RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360448.7

SYTL3-202, Transcript of synaptotagmin like 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SYTL3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3-202ENST00000360448 WDR62O43379 1518 aa25.83■■□□□ 1.73
SYTL3-202ENST00000360448 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
SYTL3-202ENST00000360448 PBRM1Q86U86 1689 aa25.73■■□□□ 1.71
SYTL3-202ENST00000360448 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SYTL3-202ENST00000360448 IFT140Q96RY7 1462 aa25.72■■□□□ 1.71
SYTL3-202ENST00000360448 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.72■■□□□ 1.71
SYTL3-202ENST00000360448 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SYTL3-202ENST00000360448 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.7■■□□□ 1.7
SYTL3-202ENST00000360448 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SYTL3-202ENST00000360448 TIAM1Q13009 1591 aa25.68■■□□□ 1.7
SYTL3-202ENST00000360448 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SYTL3-202ENST00000360448 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SYTL3-202ENST00000360448 GRIN2BQ13224 1484 aa25.63■■□□□ 1.69
SYTL3-202ENST00000360448 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.63■■□□□ 1.69
SYTL3-202ENST00000360448 ITGAEP38570 1179 aa25.62■■□□□ 1.69
SYTL3-202ENST00000360448 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.61■■□□□ 1.69
SYTL3-202ENST00000360448 ADAMTS12P58397 1594 aa25.59■■□□□ 1.69
SYTL3-202ENST00000360448 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.59■■□□□ 1.69
SYTL3-202ENST00000360448 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.57■■□□□ 1.68
SYTL3-202ENST00000360448 MAP3K1Q13233 1512 aa25.57■■□□□ 1.68
SYTL3-202ENST00000360448 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SYTL3-202ENST00000360448 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.51■■□□□ 1.67
SYTL3-202ENST00000360448 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.51■■□□□ 1.67
SYTL3-202ENST00000360448 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.5■■□□□ 1.67
SYTL3-202ENST00000360448 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.48■■□□□ 1.67
SYTL3-202ENST00000360448 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.48■■□□□ 1.67
SYTL3-202ENST00000360448 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SYTL3-202ENST00000360448 SAMD9Q5K651 1589 aa25.45■■□□□ 1.66
SYTL3-202ENST00000360448 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SYTL3-202ENST00000360448 FMN1Q68DA7 1419 aa25.43■■□□□ 1.66
SYTL3-202ENST00000360448 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SYTL3-202ENST00000360448 IQGAP2Q13576 1575 aa25.39■■□□□ 1.65
SYTL3-202ENST00000360448 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SYTL3-202ENST00000360448 GRIN2AQ12879 1464 aa25.35■■□□□ 1.65
SYTL3-202ENST00000360448 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.34■■□□□ 1.65
SYTL3-202ENST00000360448 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SYTL3-202ENST00000360448 FBLN2P98095 1184 aa25.33■■□□□ 1.65
SYTL3-202ENST00000360448 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SYTL3-202ENST00000360448 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.31■■□□□ 1.64
SYTL3-202ENST00000360448 SYNJ2O15056 1496 aa25.28■■□□□ 1.64
SYTL3-202ENST00000360448 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.27■■□□□ 1.64
SYTL3-202ENST00000360448 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.27■■□□□ 1.64
SYTL3-202ENST00000360448 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.26■■□□□ 1.63
SYTL3-202ENST00000360448 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SYTL3-202ENST00000360448 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.23■■□□□ 1.63
SYTL3-202ENST00000360448 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.21■■□□□ 1.63
SYTL3-202ENST00000360448 CEP170Q5SW79 1584 aa25.2■■□□□ 1.63
SYTL3-202ENST00000360448 ARID3CA6NKF2 412 aa25.19■■□□□ 1.62
SYTL3-202ENST00000360448 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.17■■□□□ 1.62
SYTL3-202ENST00000360448 DISP1Q96F81 1524 aa25.15■■□□□ 1.62
SYTL3-202ENST00000360448 NCOA2Q15596 1464 aa25.15■■□□□ 1.62
SYTL3-202ENST00000360448 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.14■■□□□ 1.62
SYTL3-202ENST00000360448 KIAA0556O60303 1618 aa25.13■■□□□ 1.61
SYTL3-202ENST00000360448 MAPKBP1O60336 1514 aa25.12■■□□□ 1.61
SYTL3-202ENST00000360448 NUP160Q12769 1436 aa25.11■■□□□ 1.61
SYTL3-202ENST00000360448 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.08■■□□□ 1.61
SYTL3-202ENST00000360448 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SYTL3-202ENST00000360448 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SYTL3-202ENST00000360448 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
SYTL3-202ENST00000360448 HECW1Q76N89 1606 aa25.07■■□□□ 1.6
SYTL3-202ENST00000360448 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.06■■□□□ 1.6
SYTL3-202ENST00000360448 PTPRKQ15262 1439 aa25.06■■□□□ 1.6
SYTL3-202ENST00000360448 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SYTL3-202ENST00000360448 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.05■■□□□ 1.6
SYTL3-202ENST00000360448 JPH4Q96JJ6 628 aa25.05■■□□□ 1.6
SYTL3-202ENST00000360448 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.01■■□□□ 1.59
SYTL3-202ENST00000360448 MIER1Q8N108 512 aa24.99■■□□□ 1.59
SYTL3-202ENST00000360448 ARHGEF11O15085 1522 aa24.98■■□□□ 1.59
SYTL3-202ENST00000360448 NEUROD1Q13562 356 aa24.97■■□□□ 1.59
SYTL3-202ENST00000360448 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.96■■□□□ 1.59
SYTL3-202ENST00000360448 CHD1O14646 1710 aa24.95■■□□□ 1.59
SYTL3-202ENST00000360448 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.94■■□□□ 1.58
SYTL3-202ENST00000360448 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.93■■□□□ 1.58
SYTL3-202ENST00000360448 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SYTL3-202ENST00000360448 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SYTL3-202ENST00000360448 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.9■■□□□ 1.58
SYTL3-202ENST00000360448 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.9■■□□□ 1.58
SYTL3-202ENST00000360448 HFM1A2PYH4 1435 aa24.89■■□□□ 1.58
SYTL3-202ENST00000360448 NAIPQ13075 1403 aa24.87■■□□□ 1.57
SYTL3-202ENST00000360448 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.85■■□□□ 1.57
SYTL3-202ENST00000360448 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SYTL3-202ENST00000360448 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SYTL3-202ENST00000360448 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SYTL3-202ENST00000360448 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SYTL3-202ENST00000360448 UACAQ9BZF9 1416 aa24.77■■□□□ 1.56
SYTL3-202ENST00000360448 MIA2Q96PC5 1412 aa24.75■■□□□ 1.55
SYTL3-202ENST00000360448 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SYTL3-202ENST00000360448 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SYTL3-202ENST00000360448 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SYTL3-202ENST00000360448 ABCA8O94911 1581 aa24.72■■□□□ 1.55
SYTL3-202ENST00000360448 KDM6BO15054 1643 aa24.71■■□□□ 1.55
SYTL3-202ENST00000360448 PTPRGP23470 1445 aa24.7■■□□□ 1.55
SYTL3-202ENST00000360448 SHROOM2Q13796 1616 aa24.68■■□□□ 1.54
SYTL3-202ENST00000360448 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SYTL3-202ENST00000360448 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.66■■□□□ 1.54
SYTL3-202ENST00000360448 TRIM52Q96A61 297 aa24.66■■□□□ 1.54
SYTL3-202ENST00000360448 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.66■■□□□ 1.54
SYTL3-202ENST00000360448 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SYTL3-202ENST00000360448 MYT1Q01538 1121 aa24.65■■□□□ 1.54
SYTL3-202ENST00000360448 ATP10BO94823 1461 aa24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms