42695 1498 aa23.45■■□□□ 1.34
FBXO18-201ENST00000362091 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.44■■□□□ 1.34
FBXO18-201ENST00000362091 HMGXB3Q12766 1538 aa23.43■■□□□ 1.34
FBXO18-201ENST00000362091 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.43■■□□□ 1.34
FBXO18-201ENST00000362091 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
FBXO18-201ENST00000362091 PTPRKQ15262 1439 aa23.41■■□□□ 1.34
FBXO18-201ENST00000362091 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.4■■□□□ 1.34
FBXO18-201ENST00000362091 UACAQ9BZF9 1416 aa23.4■■□□□ 1.34
FBXO18-201ENST00000362091 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.4■■□□□ 1.34
FBXO18-201ENST00000362091 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.38■■□□□ 1.33
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FBXO18-201ENST00000362091 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.338e-7■■■■□ 26.1
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FBXO18-201ENST00000362091 HFM1A2PYH4 1435 aa23.34■■□□□ 1.33
FBXO18-201ENST00000362091 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.34■■□□□ 1.33
FBXO18-201ENST00000362091 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.33■■□□□ 1.33
FBXO18-201ENST00000362091 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.33■■□□□ 1.33
FBXO18-201ENST00000362091 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.32■■□□□ 1.32
FBXO18-201ENST00000362091 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.3■■□□□ 1.32
FBXO18-201ENST00000362091 NBR1Q14596 966 aa23.3■■□□□ 1.32
FBXO18-201ENST00000362091 NAIPQ13075 1403 aa23.29■■□□□ 1.32
FBXO18-201ENST00000362091 MRS2Q9HD23 443 aa23.28■■□□□ 1.32
FBXO18-201ENST00000362091 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
FBXO18-201ENST00000362091 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.27■■□□□ 1.32
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FBXO18-201ENST00000362091 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.25■■□□□ 1.31
FBXO18-201ENST00000362091 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.24■■□□□ 1.31
FBXO18-201ENST00000362091 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
FBXO18-201ENST00000362091 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
FBXO18-201ENST00000362091 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.24■■□□□ 1.31
FBXO18-201ENST00000362091 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
FBXO18-201ENST00000362091 PRDM2Q13029 1718 aa23.21■■□□□ 1.31
FBXO18-201ENST00000362091 FMN1Q68DA7 1419 aa23.21■■□□□ 1.31
FBXO18-201ENST00000362091 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.31
FBXO18-201ENST00000362091 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.2■■□□□ 1.3
FBXO18-201ENST00000362091 NCOA2Q15596 1464 aa23.19■■□□□ 1.3
FBXO18-201ENST00000362091 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.18■■□□□ 1.3
FBXO18-201ENST00000362091 FOXD1Q16676 465 aa23.17■■□□□ 1.3
FBXO18-201ENST00000362091 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.17■■□□□ 1.3
FBXO18-201ENST00000362091 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.16■■□□□ 1.3
FBXO18-201ENST00000362091 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.15■■□□□ 1.3
FBXO18-201ENST00000362091 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.15■■□□□ 1.3
FBXO18-201ENST00000362091 CCDC7Q96M83 1385 aa23.14■■□□□ 1.3
FBXO18-201ENST00000362091 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.14■■□□□ 1.3
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FBXO18-201ENST00000362091 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
FBXO18-201ENST00000362091 AKNAQ7Z591 1439 aa23.11■■□□□ 1.29
FBXO18-201ENST00000362091 NCOA1Q15788 1441 aa23.09■■□□□ 1.29
FBXO18-201ENST00000362091 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.08■■□□□ 1.28
FBXO18-201ENST00000362091 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.06■■□□□ 1.28
FBXO18-201ENST00000362091 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.06■■□□□ 1.28
FBXO18-201ENST00000362091 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.05■■□□□ 1.28
FBXO18-201ENST00000362091 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.05■■□□□ 1.28
FBXO18-201ENST00000362091 KDM6BO15054 1643 aa23.04■■□□□ 1.28
FBXO18-201ENST00000362091 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.03■■□□□ 1.28
FBXO18-201ENST00000362091 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
FBXO18-201ENST00000362091 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
FBXO18-201ENST00000362091 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.01■■□□□ 1.27
FBXO18-201ENST00000362091 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
FBXO18-201ENST00000362091 HECW1Q76N89 1606 aa22.99■■□□□ 1.27
FBXO18-201ENST00000362091 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.99■■□□□ 1.27
FBXO18-201ENST00000362091 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.98■■□□□ 1.27
FBXO18-201ENST00000362091 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FBXO18-201ENST00000362091 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FBXO18-201ENST00000362091 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FBXO18-201ENST00000362091 NUDCQ9Y266 331 aa22.97■■□□□ 1.27
FBXO18-201ENST00000362091 GRIN2BQ13224 1484 aa22.97■■□□□ 1.27
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