RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.07□□□□□ -0.8
LRRTM3-201ENST00000361320 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.06□□□□□ -0.8
LRRTM3-201ENST00000361320 MLECQ14165 292 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM3-201ENST00000361320 TNIKQ9UKE5 1360 aa10.05□□□□□ -0.8
LRRTM3-201ENST00000361320 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
LRRTM3-201ENST00000361320 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.03□□□□□ -0.8
LRRTM3-201ENST00000361320 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 CFTRP13569 1480 aa10□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 GAPVD1Q14C86 1478 aa10□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 HMGXB3Q12766 1538 aa9.99□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.98□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.98□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.98□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa9.98□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 HRCP23327 699 aa9.96□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 PTPRGP23470 1445 aa9.96□□□□□ -0.81
LRRTM3-201ENST00000361320 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM3-201ENST00000361320 GGT6Q6P531 493 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM3-201ENST00000361320 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM3-201ENST00000361320 IGF1RP08069 1367 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRTM3-201ENST00000361320 C14orf37Q86TY3 774 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRTM3-201ENST00000361320 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRTM3-201ENST00000361320 RGL3Q3MIN7 710 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRTM3-201ENST00000361320 TONSLQ96HA7 1378 aa9.91□□□□□ -0.82
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.91□□□□□ -0.82
LRRTM3-201ENST00000361320 FMN1Q68DA7 1419 aa9.9□□□□□ -0.82
LRRTM3-201ENST00000361320 PLEKHG5O94827 1062 aa9.89□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 GRIN2BQ13224 1484 aa9.89□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.89□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 TOPBP1Q92547 1522 aa9.89□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 IFT140Q96RY7 1462 aa9.88□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC24A1O60721 1099 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM3-201ENST00000361320 NEFLP07196 543 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM3-201ENST00000361320 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM3-201ENST00000361320 KIF3BO15066 747 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM3-201ENST00000361320 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
LRRTM3-201ENST00000361320 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
LRRTM3-201ENST00000361320 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.81□□□□□ -0.84
LRRTM3-201ENST00000361320 KANK1Q14678 1352 aa9.8□□□□□ -0.84
LRRTM3-201ENST00000361320 CUX1P39880 1505 aa9.79□□□□□ -0.84
LRRTM3-201ENST00000361320 NEFMP07197 916 aa9.78□□□□□ -0.84
LRRTM3-201ENST00000361320 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
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LRRTM3-201ENST00000361320 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.77□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.77□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 ANP32CO43423 234 aa9.77□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 SYNJ1O43426 1573 aa9.76□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.76□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.75□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 TMC1Q8TDI8 760 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A0G2JS52 829 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 POGKQ9P215 609 aa9.73□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 PKD2Q13563 968 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 FOXD1Q16676 465 aa9.72□□□□□ -0.85
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.71□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.71□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 NUP155O75694 1391 aa9.71□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.7□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 TOP2BQ02880 1626 aa9.69□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.68□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 STK26Q9P289 416 aa9.68□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 AFAP1Q8N556 730 aa9.67□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.67□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 SYNJ2O15056 1496 aa9.66□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 PRDM2Q13029 1718 aa9.65□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 EID1Q9Y6B2 187 aa9.65□□□□□ -0.86
LRRTM3-201ENST00000361320 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.64□□□□□ -0.87
LRRTM3-201ENST00000361320 RAPGEF3O95398 923 aa9.63□□□□□ -0.87
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
LRRTM3-201ENST00000361320 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.62□□□□□ -0.87
LRRTM3-201ENST00000361320 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
LRRTM3-201ENST00000361320 BCL11AQ9H165 835 aa9.62□□□□□ -0.87
LRRTM3-201ENST00000361320 GRIN2AQ12879 1464 aa9.62□□□□□ -0.87
LRRTM3-201ENST00000361320 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.61□□□□□ -0.87
LRRTM3-201ENST00000361320 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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