RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.27■■□□□ 1.64
CSAG1-201ENST00000361211 JPH4Q96JJ6 628 aa25.26■■□□□ 1.63
CSAG1-201ENST00000361211 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CSAG1-201ENST00000361211 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.25■■□□□ 1.63
CSAG1-201ENST00000361211 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.2■■□□□ 1.62
CSAG1-201ENST00000361211 PRXQ9BXM0 1461 aa25.16■■□□□ 1.62
CSAG1-201ENST00000361211 IQGAP2Q13576 1575 aa25.14■■□□□ 1.61
CSAG1-201ENST00000361211 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.08■■□□□ 1.61
CSAG1-201ENST00000361211 EEA1Q15075 1411 aa25.08■■□□□ 1.61
CSAG1-201ENST00000361211 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CSAG1-201ENST00000361211 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.03■■□□□ 1.6
CSAG1-201ENST00000361211 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25■■□□□ 1.59
CSAG1-201ENST00000361211 DISP1Q96F81 1524 aa24.99■■□□□ 1.59
CSAG1-201ENST00000361211 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.97■■□□□ 1.59
CSAG1-201ENST00000361211 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.93■■□□□ 1.58
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA0556O60303 1618 aa24.92■■□□□ 1.58
CSAG1-201ENST00000361211 PTPRGP23470 1445 aa24.91■■□□□ 1.58
CSAG1-201ENST00000361211 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.9■■□□□ 1.58
CSAG1-201ENST00000361211 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CSAG1-201ENST00000361211 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CSAG1-201ENST00000361211 KIF21BO75037 1637 aa24.87■■□□□ 1.57
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGA3Q08378 1498 aa24.8■■□□□ 1.56
CSAG1-201ENST00000361211 UACAQ9BZF9 1416 aa24.76■■□□□ 1.55
CSAG1-201ENST00000361211 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.75■■□□□ 1.55
CSAG1-201ENST00000361211 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.74■■□□□ 1.55
CSAG1-201ENST00000361211 MAPKBP1O60336 1514 aa24.73■■□□□ 1.55
CSAG1-201ENST00000361211 ABCC2Q92887 1545 aa24.73■■□□□ 1.55
CSAG1-201ENST00000361211 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
CSAG1-201ENST00000361211 SAMD9Q5K651 1589 aa24.72■■□□□ 1.55
CSAG1-201ENST00000361211 P3H3Q8IVL6 736 aa24.7■■□□□ 1.54
CSAG1-201ENST00000361211 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.69■■□□□ 1.54
CSAG1-201ENST00000361211 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CSAG1-201ENST00000361211 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.65■■□□□ 1.54
CSAG1-201ENST00000361211 ABCA8O94911 1581 aa24.65■■□□□ 1.54
CSAG1-201ENST00000361211 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.63■■□□□ 1.53
CSAG1-201ENST00000361211 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.63■■□□□ 1.53
CSAG1-201ENST00000361211 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CSAG1-201ENST00000361211 DIP2BQ9P265 1576 aa24.62■■□□□ 1.53
CSAG1-201ENST00000361211 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CSAG1-201ENST00000361211 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.6■■□□□ 1.53
CSAG1-201ENST00000361211 ASXL2Q76L83 1435 aa24.58■■□□□ 1.53
CSAG1-201ENST00000361211 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.56■■□□□ 1.52
CSAG1-201ENST00000361211 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.56■■□□□ 1.52
CSAG1-201ENST00000361211 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.49■■□□□ 1.51
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG1-201ENST00000361211 ARID3CA6NKF2 412 aa24.46■■□□□ 1.51
CSAG1-201ENST00000361211 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CSAG1-201ENST00000361211 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG1-201ENST00000361211 ATP10BO94823 1461 aa24.44■■□□□ 1.5
CSAG1-201ENST00000361211 GLI2P10070 1586 aa24.43■■□□□ 1.5
CSAG1-201ENST00000361211 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CSAG1-201ENST00000361211 TSPOAP1O95153 1857 aa24.39■■□□□ 1.5
CSAG1-201ENST00000361211 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CSAG1-201ENST00000361211 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.33■■□□□ 1.49
CSAG1-201ENST00000361211 FMN1Q68DA7 1419 aa24.32■■□□□ 1.48
CSAG1-201ENST00000361211 KCNH8Q96L42 1107 aa24.3■■□□□ 1.48
CSAG1-201ENST00000361211 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CSAG1-201ENST00000361211 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CSAG1-201ENST00000361211 CLIP1P30622 1438 aa24.27■■□□□ 1.48
CSAG1-201ENST00000361211 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CSAG1-201ENST00000361211 HECW1Q76N89 1606 aa24.25■■□□□ 1.47
CSAG1-201ENST00000361211 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.24■■□□□ 1.47
CSAG1-201ENST00000361211 KDM6BO15054 1643 aa24.22■■□□□ 1.47
CSAG1-201ENST00000361211 CD109Q6YHK3 1445 aa24.2■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.18■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.18■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.17■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.17■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.17■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 CEP162Q5TB80 1403 aa24.16■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.15■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.15■■□□□ 1.46
CSAG1-201ENST00000361211 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CSAG1-201ENST00000361211 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.08■■□□□ 1.45
CSAG1-201ENST00000361211 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
CSAG1-201ENST00000361211 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.07■■□□□ 1.44
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.04■■□□□ 1.44
CSAG1-201ENST00000361211 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CSAG1-201ENST00000361211 KIF14Q15058 1648 aa24.01■■□□□ 1.43
CSAG1-201ENST00000361211 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CSAG1-201ENST00000361211 NEO1Q92859 1461 aa23.96■■□□□ 1.43
CSAG1-201ENST00000361211 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.95■■□□□ 1.43
CSAG1-201ENST00000361211 FANCAO15360 1455 aa23.92■■□□□ 1.42
CSAG1-201ENST00000361211 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.91■■□□□ 1.42
CSAG1-201ENST00000361211 PLCH2O75038 1416 aa23.91■■□□□ 1.42
CSAG1-201ENST00000361211 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.88■■□□□ 1.41
CSAG1-201ENST00000361211 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.88■■□□□ 1.41
CSAG1-201ENST00000361211 AKNAQ7Z591 1439 aa23.88■■□□□ 1.41
CSAG1-201ENST00000361211 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.86■■□□□ 1.41
CSAG1-201ENST00000361211 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.86■■□□□ 1.41
CSAG1-201ENST00000361211 RAPGEF3O95398 923 aa23.85■■□□□ 1.41
CSAG1-201ENST00000361211 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.8■■□□□ 1.4
CSAG1-201ENST00000361211 RICTORQ6R327 1708 aa23.79■■□□□ 1.4
CSAG1-201ENST00000361211 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.79■■□□□ 1.4
CSAG1-201ENST00000361211 PREX2Q70Z35 1606 aa23.79■■□□□ 1.4
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRL1O94910 1474 aa23.79■■□□□ 1.4
CSAG1-201ENST00000361211 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms