RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 NEUROD1Q13562 356 aa17.15■□□□□ 0.34
HPS1-204ENST00000361490 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.15■□□□□ 0.34
HPS1-204ENST00000361490 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.09■□□□□ 0.33
HPS1-204ENST00000361490 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.08■□□□□ 0.32
HPS1-204ENST00000361490 TRIM52Q96A61 297 aa17.07■□□□□ 0.32
HPS1-204ENST00000361490 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.06■□□□□ 0.32
HPS1-204ENST00000361490 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
HPS1-204ENST00000361490 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.05■□□□□ 0.32
HPS1-204ENST00000361490 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.02■□□□□ 0.32
HPS1-204ENST00000361490 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17■□□□□ 0.31
HPS1-204ENST00000361490 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17■□□□□ 0.31
HPS1-204ENST00000361490 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.99■□□□□ 0.31
HPS1-204ENST00000361490 JPH4Q96JJ6 628 aa16.99■□□□□ 0.31
HPS1-204ENST00000361490 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.99■□□□□ 0.31
HPS1-204ENST00000361490 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
HPS1-204ENST00000361490 KCNH8Q96L42 1107 aa16.97■□□□□ 0.31
HPS1-204ENST00000361490 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
HPS1-204ENST00000361490 GRIN2BQ13224 1484 aa16.93■□□□□ 0.3
HPS1-204ENST00000361490 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HPS1-204ENST00000361490 FMN1Q68DA7 1419 aa16.91■□□□□ 0.3
HPS1-204ENST00000361490 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.91■□□□□ 0.3
HPS1-204ENST00000361490 IFT140Q96RY7 1462 aa16.89■□□□□ 0.29
HPS1-204ENST00000361490 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS1-204ENST00000361490 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.87■□□□□ 0.29
HPS1-204ENST00000361490 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.86■□□□□ 0.29
HPS1-204ENST00000361490 PRDM2Q13029 1718 aa16.85■□□□□ 0.29
HPS1-204ENST00000361490 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
HPS1-204ENST00000361490 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
HPS1-204ENST00000361490 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
HPS1-204ENST00000361490 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
HPS1-204ENST00000361490 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.78■□□□□ 0.28
HPS1-204ENST00000361490 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
HPS1-204ENST00000361490 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.77■□□□□ 0.28
HPS1-204ENST00000361490 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
HPS1-204ENST00000361490 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.76■□□□□ 0.27
HPS1-204ENST00000361490 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.75■□□□□ 0.27
HPS1-204ENST00000361490 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.74■□□□□ 0.27
HPS1-204ENST00000361490 FOXD1Q16676 465 aa16.74■□□□□ 0.27
HPS1-204ENST00000361490 CUL7Q14999 1698 aa16.72■□□□□ 0.27
HPS1-204ENST00000361490 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
HPS1-204ENST00000361490 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HPS1-204ENST00000361490 TSPY4P0CV99 314 aa16.69■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 TSPY10P0CW01 314 aa16.69■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 GRIN2AQ12879 1464 aa16.69■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.68■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 PTPRGP23470 1445 aa16.68■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 TIAM1Q13009 1591 aa16.68■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 IQGAP2Q13576 1575 aa16.66■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.65■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.65■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 WDR62O43379 1518 aa16.65■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.65■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HPS1-204ENST00000361490 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.64■□□□□ 0.25
HPS1-204ENST00000361490 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.25
HPS1-204ENST00000361490 SYNJ2O15056 1496 aa16.63■□□□□ 0.25
HPS1-204ENST00000361490 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.63■□□□□ 0.25
HPS1-204ENST00000361490 NCOA2Q15596 1464 aa16.63■□□□□ 0.25
HPS1-204ENST00000361490 TONSLQ96HA7 1378 aa16.63■□□□□ 0.25
HPS1-204ENST00000361490 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HPS1-204ENST00000361490 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HPS1-204ENST00000361490 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.61■□□□□ 0.25
HPS1-204ENST00000361490 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 ADAMTS12P58397 1594 aa16.57■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.56■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 MIER1Q8N108 512 aa16.56■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.56■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.55■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 OSCARQ8IYS5 282 aa16.54■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 PBRM1Q86U86 1689 aa16.53■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.53■□□□□ 0.24
HPS1-204ENST00000361490 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
HPS1-204ENST00000361490 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.5■□□□□ 0.23
HPS1-204ENST00000361490 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HPS1-204ENST00000361490 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.49■□□□□ 0.23
HPS1-204ENST00000361490 RGL3Q3MIN7 710 aa16.49■□□□□ 0.23
HPS1-204ENST00000361490 WDR97A6NE52 1622 aa16.47■□□□□ 0.23
HPS1-204ENST00000361490 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
HPS1-204ENST00000361490 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.46■□□□□ 0.22
HPS1-204ENST00000361490 DISP1Q96F81 1524 aa16.45■□□□□ 0.22
HPS1-204ENST00000361490 PKD2Q13563 968 aa16.44■□□□□ 0.22
HPS1-204ENST00000361490 PTPRKQ15262 1439 aa16.43■□□□□ 0.22
HPS1-204ENST00000361490 HECW1Q76N89 1606 aa16.42■□□□□ 0.22
HPS1-204ENST00000361490 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
HPS1-204ENST00000361490 CEP170Q5SW79 1584 aa16.41■□□□□ 0.22
HPS1-204ENST00000361490 MAP3K1Q13233 1512 aa16.4■□□□□ 0.22
HPS1-204ENST00000361490 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.39■□□□□ 0.22
HPS1-204ENST00000361490 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
HPS1-204ENST00000361490 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
HPS1-204ENST00000361490 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.38■□□□□ 0.21
HPS1-204ENST00000361490 NUP155O75694 1391 aa16.38■□□□□ 0.21
HPS1-204ENST00000361490 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.38■□□□□ 0.21
HPS1-204ENST00000361490 KIAA0556O60303 1618 aa16.37■□□□□ 0.21
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